专利名称：作为胃肠癌的标记的ykl-40的制作方法
技术领域：
本发明涉及对受试者胃肠癌的严重性进行分类，为其选择疗法和/或在施行治疗之前、期间和之后监测该疾病进展的方法，其中^(L-40的预定水平高于参考水平表明需要施行治疗。受试者可能患有任何一种或多种胃肠癌。本发明进一步涉及可用于本发明方法的试剂盒和装置，其包括用于测量样品中的IL-40水平的工具；以及将测量的IL-40水平与至少一个IL-40参考水平进行比较的工具。
背景技术：
胃肠(GI)道的癌症是欧洲和美国最常见的一些癌症。遗憾的是，上GI癌和下GI 癌直到该疾病的自然史晚期仍然是相对无症状的。上GI癌症状通常是非特异的，并且到出现“警报症状”如吞咽困难、腹痛、呕吐、体重减轻或贫血时，癌症通常处于晚期阶段并且预后不佳。因此，改善早期阶段的生存诊断是极其重要的。在过去二十年期间，上胃肠(GI)癌患者的治疗并没有像大肠癌的治疗那样取得同样的积极进展。胰腺癌是美国男性和女性中癌症死亡中第四种最常见的原因，2008年估计死亡约34，000人。胃癌的发生率在美国和西欧是下降的(1-3)，并且估计2008年美国死亡10，880人(1)。胆囊癌和其他肝外胆管癌的发生率没有变化，估计2008年美国这种类型的癌症死亡3，340人(1)。手术是上GI癌唯一可能的治愈疗法。主要问题在于85%的胰腺癌患者在诊断时已经是局部晚期或转移性疾病，而且他们的平均存活时间仅为6个月，并且< 10%可活过 1年。对于胃癌和胆管癌患者，目前有向更好生存发展的趋势，因为更多患者在诊断时处于低级阶段，手术成功的机会也更高，然而还是< 50%活过一年(以及活过5年，US) (1-3)。不能手术根除的患者的治疗选择是缓和性的放射或化学疗法，但应答率很差(4-6)。对给定的胃肠癌施行治疗典型地是基于疾病的诊断，偶尔基于疾病的严重性，而不管患有具体类型的胃肠癌个体的生理机能。同样地，胃肠癌的继续治疗和监测通常是按照预定的时间表进行，而不大会关注个体患者。虽然将来可能有更有效的化疗方案或新的生物疗法，但改善上GI癌患者生存的最好方式是在较早阶段诊断患者。鉴定新的生物标记在此方向上迈出的一步。单一的标记或方法有助于在施行给定的疗法之前、期间或之后，在不同效率的疗法之间进行选择和/或监测进展或确定胃肠癌的阶段，这将会大大改善当前发生的这些选择以及监测过程的便利性。糖类(CA) 19-9是胰腺癌患者中唯一常规使用的生物标记，但对于筛选或确定可手术性并没有价值，并且CA19-9对胃癌或胆管癌患者是无用的。血清CA19-9在70-80%的胰腺癌患者中是升高的，在转移性疾病中最高，并且高血清CA19-9与短期生存相关(7，8)。 然而，10-20%的良性胰腺疾病患者也有升高的血清CA19-9。推荐在治疗开始时以及治疗期间每1-3个月，测量局部晚期转移性胰腺癌患者的血清CA19-9。血清CA19-9的升高可反映进展情况，并且应使用例如计算机断层扫描来确认(7，8)。
与选择尽可能最佳疗法相关的优势不局限于对患有胃肠癌的个体的健康有利；它也有利于个体和医院的经济情况/社会总体的经济情况。已知某些标记与特定的癌症类型相关；此类实例包括HER2，它是某些形式的乳腺癌的标记；以及EGFR，它与例如大肠癌、胰脏癌、头颈癌、肺癌以及多形性成胶质细胞瘤相关。西妥昔单抗(Erbitux )是抗表皮生长因子受体(EGFR)的嵌合小鼠/人单克隆抗体，并被批准用于转移性大肠癌和头颈部鳞状细胞癌患者。西妥昔单抗是每周(首剂量 400mg/m2，其后每周250mg/m2)或每两周(首剂量400mg/m2，其后每两周500mg/m2)以静脉注射给药，作为单一疗法或者与标准化疗例如伊立替康、奥沙利钼和氟尿嘧啶(5-FU)结合用于转移性大肠癌，与亚叶酸结合或者与放射疗法结合用于直肠癌或头颈部鳞状细胞癌患者(1-19)。潘尼单抗(Vectibix . )是抗EGFR的全人单克隆抗体，并被批准用于转移性大肠癌患者。潘尼单抗每两周以静脉注射给药(6mg/kg)，作为单一疗法或者与转移性大肠癌的标准化疗结合(9，20-23)。最近的数据表明，用西妥昔单抗和潘尼单抗治疗患转移性大肠癌且Kirsten ras (KRAS)基因有突变的患者没有效果。KRAS编码的蛋白质是小GTPA酶超家族的一员， KRAS基因中的单个氨基酸替换产生激活突变。从2008年夏天，仅推荐用西妥昔单抗和潘尼单抗治疗KRAS野生型大肠癌患者。所有大肠肿瘤中约30%至45%存在KRAS突变，产生组成型激活的EGF信号通路(6-9 11，12，13，14，21，24，25，26)。将KRAS鉴定为应答抗-EGFR 疗法的预测生物标记具有明显的好处。首先，将有近半数转移性大肠癌患者免受不必要的无效治疗，这些治疗可能产生明显的毒性。其次，对保健系统的潜在的成本节约是意义深远的，美国每年约为$6亿(用西妥昔单抗治疗8周花费约$19，000)。然而，KRAS突变并非影响抗-EGFR抗体的唯一因素。约25%至40%的KRAS野生型患者对抗-EGFR抗体无应答。这些患者中约10%具有BRAF基因突变。这引起BRAF蛋白的变化，其可以增加癌细胞的生长和扩散。BRAF是RAF的异构体。RAF蛋白是细胞增殖通路中RAS和MARK的中间体。RAF蛋白典型地由RAS经磷酸化作用激活，并且激活的RAF蛋白接下来经磷酸化作用激活MARK。此外，一些KRAS野生型患者具有肿瘤抑制基因PTEN的蛋白表达的缺失，而有些具有低表达的双调蛋白(AREG)或上皮调节蛋白(EREG)，并且这些患者对西妥昔单抗应答较少(9，12，沈，27，观，29)。这些最近的研究需要加以确证，因此尚未推荐在用西妥昔单抗或潘尼单抗治疗之前，测试BRAF突变或者PTEN、AREG或EREG的表达。即使使用KRAS和例如BRAF 二者来预测对这种治疗的应答，仍然有约40%的KRAS野生型患者对该治疗没有应答06，四)。因此预测性生物标记的鉴定势必改善GI癌患者的选择，例如用抗EGFR抗体治疗或者用其他生物药剂如抗VEGF抗体治疗转移性大肠癌。GI癌的理想生物标记应该具有能够在早期阶段鉴定患者的特质，并且帮助外科医生选择适合的患者进行手术。该生物标记还可用于在手术或化疗后监测疾病复发/进展， 并且帮助肿瘤专家评估化疗的效果，以便给出更加个体化的治疗。还没有针对GI癌尤其是上GI癌患者的这种生物标记。对各个胃肠癌个体患者施行最佳可能的治疗将改善任何治疗的效力，不管它涉及施予药物、手术还是其它，并且不管给定的治疗是预防、治愈还是改善。根据生存预后和进展时间对患有胃肠癌的个体进行分类，将有助于确定最佳可能的疗法、改善施行的治疗的效果，改善生存率，降低复发风险，并且提高胃肠癌发病后的生活质量。同样地，对根据疾病的进展和/或状态施予任何个体患者的治疗进行监测，将有助于确定最有效的即时和跟进治疗，并且在辅导例如胃肠癌发生之后需要的生活方式机会时具有指导性。

发明内容
本发明涉及一种对受试者的胃肠癌进行诊断和/或分类严重性和/或确定疗法和 /或监测治疗处理的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和
ii)将所述IL-40水平与IL-40参考水平进行比较；其中样品中的IL-40水平高于参考水平表明存在胃肠癌和/或从所述比较推出所述癌症的严重性和/或通过所述比较推出所述癌症的进展和/或状态，和/或在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法。例如，一个或多个IL-40参考水平可以是通过从健康个体的样品测量IL-40水平而获得的^(L-40单个参考水平或一组参考水平，如一个或多个参考水平。优选地该参考水平是健康个体中IL-40的第95个(95th)百分位数。因此本发明的第一方面涉及一种诊断受试者中胃肠癌的存在的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个年龄校正的IL-40参考水平进行比较；其中样品中的IL-40水平高于参考水平表明存在胃肠癌。此外，本发明的第二方面涉及一种分类受试者中胃肠癌的严重性的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个年龄校正的IL-40参考水平进行比较；其中样品中的IL-40水平高于一个或多个参考水平表明所述胃肠癌严重。此外，本发明的第三方面涉及一种确定受试者中胃肠癌疗法的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较；在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法。此外，本发明的第四方面涉及一种监测受试者中胃肠癌的治疗处理的方法，治疗处理优选地选自化疗药剂、生物药剂、放射疗法及其结合；胃肠癌优选地为上胃肠癌；所述受试者是针对特定疾病进行治疗；所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较；其中IL-40水平相对于一个或多个参考水平(比较)表明所述胃肠癌的进展和/或状态，由此表明当前进行的治疗处理的有效程度；以及iii)在此基础上确定胃肠癌的治疗处理是否要继续、终止或替换。本发明的进一步方面涉及一种为患有上胃肠癌且正用治疗处理进行治疗的受试者确定预后的方法，治疗处理选自化疗药剂、生物药剂、放射疗法及其结合，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较；其中^(L-40水平相对于参考水平表明所述胃肠癌在特定治疗方案期间或之后的发展或进展，并由此表明预后。本发明的再另一方面涉及一种确定受试者胃肠癌的治疗效果的方法，所述方法包括i)测定在一段时间的治疗后从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与来自相同受试者的一个或多个先前测定的IL-40水平进行比较；当步骤i)的IL-40水平低于或等于步骤ii)中的一个或多个先前水平，表明所述治疗有应答，或者步骤i)的^^-40水平高于步骤ii)中的一个或多个先前水平，表明所述受试者可能对所述治疗无应答。所述参考水平在本发明上述四个方面的一种实施方式中是从相同受试者获得的参考水平，因此一组实施方式涉及以下一种对受试者的胃肠癌进行诊断和/或分类严重性和/或确定疗法和/或监测治疗处理的方法，所述方法包括 i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与IL-40参考水平进行比较，所述参考水平是来自相同受试者的先前测定的^(L-40水平；其中样品中的IL-40水平高于参考水平表明存在胃肠癌和/或从所述比较中推出所述癌症的严重性和/或通过所述比较推出所述癌症的进展和/或状态，和/或在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法。上述方法可任选地涉及实施方式胃肠癌是上GI癌，例如食管癌、胃癌、胰腺癌和 /或胆管癌；最优选地上GI癌是胰腺癌。或者，上述方法还涉及实施方式胃肠癌是下GI癌，例如小肠癌、十二指肠癌、阑尾癌、结肠癌、直肠癌、大肠癌和/或肛门癌；最优选地下GI癌是大肠癌。本发明的第三和第四方面的具体实施方式
涉及在手术后或者用化疗药剂、放射治疗或生物制品(即生物药剂)治疗期间监测胃肠癌。更具体的实施方式涉及在用化疗药剂治疗期间监测胃肠癌。本发明进一步包括第五方面，其涉及一种为受试者的胃肠癌确定疗法和/或监测治疗处理的装置，其中该装置包括用于测量样品中的IL-40水平的工具；以及将该测量的 YKL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较的工具。此外，本发明包括第六方面，其涉及一套试剂盒，包括i)用于测量样品中的 YKL-40水平的工具；ii)用于将测量的IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较的工具；以及iii)如何根据提供样品的受试者的年龄对^^-40参考水平进行年龄校正的说明书。


图1 依据年龄和性别的2116名健康女性和1494名健康男性中IL-40的血浆浓度。参与者在1991-1994年血液采样时未患已知的疾病，并且在16年追踪期间保持健康(即，没有人死亡或患癌症、缺血性心血管疾病、肝脏疾病、糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、 哮喘、风湿性关节炎、炎性肠病和肺炎)。这些健康参与者的中值血浆IL-40是42 μ g/ 1(2.5% -97. 5%百分位数范围14-168 μ g/L ；90 %百分位数92 μ g/L ；95%百分位数 124 μ g/L)。血浆IL-40水平在两种性别中都随年龄增加而增加(趋势检验ρ < 0. 0001)。 血浆IL-40与年龄之间的spearman' s rho相关性是0. 41 (ρ < 0. 0001)。女性和男性的血浆 YKL-40 之间没有差异(Mann-Whitney U ;p = 0. 27)。图2 929名健康参与者组063名女性和466名男性)中IL-40的血浆浓度，从他们1991-1994年检查的血液中进行第一次IL-40测定，并且从2001-2003年检查的血液中进行第二次IL-40测定。平均增加在女性中为0.5yg/L/年(内四分位间距-0. 6-2. 1 μ g/ L/年)，在男性中为0.8 μ g/L/年(-0. 3-2. 9 μ g/L/年)。这说明血浆IL-40在保持健康的受试者中是非常稳定的，并且计算得回归稀释比率为0. 8042。男性和女性之间没有统计学差异。图3A 在2116名健康女性和1494名健康男性中测定IL-40的血浆浓度。参与者在1991-1994年血液采样时未患已知的疾病，并且在16年追踪期间保持健康(即没有人死亡或者患癌症、缺血性心血管疾病、肝脏疾病、糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、风湿性关节炎、炎症性肠病和肺炎)。这些图显示了这些健康参与者中依赖于年龄的50%百分位数血浆IL-40(圆圈)，70%百分位数(定义为In(血浆IL-40) = 3. 1+0. 02X年龄(岁))， 75%百分位数(定义为In (血浆IL-40) = 3. 2+0. 02 X年龄(岁))，90 %百分位数(定义为In(血浆IL-40) = 3. 5+0. 02X年龄(岁))，以及95%百分位数(定义为In(血浆 YKL-40) = 3. 6+0. 02X年龄(岁))。男性和女性合并。图:3B 与图3A对应，另外的血浆IL-40的百分位数85 %百分位数(定义为 In (血浆YKL-40) = 3. 4+0. 02 X年龄(岁))和97. 5 %百分位数(定义为h (血浆YKL-40) =3. 9+0. 02X 年龄(岁))。图4A —般人群的依据IL-40的血浆浓度增加的寿命和存活(分成5个等级和 10岁年龄百分位数类别0-33%百分位数、34-66%、67-90%、91-95%和96-100% )。下面的时间刻度分别为左截断年龄和追踪时间。追踪从血液采样时开始，以死亡或者2007年7 月为结束，以先到的为准。将男性和女性合并。为进行比较，显示了相同人群中吸烟状态的影响。图4B 依据血浆IL-40百分位数类别、吸烟状态、性别和年龄的绝对10年死亡率。基于哥本哈根市心脏研究1991-1994年检查并追踪16年的8899名参与者。P值用于检验对数秩趋势。从左至右给出了< 50岁、50-70岁和> 70岁的各年龄组的血浆IL-40 百分位数类别 0-33%、34-66%、67-90%、91-95%和 96-100%。图5 :16名健康受试者的IL-40血清浓度的个体日变化。
图6 38名健康受试者为期3周的血清IL-40水平的个体变化。图7 23名受试者在4轮为期3周的测试中每轮得到的中值血清IL-40水平(每一条表示每一轮每个受试者的中值)。图8 :30名健康女性为期4周采样的个体血清IL-40水平，其中21名女性3年后
重复进行。图9 =A,转移性上GI癌患者(n = 70)和健康受试者(n = 234)的个体血浆IL-40 水平。B，局部上GI癌患者(η = 40，三角形)、转移性上GI癌(n = 70，白色圆圈)、慢性胰腺炎(n = 65，朝上的三角形)和健康受试者(n = 234，灰色圆圈)的个体血浆IL-40水平。Y轴为对数标尺。图10 显示转移性上胃肠癌患者中基线血浆IL_40(即治疗前的血浆IL-40水平)与总生存之间的关系的Kaplan-Meier生存曲线。将血浆IL-40水平分为三分位数。 P值指同等阶层的对数秩检验。图11 显示转移性上胃肠癌患者中基线以及化学疗法治疗期间的血浆IL-40的箱形图。Y轴为对数标尺。图12 显示转移性上胃肠癌患者中化疗4周后的血浆IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。将血浆IL-40水平分为三分位数。P值指同等阶层的对数秩检验。图13 显示局部胰腺癌患者中放化疗结束后4-6周的血浆IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。根据与基线水平相比的增加或减小/无变化，将血浆 YKL-40水平分成两部分。图14:显示局部晚期胰腺癌患者中化放疗结束后4-6周收集的样品中的血浆 YKL-40比率(C0RGI研究)与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。该比率计算为治疗结束4-6周后IL-40水平比IL-40基线水平(即治疗前水平)。上面的曲线是低比率组，下面的曲线是高比率组。P值指同等阶层的对数秩检验。图15 显示转移性胰腺癌患者中化疗开始后4周收集的样品中的血浆IL-40比率(GITAC研究)与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。该比率计算为治疗4周后 IL-40水平比IL-40基线水平(即治疗前水平)。上面的曲线是低比率组，下面的曲线是高比率组。P值指同等阶层的对数秩检验。图16 显示每两周用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者中治疗前血浆IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。血浆IL-40水平分为三分位数。上面的曲线是最低^(L-40水平的三分位数，中间的曲线是中位^(L-40水平的三分位数，底部的曲线是最高^(L-40水平的三分位数。P值指同等阶层的对数秩检验。图17A和17B 如图上所见的试纸实施方式。试纸支撑材料(1)有供生物材料使用的分析区域( 和一个对照或标准区域(图17A中幻或者多个对照或标准区域(图17B 中如至如)。单个C3)或多个(每个区域有一个浓度，例如，以增加或减小排序HKL-40浓度可加到对照或标准区域，以便能够用图17A中描述的试纸读取正/负结果，或者与测试后样品/分析区域最接近的，图17B中对照区域的IL-40浓度比较，评估生物样品中IL-40 的大致浓度。图18 研究2,显示用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移件大肠癌患者中治疗前血清IL-40水平与无进展生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。P值指同等阶层的对数秩检验。将患者根据他们的治疗前血清观1^40水平划分为三分位数。组3的患者有最高的血清IL-40水平。血清IL-40 组1 :< 94μ g/Ι ；组2 彡94且彡253 μ g/Ι ；和组3 > 253μ g/L·图19 研究1，显示用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者中治疗前血浆IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线(19A)。P值指同等阶层的对数秩检验。将患者根据他们的治疗前血浆观1^40水平分为三分位数。组3的患者有最高的血浆IL-40水平。血浆IL-40 组1 :< 84μ g/Ι ；组2 84且彡218μ g/Ι ；和组3 :> 218μ g/1。Ml显示用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者中治疗前血清 IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线(19B)。P值指同等阶层的对数秩检验。将患者根据他们的治疗前血清IL-40水平分为三分位数。组3的患者有最高的血清 IL-40 水平。血清 IL-40 组 1 :<94yg/l ；组 2 彡 94 且彡 253 μ g/1 ；和组 3 > 253 μ g/ 1。 图20 研究1,显示根据KRAS状态，用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者中治疗前血浆IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线QOA 野生型； 图20B:突变)。P值指同等阶层的对数秩检验。将患者根据他们的治疗前血浆观1^40水平分为三分位数。组3的患者有最高的血浆IL-40水平。血浆IL-40 组1 :< 84 μ g/Ι ； 组 2 彡 84 且彡 218 μ g/Ι ；和组 3 :> 218 μ g/1。研究2,显示用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者治疗前血清 IL-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线QOC 野生型；图20D 突变)。P值指同等阶层的对数秩检验。将患者根据他们的治疗前血清^^-40水平分为三分位数。组3 的患者有最高的血清IL-40水平。血清IL-40 组1 :<94yg/l ；组2 彡94且彡253yg/ 1 ；和组 3 > 253 μ g/1。图21 研究1，显示根据健康受试者中(年龄校正的)血浆IL-40的临界水平的增加，用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者治疗前血浆^(L-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。图21A 90百分位数；图21B 95百分位数；图21C 97. 5百分位数；图21D 99百分位数；图21F :99. 5百分位数；以及图21F :99. 9百分位数。 P值指同等阶层的对数秩检验。图22 研究2，显示根据健康受试者中(年龄校正的)血清IL-40的临界水平的增加，用依立替康和西妥昔单抗治疗的转移性大肠癌患者治疗前血清^(L-40水平与总生存之间的关系的Kaplan-Meier曲线。图22A 90百分位数；图22B 95百分位数；图22C 97. 5百分位数；图22D 99百分位数；图22F :99. 5百分位数；以及图22F :99. 9百分位数。 P值指同等阶层的对数秩检验。图23A-B:在用西妥昔单抗和依立替康治疗期间，转移性大肠癌患者中 YKL-40 ( μ g/1)的个体变化。A显示研究1的结果，B显示研究2的结果。图24A-B 在用西妥昔单抗和依立替康治疗期间，转移性大肠癌患者中IL_40 (比率)(计算/定义为治疗期间不同时间点的水平除以基线水平=治疗前水平)的个体变化。 A显示研究1的结果，B显示研究2的结果。
图25A-B 无进展生存(A)和总生存(B)的Kaplan-Meier曲线，显示转移性大肠癌患者中用西妥昔单抗开始治疗后2-3个月收集的血液样品中的^(L-40与基线^(L-40水平相比较的比率之间的关系(该比率计算/定义为治疗2-3个月后的^(L-40水平除以基线水平=治疗前水平)。低比率(彡1)反映与治疗前相比，2-3个月时的IL-40减小。高比率(> 1)反映与治疗前相比，2-3个月时的^(L-40增加。P值指同等阶层的对数秩检验。 将患者分为高或低比率两组。发明详细说明本发明人意外地发现JKL-40水平可以用作生物标记，基于测定的IL-40水平与一个或多个^(L-40参考水平的比较，为受试者的胃肠癌确定疗法和/或监测受试者的胃肠癌的治疗处理。本发明人进一步发现，YKL-40水平可用作跟踪胃肠癌的发展以及相应的患者预后的标记，即胃肠癌是否向疾病的更严重或较缓和的阶段发展，因此反复地和/或继续地分类胃肠癌随时间推移的严重性，并由此可以确定是否继续当前进行的治疗、以更高效或低效的治疗替换该治疗或者简单地改变当前治疗的施行、以及终止当前的治疗是否是明智的。在本发明的一种实施方式中，这在受试者中^(L-40测量与先前从相同受试者中测量获得的一个或多个参考水平比较时是相当有意义及可行的。因此，通过根据本发明的方法， YKL-40水平不仅可以用于在受试者中测定的IL-40水平基础上确定施行何种治疗，而且可以通过受试者中^(L-40水平的监测或^(L-40水平的发展来确定继续进行何种治疗。此外，本发明公开了 IL-40水平可以用作指示胃肠癌的存在的生物标记。因此， 根据本发明的方法，YKL-40水平可以用于诊断胃肠癌的存在。本发明的方法提供了一种与胃肠癌和/或其治疗相关的^(L-40水平形式的新的通用生物标记。因此，进一步想到，本发明的方法可用作与个性化医疗中的相伴诊断测试相关的诊断工具。例如，这可能与观1^40配体、或用于治疗胃肠癌的其他类型的化合物有关， 或者尤其与以下进一步描述的如EGFR配体等生物药剂有关。提供以下定义以简化本发明的讨论。因此，它们不应解释为对本发明的限制，本发明通过所附的权利要求书和说明书全文来限定范围。本文使用的术语“胃肠癌”、“GI癌”、“疾病”和“紊乱”用于表示任意胃肠癌，例如但不限于上GI癌，例如但不限于食管癌、胃癌、胰腺癌和/或胆管癌；下GI癌，例如但不限于小肠癌、十二指肠癌、阑尾癌、结肠癌、直肠癌、大肠癌和/或肛门癌；以及其他GI癌，例如但不限于GIST、腹膜癌和/或肝癌。除非特别说明，所述胃肠癌可以是局部的或其转移变体。相同疾病的患者在疾病严重性方面可能有明显差异(即疾病严重的等级不同)。 本文使用的术语“严重阶段”、“严重性”、“较缓和”和“更严重”用于表示严重性的分级，例如根据治愈的预后、生存预后，或者根据不同的预先确定的疾病阶段。这些阶段可以取决于不同的症状和/或传统的可测量的生物标记水平、生理功能等。当集中研究一个和相同受试者的疾病进展时，更严重的阶段指疾病的恶化；反之，与先前确定的相比，较缓和的阶段指病情的好转，例如由于有令人满意的治疗方案。例如，所述阶段可进一步与局部vs转移性胃肠癌有关。因为患者的预后可能与所讨论的疾病的传统阶段无关，本文使用的术语“更严重的阶段”和“较缓和的阶段”也分别用于表示患者预后的恶化或好转。对于患胃肠癌疾病的患者，预后典型地是涉及进展前的预期时间、或死亡前的时间的预后。因此，预后的恶化典型地对应于更短的生存期。术语“确定疗法和/或治疗处理”、“确定疗法”和“确定治疗处理”原则上涵盖本领域技术人员可向受试者所施予的任何治疗的确定，该受试者已经确定了 ^(L-40水平并且将其与一个或多个参考水平进行比较。优选地，该术语涵盖最佳疗法和/或治疗的确定。 由此表示，该治疗从以下任意方面来说最适于个体患者的最佳治疗改善不适、缓解症状、 治愈疾病、为受试者提供最佳可能的生活质量等。术语“疗法”、“多种疗法”、“治疗处理”和 “治疗”在本文中可互换使用。与疗法和/或治疗处理有关的术语“最佳可能的”、“最佳的” 等在本文中可互换使用。要启动、继续、终止、改变或替换的疗法和/或治疗处理可以是任意类型的疗法， 例如但不限于施予药物和/或外科手术，并且可能是预防的、治愈的或改善的。疗法和/或治疗处理，如果当前没有进行则可以开始，或者如果已经在进行则可以继续。如果发现不适合或者如果需要被其他可选的方法和/或治疗处理替换，则该疗法和/或治疗处理可以终止。改变治疗理解为治疗变化，例如剂量增加或减少、药物浓度增加或减少、给药/剂量方案增加或减少等。本文使用的术语“改善，，用于表示改进或者变得更好；与疾病状态相关，疾病状态的严重或进展的缓解，包括它的减轻或治愈，或者感觉到的严重性的缓解，例如相关疼痛的缓解。本文使用的术语“抗体”用于表示免疫球蛋白分子及免疫球蛋白分子的活性部分或片段，如Fab和F (ab' )2，它们能够与IL-40蛋白的表位决定簇结合。例如，抗体是完整的免疫球蛋白分子或保留该免疫活性的片段。抗体的一个实例是西妥昔单抗，它是一种抗表皮生长因子受体(EGFR)的单克隆抗体。本文使用的术语“抗原”用于表示免疫原性的全长IL-40分子或者其片段。本文使用的术语“生物样品”用于表示从受试者或个体获得的样品。本文使用的术语“生物标记”用于表示特定生物学性质如病理或生理状态的分子指示剂。本文使用的术语“受试者”和/或“个体”用于表示一种物种的单个成员，本文优选地表示哺乳动物物种。本文使用的术语“哺乳动物”包括人类和非人类。本文使用的术语“患者”用于表示患有胃肠癌的任意个体。本文使用的术语“hnRNA”表示异核RNA。本文使用的术语“mAb”表示单克隆抗体。 本文使用的术语“mRNA”表示信使RNA。本文使用的术语“RNA”表示从天然或合成源分离的任意类型的RNA。本文使用的术语“基本上纯的”用于描述IL-40，指基本完整的分子，其本质上不包含可能天然地与IL-40同时出现的其他分子。本文使用的与受试者相关的术语“接受化疗的”指先前没有针对他们存在的胃肠癌疾病使用一种或多种化疗剂治疗的受试者。本文使用的术语“治疗前水平(pre-treatment level) ”，例如与IL-40水平相关，用于表示治疗开始前在受试者中测量的水平，例如^(L-40水平，开始治疗是指例如开始特定的治疗，一种特定治疗变为另一种治疗方案，或者在现有的治疗方案上增加新的治疗，但不限于此。例如，受试者先前已经用化疗药剂治疗，则治疗前水平是指开始用新的化疗药剂和/或生物药剂前的水平。此外，例如在实施例中，治疗前水平还可称为“基线”水平。本文使用的与化学疗法或生物疗法相关的术语“治疗前的”、“预治疗的”、“一线”、 “二线”和“三线”等，用于表示针对所讨论的特定胃肠癌，受试者先前或目前正在用化疗剂或生物药剂治疗。例如，用一线化疗剂预治疗的受试者指对于局部晚期或转移性癌症，首次用化疗剂治疗的受试者。同样地，用二线化疗剂治疗的受试者指对于局部晚期或转移性癌症，先前用一种其他不同的化疗方案和任选地用生物药剂治疗的受试者。同样地，用三线化疗剂治疗的受试者指针对局部晚期或转移性癌症，先前用两种其他不同的化疗方案和任选地用生物疗法治疗的受试者。因此，受试者在他们所患癌症疾病的治疗期间，接受过或正在接受用化疗药剂治疗。本文的术语“治疗前的”和“预治疗的”可互换使用。本发明涉及一种对受试者中胃肠癌进行诊断和/或分类严重性和/或确定治疗和 /或监测治疗处理的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与IL-40参考水平进行比较；其中样品中的IL-40水平高于参考水平表明存在胃肠癌和/或从所述比较中推出所述癌症的严重性和/或通过所述比较推出所述癌症的进展和/或状态，和/或在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法。此外，本发明方法的更具体的方面将在下文详细描述，尤其是在涉及不同方面的部分。本发明方法的一种实施方式涉及一种为受试者的胃肠癌确定疗法和/或监测受试者的胃肠癌的治疗处理的方法，所述方法包括i)确定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较；其中IL-40水平相对于参考水平表明所述胃肠癌的进展和/或状态；以及iii)通过所述比较推出所述胃肠癌的进展和/或状态，并且在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法。在本发明方法的一些实施方式中，所述一个或多个^(L-40参考水平是来自相同受试者的一个或多个先前测定的^(L-40水平。因此，本发明上述方法的更具体的实施方式涉及一种为受试者的胃肠癌确定疗法和/或监测受试者的胃肠癌的治疗处理的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较；所述参考水平是来自相同受试者的一个或多个先前测定的^(L-40水平，其中^(L-40水平相对于参考水平表明所述胃肠癌的进展和/或状态；以及iii)通过所述比较推出所述胃肠癌的进展和/或状态，并且在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法，其中样品中的IL-40水平与IL-40参考水平相比增加到至少1. 10倍，表示胃肠癌已经发展到该胃肠癌的更严重阶段，并且例如，因此需要开始高效的治疗和/或需要开始比当前进行的治疗更高效的治疗，例如^(L-40增加可能表明受试者对目前的治疗方案无应答，那么该方案可能被终止和/或用其他治疗方案替换；以及其中样品中的IL-40水平与^(L-40参考水平相比至少减小到0. 90倍，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的较缓和阶段，并且例如，该受试者已经对治疗有应答，因此该治疗可继续。本发明的方法涉及对任意胃肠癌(例如任意一种或多种疾病或紊乱)的严重性进行分类，以便确定其最佳可能的治疗。例如，所述疾病或紊乱可能是引起YKL-40水平增加的任意疾病或紊乱。至于本发明的方法，当一个或多个参考水平是来自相同受试者的一个或多个先前测定的IL-40水平，那么胃肠癌可能在测量该先前测定的IL-40水平之前、期间或之后已经被确诊；在优选的实施方式中，胃肠癌是先前诊断的胃肠癌。本发明的进一步目的是提供一种监测患一种或多种疾病或紊乱的个体的健康状态的方法，以便针对它们的生存预后确定最佳可能的治疗，所述方法包括测量来自所述个体的生物样本中的IL-40水平；以及将该测量水平与IL-40参考水平进行比较。已经发现，个体的血清或血浆IL-40水平在很长时间都是稳定的，并且不受每日和每周变化的影响；此外还发现该水平不受至少20分钟锻炼的影响。因此，个体中血清或血浆IL-40水平的一次测量可以用于本发明的方法。优选地，样品可从受试者获得，例如先前已经戒除酗酒的受试者以及例如没有明显的症状(如细菌感染)的受试者。如果需要， 可在后来的时间点(例如2周后)获得第二份或另外的样品，以确认第一次测定的IL-40 水平的结果。本发明的方法可以用于分类那些也可通过CRP来鉴定和/或分类的疾病的严重性，但是也可以用于分类那些对CRP水平不产生应答的疾病。因此，在本发明的一种实施方式中，胃肠癌是一种或多种疾病或紊乱或一组疾病或紊乱，其并不总是产生升高的C-反应性蛋白水平。本文上述的方法任选地涉及一些实施方式，其中胃肠癌是上GI癌，例如食管癌、 胃癌、胰腺癌和/或胆管癌；最优选地上GI癌是胰腺癌。此外，本文所述的方法涉及一些实施方式，其中胃肠癌是下GI癌，例如小肠癌、 十二指肠癌、阑尾癌、结肠癌、直肠癌、大肠癌和/或肛门癌；最优选地下GI癌为大肠癌。本发明的第一方面一用于诊断的方法在诊断时，与健康的同龄受试者相比，很多胰腺癌、胃癌以及胆管癌患者(局部晚期疾病患者和转移性疾病患者)具有升高的血浆IL-40水平。本发明的第一方面涉及一种诊断受试者中存在胃肠癌的方法，所述方法包括
i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和 ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较，所述参考水平选自定义如下的年龄依赖性临界值70th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 1+0. 02X 年龄(岁)，
75th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 2+0. 02X 年龄(岁)，
85th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 4+0. 02X 年龄(岁)，
90th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 5+0. 02X 年龄(岁)，
95th百分位数:ln (血浆g/'1=3. 6+0. 02X 年龄(岁)，和
97. 5th百分位!t :1η (血浆 IL-40μg/xD = 3. 9+0. 02 X 年龄(岁)。其中样品中的IL-40水平高于参考水平表明存在胃肠癌。至于本发明的这一方面，所述参考水平可以是通过测量健康个体样品中的IL-40水平而获得的一个或多个IL-40参考水平。关于这些IL-40参考水平和优选参考水平的更多细节，可以参见本文“参考水平”部分。优选地，一个或多个参考水平之一可以是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血水平的95th百分位数。更优选地，一个或多个参考水平之一可以是年龄校正的临界值，其是定义为ln(血浆IL-40) = 3. 6+0. 02X 年龄(岁)的95th百分位数。此外或另外优选地，一个或多个参考水平之一可以是对应健康个体血清或血浆IL-40水平的90th百分位数的年龄校正的临界值。更优选地，一个或多个参考水平之一可以是定义为In (血浆IL-40) = 3. 5+0. 02 X年龄(岁)的90th百分位数的年龄校正的临界值。因此，在本发明这方面更优选的实施方式中，一个或多个观1^40 参考水平是一个或多个如下定义的年龄依赖性临界值9(^百分位数1η (血浆g/1) = 3. 5+0. 02 X 年龄(岁)，和95&百分位数1η (血浆g/1) = 3· 6+0. 02X 年龄(岁)。至于本发明的这一方面，胃肠(GI)癌可以是本文所述的任意GI癌或GI癌组。优选地，GI癌可选自转移性GI癌，例如转移性胰腺癌和/或转移性大肠癌。更优选地，GI癌可选自转移性上GI癌，例如转移性胰腺癌。本发明的第二方面一用于分类严重性的方法在诊断时，与健康同龄受试者相比，很多胰腺癌、胃癌以及胆管癌患者(局部晚期疾病患者和转移性疾病患者)具有升高的血浆IL-40水平。此外还发现，与局部晚期上GI 癌，例如胰腺癌、胃癌或胆管癌的患者相比，患有转移性上GI癌，例如胰腺癌、胃癌或胆管癌的患者有更高的IL-40水平。而且患有上GI癌并且IL-40水平最高的患者具有最短的生存期，见本文实施例3。本发明的第二方面涉及一种分类受试者中胃肠癌(优选上胃肠癌)的严重性的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个年龄校正的IL-40参考水平进行比较；其中样品中的IL-40水平高于一个或多个参考水平表明所述胃肠癌严重。因此，胃肠癌的分类是通过将样品中测定的IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平比较来实现，其中^(L-40水平越高，具体的胃肠癌就被分类为越严重，并且任选地， 要启动、继续或替换的疗法的效力也应该越高。同样地JKL-40水平越低，胃肠癌就被分类为越缓和，并且任选地，要启动、继续或替换的疗法的效力也应该越低。 至于本发明的这一方面，所述参考水平可以是通过测量健康个体样品中的IL-40 水平而获得的一个或多个IL-40参考水平。关于这些IL-40参考水平和优选参考水平的更多细节，可以参见本文“参考水平”部分。优选地，一个或多个IL-40参考水平可以是一组IL-40年龄依赖性临界值，例如，如下表所限定
权利要求
1.一种为受试者的胃肠癌确定疗法的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个年龄校正的IL-40参考水平进行比较；在此基础上确定要启动、继续、终止或替换的疗法。
2.如权利要求1所述的方法，进一步包括以下步骤iii)在治疗一段时间后测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；和iv)将所述IL-40水平与步骤i)获得的IL-40水平比较；当步骤iii)的IL-40水平低于或等于步骤i)中获得的水平，表明所述治疗有应答， 或者步骤iii)的^(L-40水平高于步骤i)中获得的水平，表明该受试者对所述治疗无应答。
3.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述方法是一种为受试者的胃肠癌确定疗法的方法，所述方法包括i)测定从受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平比较；其中测定的^(L-40水平低于一个或多个参考水平，确定该受试者容易对生物药剂治疗有应答，并在此基础上确定是否要启动该疗法。
4.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多参考水平是通过测量健康个体的样品中的^(L-40水平而获得的一个或多个年龄校正的参考水平。
5.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多个^^-40参考水平之一是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血浆^(L-40水平的70th百分位数。
6.如权利要求5所述的方法，其中所述年龄校正的临界值是定义为In(血浆 YKL-40 μ g/1) = 3. 1+0. 02 X 年龄(岁)的 70th 百分位数。
7.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多个^^-40参考水平之一是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血浆^(L-40水平的75th百分位数。
8.如权利要求7所述的方法，其中所述年龄校正的临界值是定义为In(血浆 YKL-40 μ g/1) = 3. 2+0. 02 X 年龄(岁)的 75th 百分位数。
9.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述YKL-40参考水平是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血浆IL-40水平的85th百分位数。
10.如权利要求9所述的方法，其中所述年龄校正的临界值是定义为In(血浆 YKL-40 μ g/1) = 3. 4+0. 02 X 年龄(岁)的 85th 百分位数。
11.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多个YKL-40参考水平之一是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血浆^(L-40水平的90th百分位数。
12.如权利要求11所述的方法，其中所述年龄校正的临界值是定义为In(血浆 YKL-40 μ g/1) = 3. 5+0. 02 X 年龄(岁)的 90th 百分位数。
13.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述IL-40参考水平是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血浆IL-40水平的95th百分位数。
14.如权利要求13所述的方法，其中所述年龄校正的临界值是定义为In(血浆 YKL-40 μ g/1) = 3. 6+0. 02 X 年龄(岁)的 95th 百分位数。
15.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多个YKL-40参考水平之一是年龄校正的临界值，其对应健康个体中血清或血浆^(L-40水平的第97. 5个百分位数。
16.如权利要求15所述的方法，其中所述年龄校正的临界值是定义为In(血浆 YKL-40 μ g/1) = 3. 9+0. 02 X 年龄(岁)的 97. 5th 百分位数。
17.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多个^^-40参考水平是权利要求5-16中的两项或更多项限定的一组^(L-40年龄依赖性临界值。
18.如权利要求17所述的方法，其中所述一个或多个^(L-40参考水平是如下定义的年龄依赖性临界值中的一个或多个70th百分位数In (血浆 YKL-40 μg/'1=3. 1+0. 02X 年龄(岁)，75th百分位数In (血浆 YKL-40 μg/'1=3. 2+0. 02X 年龄(岁)，85th百分位数In (血浆 YKL-40 μg/'1=3. 4+0. 02X 年龄(岁)，90th百分位数In (血浆 YKL-40 μg/'1=3. 5+0. 02X 年龄(岁)，95th百分位数In (血浆 YKL-40 μg/'1=3. 6+0. 02X 年龄(岁)，和97. 5th百分位i :1η (血浆 IL-40μg/xD = 3. 9+0. 02 X 年龄(岁)。
19.如权利要求17所述的方法，其中所述-龄依赖性临界值中的一个或多个-个或多个IL-40参考水平是以下定义的年95&百分位数ln(血浆ILIOyg/l) = 3. 6+0. 02 X年龄(岁)，和/或9(^百分位数1η (血浆 ILIOyg/l) = 3. 5+0. 02 X 年龄(岁)。
20.如权利要求17所述的方法，其中所述一组^(L-40年龄依赖性临界值是在下表中限定
21.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述一个或多参考水平是通过测量健康个体的年龄分布亚群的样品中的^(L-40水平而获得的一组^(L-40年龄依赖性参考水平。
22.如权利要求21所述的方法，其中所述一组^(L-40年龄依赖性参考水平是在下表中限定
23.如权利要求1-3任一项所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是来自相同受试者的一个或多个先前测定的^(L-40水平。
24.如权利要求23所述的方法，其中所述一个或多个先前测定的^(L-40水平是通过对女性增加0. 5 μ g/1/年，对男性增加0. 8 μ g/1/年进行年龄校正。
25.如权利要求1-3和23-M任一项所述的方法，其中所述样品中的IL-40水平与 YKL-40参考水平相比增加到至少1. 10倍或更高，表明胃肠癌已经发展到该癌症的更严重阶段；更优选与YKL-40参考水平相比增加到至少1. 25倍，例如1. 30倍，或1. 40倍；更优选增加到至少1. 50倍，例如1. 60倍，1. 70倍，或1. 75倍；更优选增加到至少1. 75倍，例如 1. 80倍，或1. 90倍，或2倍；最优选增加到至少2倍，例如2. 10倍，2. 20倍，2. 25倍，或2. 50 倍，表明所述癌症的严重性已经发展到所述癌症的更严重阶段。
26.如权利要求1-3和23-M任一项所述的方法，其中所述样品中的IL-40水平与 YKL-40参考水平相比至少减小到0. 90倍，表明胃肠癌已经发展到该癌症的较缓和阶段；更优选与IL-40参考水平相比至少减小到0. 80倍，例如0. 70倍；更优选至少减小到0. 60倍； 更优选至少减小到0. 50倍；最优选至少减小到0. 48倍；例如0. 45倍，0. 43倍，0. 40倍，或 0. 38倍，表明胃肠癌已经发展到该癌症的较缓和阶段。
27.如权利要求1-3和23-M任一项所述的方法，其中所述样品中的IL-40水平与先前从相同个体测量获得的^(L-40参考水平相比增加到2倍，例如至少2倍，显著表明该疾病或紊乱已经发展到更严重的阶段。
28.如权利要求1-3和23-M任一项所述的方法，其中所述样品中的IL-40水平与先前从相同个体测量获得的^(L-40参考水平相比减小到0. 50，例如至少0. 50倍，显著表明该疾病或紊乱已经发展到较缓和的阶段。
29.如权利要求1-3和23-M任一项所述的方法，其中所述样品中的IL-40水平与 YKL-40参考水平相比增加了 109%，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的更严重阶段。
30.如权利要求1-3和23-M任一项所述的方法，其中所述样品中的IL-40水平与 YKL-40参考水平相比减小了 52%，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的较缓和阶段。
31.如前面任一项权利要求所述的方法，其中所述步骤i)中的测定是在所讨论的治疗开始之前进行。
32.一种确定受试者的胃肠癌的治疗效果的方法，所述方法包括i)在治疗一段时间后测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；和 )将所述^(L-40水平与来自相同受试者的一个或多个先前测定的^(L-40参考水平进行比较；步骤i)的11^40水平低于或等于步骤ii)中的一个或多个先前水平，表明对所述治疗有应答，或者步骤i)的观1^40水平高于步骤ii)中的一个或多个先前水平，表明该受试者对所述治疗无应答。
33.如权利要求32所述的方法，其中所述一个或多个先前测定的^(L-40水平是如权利要求M-30任一项中限定。
34.一种为患有上胃肠癌并且用治疗处理治疗的受试者确定预后的方法，所述治疗处理选自化学治疗药剂、生物药剂、放射疗法及其结合；所述方法包括i)测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平比较；其中所述^(L-40水平相对于参考水平表明所述胃肠癌在该具体治疗方案期间或之后的发展或进展，并由此表明预后。
35.如权利要求34所述的方法，其中所述步骤i)中的测定是在所讨论的治疗启动后进行。
36.根据权利要求34-35任一项所述的方法，其中所述步骤i)的测定是在治疗至少2 周后，优选地在治疗至少4周后，或者治疗至少6周后进行。
37.根据权利要求34-36任一项所述的方法，其中所述步骤i)的测定是在治疗结束后进行，例如治疗结束后至少2周，优选地治疗结束后至少4周，或者治疗结束后至少6周。
38.根据权利要求34-36任一项所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是权利要求4-22任一项中限定的一个或多个参考水平。
39.根据权利要求34-36任一项所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是权利要求23-30任一项中限定的一个或多个参考水平。
40.根据权利要求34-38任一项所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是权利要求4-30任一项中限定的两个或更多个参考水平的结合。
41.一种监测受试者的上胃肠癌的治疗处理的方法，所述治疗处理选自化学治疗药剂、 生物药剂、放射疗法及其结合，所述受试者针对具体疾病进行治疗，所述方法包括i)测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；ii)将所述IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平比较；其中所述IL-40水平相对于参考水平表明所述胃肠癌的进展和/或状态，并因此表明当前进行的治疗处理的有效程度；以及iii)在此基础上确定该胃肠癌的治疗处理是否要继续、终止或替换。
42.根据权利要求41所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是权利要求4-30任一项中限定的一个或多个参考水平。
43.根据权利要求41-42任一项所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是来自相同受试者的一个或多个先前测定的^(L-40参考水平之一；并且当所述样品中的IL-40水平与IL-40参考水平相比增加到至少1. 10倍，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的更严重阶段；和当所述样品中的YKL-40水平与IL-40参考水平相比至少减小到0. 90倍，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的较缓和阶段。
44. 一种诊断受试者的胃肠癌的存在的方法，所述方法包括 i)测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；和 )将所述^(L-40水平与选自如下定义的年龄依赖性临界值的一个或多个^(L-40参考水平进行比较70th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 1+0. 02X 年龄(岁)，75th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 2+0. 02X 年龄(岁)，85th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 4+0. 02X 年龄(岁)，90th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 5+0. 02X 年龄(岁)，95th百分位数:ln (血浆g/'1=3. 6+0. 02X 年龄(岁)，和97. 5th百分位!t :1η (血浆 YKL-40μg/xD = 3. 9+0. 02X 年龄(岁)，其中所述样品中的^(L-40水平高于一个或多个参考水平，表明存在胃肠癌。
45.根据权利要求44所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是权利要求4-30任一项中限定的一个或多个参考水平。
46.根据权利要求44所述的方法，其中所述一个或多个^(L-40参考水平选自如下定义的一个或多个年龄依赖性临界值9(^百分位数1η (血浆g/1) = 3. 5+0. 02 X年龄(岁)，和95&百分位数ln(血浆 ILIOyg/l) = 3. 6+0. 02 X 年龄(岁)。
47.一种分类受试者的胃肠癌的严重性的方法，所述方法包括i)测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；和ii)将所述IL-40水平与一个或多个年龄校正的IL-40参考水平进行比较；其中所述样品中的IL-40水平高于参考水平，表明所述胃肠癌的严重性。
48.根据权利要求47所述的方法，用于分类受试者中胃肠癌的严重性，所述方法包括i)测定从所述受试者获得的样品中的IL-40水平；和 )将所述^(L-40水平与一个或多个^(L-40参考水平比较；所述参考水平是来自相同受试者的一个或多个先前测定的^(L-40水平；其中样品中的IL-40水平与IL-40参考水平相比增加到至少1. 10倍，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的更严重阶段；以及其中样品中的IL-40水平与IL-40参考水平相比至少减小到0. 90倍，表明胃肠癌已经发展到该胃肠癌的较缓和阶段。
49.根据权利要求47-48任一项所述的方法，其中所述一个或多个参考水平是权利要求4-30任一项中限定的一个或多个参考水平。
50.根据权利要求1-33、42-49任一项所述的方法，其中所述胃肠癌是上胃肠癌和/或下胃肠癌。
51.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述胃肠癌是上GI癌。
52.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述胃肠癌是选自食管癌、胃癌、胰腺癌和胆管癌的一种或多种上GI癌。
53.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述胃肠癌是胰腺癌。
54.根据权利要求1-33、42-50任一项所述的方法，其中所述胃肠癌是选自小肠癌、 十二指肠癌、阑尾癌、结肠癌、直肠癌、大肠癌和肛门癌的一种或多种下GI癌。
55.根据权利要求1-33、42-50任一项所述的方法，其中所述胃肠癌是大肠癌或转移性大肠癌。
56.根据权利要求1-33、42-50任一项所述的方法，其中所述胃肠癌是转移性大肠癌。
57.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述监测是与大肠癌的治疗同步进行。
58.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述治疗是外科手术、和/或用化学治疗药剂和/或生物药剂和/或放射疗法治疗。
59.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述治疗选自化学治疗剂、生物药剂、 放射疗法及其结合。
60.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述化学疗法治疗包括施予选自氟尿嘧啶、卡培他滨、依立替康、奥沙利钼、吉西他滨、多西他赛、厄洛替尼和亚叶酸的一种或多种化合物。
61.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述治疗包括选自生物药剂和化学治疗药剂的一种或多种药剂。
62.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述治疗包括生物药剂，例如EGFR抑制剂或VEGF抑制剂。
63.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述治疗包括EGFR抑制剂，例如西妥昔单抗、潘尼单抗、扎鲁木单抗和厄洛替尼。
64.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述治疗包括西妥昔单抗。
65.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述YKL-40水平是用免疫分析法测定。
66.根据权利要求65所述的方法，其中所述免疫分析法是ELISA。
67.根据权利要求65所述的方法，其中所述免疫分析法是竞争性免疫分析法。
68.根据权利要求65-67任一项所述的方法，其中所述免疫分析法使用可检测的标记测量^(L-40，所述可检测标记选自放射性同位素、酶、荧光分子、化学发光分子、生物发光分子和胶体金属。
69.根据权利要求65-68任一项所述的方法，其中所述免疫分析法使用单克隆抗体测量 YKL-40。
70.根据权利要求65-67任一项所述的方法，其中所述免疫分析法使用多克隆抗体测量 YKL-40。
71.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述IL-40水平是在基于PCR的分析中测定。
72.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中在与IL-40水平相同的样品中测定一个或多个另外的生物标记的水平。
73.根据权利要求72所述的方法，其中所述一个或多个另外的生物标记选自KRAS突变状态、BRAF突变状态、PTEN表达、微卫星不稳定性(MSI)、AREG表达、EREG表达、CRP、 ESR、CEA、CA19-9、LDH、金属蛋白酶组织抑制剂1 (TIMPl)、白细胞介素类、IL-4、IL-6、IL-8、 VEGF、金属蛋白酶、可溶性UPAR(sUPAR)、肿瘤坏死因子- α、I型和III型前胶原氨基端肽(P-III-NP)、单核细胞趋化蛋白-1、纤维蛋白D-二聚体、以及从阵列研究中鉴定的其他基因-、微RNA和SNP生物标记。
74.根据权利要求72所述的方法，其中所述一个或多个另外的生物标记选自KRAS突变状态、BRAF突变状态、CEA、CA19-9。
75.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述YKL-40水平是用试纸测定。
76.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述生物样品是血液、血清或血浆。
77.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述生物样品是血清或血浆。
78.根据前面任一项权利要求所述的方法，其中所述受试者是哺乳动物，优选为人。
79.一种确定受试者的胃肠癌的疗法和/或监测胃肠癌的治疗处理的装置，其中该装置包括用于测量样品中的IL-40水平的工具，以及用于将测量的IL-40水平与如下定义的一个或多个年龄依赖性临界值进行比较的工具70th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 1+0. 02X 年龄(岁)，75th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 2+0. 02X 年龄(岁)，85th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 4+0. 02X 年龄(岁)，90th百分位数:1η (血浆g/'1=3. 5+0. 02X 年龄(岁)，95th百分位数:ln (血浆g/'1=3. 6+0. 02X 年龄(岁)，和97. 5th百分位!t :1η (血浆 YKL-40μg/xD = 3. 9+0. 02 X 年龄(岁)。
80.根据权利要求79所述的装置，其中所述装置是试纸。
81.根据权利要求79-80任一项所述的装置，其中所述装置包括单个参考水平，代表一临界值。
82.根据权利要求79-80任一项所述的装置，其中所述装置包括用于将测量的IL-40 水平与一组年龄校正的IL-40参考水平进行比较的工具。
83.根据权利要求79所述的装置，其中所述装置包括用于将测量的^(L-40水平与如下表中定义的一组年龄依赖性临界值进行比较的工具健康受试者的年龄依赖估fe临界值年龄区间 (岁)70fll百分位数 (μ 1ΥΚ -40)75th百分位数 (μ^ΥΚ -40)85 百分位数 _YKL40)90th百分位数95th百分位数 (μ^ΥΚΙ^Ο)20-29404454596530-39485465728040-49596580889850-5972809810811960-69889811913214570-7910811915416117880-89132145178196217
84.根据权利要求79所述的装置，其中所述装置包括用于将测量的^(L-40水平与如下表中定义的一组年龄依赖性参考水平进行比较的工具
85.一种试剂盒，包括i)用于测量样品中的IL-40水平的工具；i i)用于将测量的IL-40水平与一个或多个IL-40参考水平进行比较的工具，该参考水平选自如下定义的一组年龄校正的IL-40参考水平7(^百分位数ln(血浆 ILIOyg/l) =3. 1+0. 02 X 年龄(岁)， 75&百分位数ln(血浆 ILIOyg/l) = 3. 2+0. 02 X 年龄(岁)， 85&百分位数1η (血浆g/1) = 3. 4+0. 02 X 年龄(岁)， 9(^百分位数1η (血浆g/1) = 3. 5+0. 02 X 年龄(岁)，95&百分位数1η (血浆g/1) = 3. 6+0. 02 X年龄(岁)，和 97. 5&百分位数ln(血浆ILIOyg/l) = 3. 9+0. 02 X年龄(岁)；以及 iii)关于如何根据提供样品的受试者的年龄，对所述^(L-40参考水平进行年龄校正的说明。
86.如权利要求85所述的试剂盒，其中所述试剂盒进一步包括用于分析另外的生物标记的工具。
87.如权利要求85-86所述的试剂盒，包括至少一种权利要求79-84任一项所述的装
全文摘要
本发明涉及胃肠癌以及为受试者的所述胃肠癌选择治疗的方法。本发明进一步涉及诊断胃肠癌的存在和/或分类胃肠癌的严重性的方法；以及确定所施予的治疗的效果和/或在施行治疗之前、期间或之后，对患有胃肠癌的受试者进行预后的方法。所有方法都适用测定的YKL-40水平高于一个或多个参考水平，表明治疗、疾病的严重性、治疗的效果和/或受试者的预后。参考水平通常是从健康个体获得的水平或者先前从相同受试者获得的水平。受试者可能患有任意一种或多种胃肠癌，例如上胃肠癌和转移性大肠癌。本发明进一步涉及可用于本发明方法中的试剂盒和装置。
文档编号G01N33/574GK102317783SQ200980145722
公开日2012年1月11日 申请日期2009年9月14日 优先权日2008年9月15日
发明者伊布·雅勒·克里斯坦森, 博格·格朗尼·诺德埃斯特加尔德, 尼古拉·埃格德·舒尔茨, 斯蒂格·玻约森, 朱莉娅·希德纽斯·约翰森, 汉斯·乔根·尼尔森, 班尼·维特拉普·简森 申请人:哈维德夫医院, 海莱乌医院, 里格舒斯匹塔里特医院