专利名称：能中和狂犬病病毒的结合分子及其应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及医药学领域。本发明特别涉及中和狂犬病病毒的结合分子。所述结合 分子可用于狂犬病的暴露后预防中。
背景技术：
狂犬病是一种几乎在全世界分布的病毒感染，其主要影响野生动物和家畜，但也 包括人，导致破坏性的、几乎不可改变的致命脑炎。估计每年有超过70000人丧命，其它数
百万人需要暴露后治疗。狂犬病病毒是一种子弹形状的、有包膜的、单链RNA病毒，分类为弹状病毒科和狂 犬病毒属。狂犬病病毒的基因组编码5种病毒蛋白质RNA-依赖性RNA聚合酶(L)、核蛋白 (N)、磷酸化蛋白质(P)、位于病毒蛋白包膜内侧的基质蛋白(M)、及外表面糖蛋白(G)。G蛋白(62_67kDa)是由505个氨基酸组成的一种I型糖蛋白，具有2_4个潜在N 糖基化位点，其中仅一或两个是依赖于病毒株而糖基化的。G蛋白形成覆盖病毒粒包膜外表 面的突起，已知其诱导病毒中和抗体。狂犬病可以通过被动和主动免疫两种方式治疗或者预防。狂犬病暴露后预防包括 迅速将局部伤口进行处理并给予被动(抗狂犬病免疫球蛋白)和主动免疫(疫苗)措施。目前，抗狂犬病免疫球蛋白(RIG)是从狂犬病病毒免疫的人(HRIG)或者狂犬病 病毒免疫的马(ERIG)的血清样品中制备的。ERIG以及HRIG的缺点是不能获得足够的量， 在HRIG情况中太昂贵。另外，使用ERIG可导致不利反应，如过敏性休克。污染已知或未知 病原体的可能性是与HRIG相关的另外的关注。为了克服这些缺点，提议在暴露后预防中 使用能中和狂犬病病毒的单克隆抗体。本领域已知中和狂犬病病毒的鼠单克隆抗体(见 Schumacher et al.，1989)。然而，由于与给予人体鼠抗体相关的问题导致鼠抗体在体内的 应用受到限制，所述问题如血清半衰期短，不能触发某些人效应器功能，及在人体中激发对 鼠抗体的非所需的明显免疫应答(人抗小鼠抗体(HAMA)反应)。最近描述了中和人狂犬病病毒单克隆抗体(见Dietzschold et al.，1990， Champion et al.，2000，和Hanlon et al. ,2001) 对于在暴露后预防中与HRIG同样有效 的人抗狂犬病单克隆抗体而言，应使用单克隆抗体混合物。在这种混合物中，每种抗体应结 合病毒上的不同表位或位点，以预防病毒抗性变体的逃避。目前仍非常需要新的具有改良的暴露后预防潜力的人狂犬病病毒中和单克隆抗 体，特别是具有不同表位识别特异性的抗体。本发明提供了这种人单克隆抗体，其可用于进 行多种狂犬病病毒及其中和抗性变体的暴露后预防的混合物中。附图描述

图1示出狂犬病病毒株CVS-Il与E57逃逸病毒(escape virus)的氨基酸序列对 比。在感染后2天收获病毒感染的细胞并分离总RNA。产生cDNA并用于DNA测序。图中示CN 102139106 A
说明书
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出了含有突变的区域，以黑体字表示突变。图IA示出核苷酸序列对比。氨基酸上面的数字 表示来自包括信号肽的狂犬病病毒糖蛋白的氨基酸编号。图IB示出氨基酸序列对比。狂 犬病病毒糖蛋白的示意图示于上方。黑框表示信号肽，灰色框表示跨膜结构域。图1中的 序列也由SEQ ID No :130-141表示。图2示出狂犬病病毒株CVS-Il与EJB逃逸病毒的氨基酸序列对比。在感染后2 天收获病毒感染的细胞并分离总RNA。产生cDNA并用于DNA测序。图中示出含有突变的 区域，突变以黑体字表示。图2A示出核苷酸序列对比。氨基酸上面的数字表示来自包括信 号肽的狂犬病病毒糖蛋白的氨基酸编号。图2B示出氨基酸序列对比。狂犬病病毒糖蛋白 的示意图示于上方。黑框表示信号肽，灰色框表示跨膜结构域。图2中的序列也由SEQ ID No :142-151 表示。图3示出载体PDV-C06。图4示出抗狂犬病病毒scFv与称作CR-57的生物素化的抗狂犬病病毒抗体的竞 争ELISA。将用纯化的狂犬病病毒G蛋白包被的ELISA平板在加入CR_57bio (0. 5 μ g/ml) 之前与各自的scFv保温。随后，在有和无scFv的条件下监测CR-57bio结合。图5示出抗狂犬病病毒scFv与称作CR-57的抗狂犬病病毒抗体的竞争ELISA。将 用纯化的狂犬病病毒G蛋白包被的ELISA平板在加入过量的scFv之前与CR-57 (1 μ g/ml) 保温。随后，在有和无CR-57的条件下监测scFv结合。图6示出抗狂犬病病毒G蛋白IgG与称作CR-57的抗狂犬病病毒抗体的竞争 ELISA。将G蛋白(ERA毒株)与未标记的IgG(在X轴上示出)保温。加入生物素化的 CR57 (CR57bio)，使之与G蛋白结合，然后利用链霉亲和素-HRP显色。ELISA信号以单独的 CR57bio结合百分比示出。图7示出抗狂犬病病毒G蛋白IgG与称作CR-57的抗狂犬病病毒抗体的竞争FACS 分析。将表达G蛋白(ERA毒株)的PER. C6细胞与未标记的IgG(在X-轴上示出)保温。 加入生物素化的CR57(CR57bio)，使之与G蛋白表达细胞结合，然后利用链霉亲和素-PE显 色。FACS信号以单独的CR57bio结合百分比示出。图8示出CVS-Il与E98逃逸病毒的氨基酸序列对比。在感染后2天收获病毒感 染的细胞并分离总RNA。产生cDNA并用于DNA测序。图中示出含有点突变的区域，突变以 黑体字表示。图8A示出核苷酸序列对比。核苷酸上面的数字表示无信号肽序列的狂犬病 病毒糖蛋白开放读框的突变的核苷酸(以黑体字表示)。图8B示出氨基酸序列对比。氨基 酸上面的数字表示无信号肽序列的狂犬病病毒糖蛋白的突变的氨基酸(以黑体字表示)。图9示出123个狂犬病街毒的系统树(123个狂犬病病毒G糖蛋白序列，邻接法 (Neighbor joining)，Kimura-2-参数方法，靴值(bootstrap) 500)。黑体字表示在 E98 逃 逸病毒中观察到的具有N > D突变的病毒。图10示出狂犬病糖蛋白上的中和表位。图中示出了狂犬病病毒糖蛋白的示意图， 描述了包括新的CR57表位的抗原位点。信号肽(19个氨基酸)和跨膜结构域以黑框表示。 图中示出了二硫键。氨基酸编号得自减去信号肽序列的成熟蛋白质。发明描述下文阐述了对本发明使用的术语进行的定义。定义
结合分子如本文所用，术语“结合分子”是指完整的免疫球蛋白，包括单克隆抗体，如嵌合 的、人源化的或者人单克隆抗体，或者是指包含与完整免疫球蛋白竞争特异性结合免疫球 蛋白的结合配偶体(如狂犬病病毒或其片段，例如G蛋白)的免疫球蛋白片段的抗原结合 和/或可变结构域。无论结构如何，抗原结合片段均与完整免疫球蛋白所识别的相同抗原 结合。抗原结合片段可包含一种肽或者多肽，所述肽或者多肽包含所述结合分子的氨基酸 序列的至少 2、5、10、15、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、125、150、175、200 或者至 少250个连续的氨基酸残基。本文所用术语“结合分子”包括本领域已知的所有免疫球蛋白类和亚类。根据其重 链恒定结构域的氨基酸序列，结合分子可以分为5个主要类别的完整抗体IgA、IgD、IgE、 IgG和IgM，这些类别有几个可进一步分为亚类(同种型)，例如IgAl、IgA2、IgGl、IgG2、 IgG3 禾口 IgG4。抗原结合片段包括Fab、F(ab' )、F(ab' )2、Fv、dAb、Fd、互补决定区(CDR)片 段、单链抗体(scFv)、二价单链抗体、单链噬菌体抗体、双链抗体(diabody)、三链抗体 (triabody)、四链抗体(tetrabody)、(多)肽，其含有至少足以赋予所述(多)肽特异性 抗原结合的免疫球蛋白片段，等等。上述片段可以合成产生或者通过酶或化学切割完整 免疫球蛋白而产生或者通过重组DNA技术遗传工程化。生产方法为本领域所熟知，例如 Antibodies :A Laboratory Manual,Edited by:E. Harlow and D,Lane (1988), Cold Spring Harbor Laboratory, Cold SpringHarbor, New York所述,所述文献在此并入作参考。结合 分子或其抗原结合片段可具有一或多个结合位点。如果有一个以上的结合位点，则所述结 合位点可以是相同或者不同的。所述结合分子可以是裸露的或者未缀合的结合分子，但也可以是免疫缀合物的一 部分。裸露的或者未缀合的结合分子是指与效应物(effector)部分或者标记如毒性物质、 放射性物质、脂质体、酶未缀合的、可操纵地连接的或者另外物理或者功能结合的结合分 子。应理解裸露的或者未缀合的结合分子不排除已经稳定化的、多聚体化的、人源化的或者 以任何其它方式操纵的结合分子，除了与效应物部分或标记附着。因此，所有翻译后修饰的 裸露和未缀合结合分子均包括在内，包括所述修饰是在产生天然结合分子的细胞环境中进 行的，通过产生重组结合分子的细胞产生的及在最初制备结合分子后经人工导入的。当然， 术语裸露的或者未缀合的结合分子不排除结合分子在给予机体后与效应细胞和/或分子 形成功能性结合的能力，一些这种相互作用是发挥生物学作用必需的。因此，缺少相关的效 应基团或者标记用于定义在体外而非在体内的裸露的或者未缀合的结合分子。互补决定区(CDR)本文所用术语“互补决定区”是指结合分子如免疫球蛋白的可变区内的序列，其通 常在很大程度上提供在形态和电荷分布上与抗原识别的表位互补的抗原结合位点。CDR区 域可以特异于线性表位、不连续表位、或者蛋白质或者蛋白质片段的构象表位，以其天然构 象呈递在蛋白质上或者在一些情况中作为变性的蛋白质(例如在SDS中溶解)的构象呈递 在蛋白质上。表位也可以由蛋白质的翻译后修饰组成。功能变体如本文所用术语“功能变体”是指这样的结合分子，其包含一种核苷酸和/或氨基酸序列，该序列与亲代结合分子的核苷酸和/或氨基酸序列相比有一或多个核苷酸和/或 氨基酸发生改变，并仍能与亲代结合分子竞争结合结合配偶体，例如狂犬病病毒或其片段。 换句话说，亲代结合分子的氨基酸和/或核苷酸序列中的修饰不显著影响或者改变由该核 苷酸序列编码的或者包含该氨基酸序列的结合分子的结合特性，即所述结合分子仍能识别 并结合其靶位。所述功能变体可具有保守序列修饰，包括核苷酸和氨基酸取代、添加和缺 失。这些修饰可以通过本领域已知的标准技术导入，如定点诱变和随机PCR介导的诱变，并 且可以包含天然以及非天然的核苷酸和氨基酸。保守氨基酸取代包括其中氨基酸残基由具有相似结构或者化学性质的氨基酸残 基置换的取代。本领域已经定义了具有相似侧链的氨基酸残基家族。这些家族包括具有碱 性侧链的氨基酸(例如赖氨酸、精氨酸、组氨酸)，具有酸性侧链的氨基酸(例如天冬氨酸、 谷氨酸)，具有无电荷的极性侧链氨基酸(例如天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨 酸、半胱氨酸、色氨酸)，具有非极性侧链氨基酸(例如甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异 亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸)，具有β-分支侧链氨基酸(例如苏氨酸、缬氨酸、异 亮氨酸)和具有芳族侧链氨基酸(例如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸)。本领域技术人员明了 也可以应用除了上述所用氨基酸分类之外的氨基酸残基家族的其它分类。此外，变体可以 具有非保守的氨基酸取代，例如用具有不同结构或者化学性质的氨基酸残基置换氨基酸。 相似的次要变化也可以包括氨基酸缺失或者插入或者这两者。确定哪个氨基酸残基可以被 取代、插入或者缺失而不消除免疫学活性的指导可以使用本领域熟知的计算机程序发现。核苷酸序列中的突变可以是在一个基因座的单一改变(点突变)，如转换或者颠 换突变，或者在一个基因座插入、缺失或者改变多个核苷酸。另外，可以在核苷酸序列内的 许多基因座进行一或多个改变。所述突变可以通过本领域已知的任何合适方法进行。宿主如本文所用术语“宿主”是指其中已经导入载体如克隆载体或者表达载体的生物 体或者细胞。所述生物体或者细胞可以是原核或者真核生物或者细胞。应理解该术语不仅 是指特定生物体或细胞，也是指这种生物体或细胞的子代。因为某些修饰由于突变或者环 境影响而可以在随后的世代中出现，这种子代事实上与亲代生物体或者细胞也许不同，但 是仍包括在本文所用术语“宿主”范围内。A术语“人”当用于本文所述结合分子时，是指直接衍生自人的分子或者基于人序列 的分子。当结合分子衍生自或者基于人序列并随后被修饰时，在本说明书中仍认为是人。换 句话说，术语人当用于结合分子时是包括具有衍生自人种系免疫球蛋白序列的可变区和恒 定区的结合分子，其基于在人或人淋巴细胞中出现或不出现的或者是以修饰的形式出现或 者不出现的可变区或者恒定区。因此，人结合分子可包括不是由人种系免疫球蛋白序列编 码的氨基酸残基，包含取代和/或缺失(例如通过体外随机或者位点特异性诱变或者体内 体细胞突变而导入的突变)。本文所用术语“基于”是指核酸序列可以精确地从模板拷贝或 者具有较少突变，例如通过易错PCR方法或者与模板精确匹配或者具有较少修饰而合成产 生。基于人序列的半合成分子在本文中也认为是人。单克隆抗体如本文所用术语“单克隆抗体”是指单一分子组分即一级结构即具有单一氨基酸序列的抗体分子制品。单克隆抗体展示对于特定表位的单一结合特异性和亲和性。因此， 术语“人单克隆抗体”是指展示单一结合特异性的抗体，其具有衍生自或者基于人种系免疫 球蛋白序列或者衍生自完全合成的序列的可变区和恒定区。制备单克隆抗体的方法与本发 明不相关。核酸分子如本文所用术语“核酸分子”是指多聚体形式的核苷酸，包括RNA、cDNA、基因组 DNA的有义和反义链，及上述分子的合成形式与混合的聚合物。核苷酸是指核糖核苷酸、 脱氧核苷酸或者任一类型核苷酸的修饰形式。该术语也包括DNA的单链和双链形式。另 外，多核苷酸可包括天然发生的核苷酸或者通过天然发生的和/或非天然发生的核苷酸 键连接在一起的修饰的核苷酸或者这两者。所述核酸分子可以经化学或者生物化学修饰 或者可以含有非天然的或者衍生的核苷酸碱基，这易于由本领域技术人员所意识到。这 种修饰包括例如标记、甲基化、用类似物取代一或多个天然发生的核苷酸、核苷酸间修饰 (internucleotide modification)如无电荷的键(例如甲基膦酸酯、磷酸三酯、氨基磷酸 酯、氨基甲酸等)、带电荷的键(例如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯等)、悬垂部分(pendent moiety)(例如多肽)、嵌入剂(例如吖啶、补骨脂素等)、螯合剂、烷化剂及修饰的键(例如 α端基异构核酸等)。该术语还包括任何拓扑构象，包括单链、双链、部分双链、三链、发夹、 环形和扣锁构象。该术语还包括合成的分子，其模拟多核苷酸通过氢键及其它化学相互作 用结合指定序列的能力。本领域已知这种分子，并包括例如其中肽键代替分子主链中的磷 酸键的分子。除非特别指出，则提及核酸序列时涵盖其互补体。因此，提及具有特定序列的 核酸分子时应理解涵盖其互补链及其互补序列。互补链也可用于例如反义治疗、杂交探针 和PCR引物中。药物可接受的赋形剂“药物可接受的赋形剂”是指与活性分子如药物、制剂或者结合分子组合以制备合 适或者方便剂型的任何惰性物质。“药物可接受的赋形剂”是以应用的剂量和浓度应用时对 于受者(recipient)是无毒的、或者至少其毒性对于其指定用途是可接受的赋形剂，并且 与包含药物、制剂或者结合分子的制剂的其它成分相容。暴露后预防“暴露后预防(PEP)”是针对可能暴露于狂犬病动物的人而言。可能的暴露包括咬 伤暴露(即通过牙齿对皮肤的任何穿透)，包括动物咬伤及非咬伤暴露。非咬伤暴露包括在 实验室或者洞穴中暴露于大量雾状散开的狂犬病病毒及移植了死于狂犬病的患者角膜的 手术受者。开放性创伤、擦伤、粘膜的污染，或者理论上被狂犬病动物唾液或者其它潜在感 染性物质(如神经组织)擦伤也构成了非咬伤暴露。其它自身接触，如抚摸狂犬病动物及 与狂犬病动物的血液、尿液或者粪便接触不构成暴露，不是预防的指征。PEP应在暴露后立 即进行。如果未暴露则无需进行暴露后预防。在所有暴露后预防方案中，除了先前已经免 疫接种的人之外，均应同时进行主动和被动免疫。特异性结合如本文所用术语“特异性结合”在描述结合分子例如抗体与其结合配偶体例如抗 原的相互作用时，是指该相互作用依赖于结合配偶体上特殊结构的存在，例如抗原决定簇 或者表位。换句话说，抗体优先结合或者识别结合配偶体，甚至当结合配偶体存在于其它分子或者生物体的混合物时也如此。这种结合是通过共价或者非共价相互作用或者这两者而 介导的。再换句话说，术语“特异性结合”是指免疫特异性结合一种抗原或其片段而非免疫 特异性结合其它抗原。免疫特异性结合抗原的结合分子可以较低的亲和性结合其它肽或者 多肽，例如通过放射性免疫分析(RIA)、酶联免疫吸附分析(ELISA)、BIAC0RE或者本领域已 知的其它方法确定。免疫特异性结合抗原的结合分子或其片段可以与相关抗原交叉反应。 优选地，免疫特异性结合抗原的结合分子或其片段与其它抗原不交叉反应。治疗有效量术语“治疗有效量”是指有效进行狂犬病暴露后预防的本文结合分子的量。^^术语“载体”是指其中可以插入第二种核酸分子以导入宿主中的核酸分子，在所述 宿主中其将被复制，在一些情况中被表达。换句话说，载体能转运与其连接的核酸分子。克 隆载体以及表达载体涵盖在如本文所用术语“载体”中。载体包括但非限于质粒、粘粒、细菌 人工染色体(BAC)和酵母人工染色体(YAC)及衍生自噬菌体或者植物或者动物(包括人) 病毒的载体。载体包含由指定宿主识别的复制起点，在表达载体情况中包含启动子及由宿 主识别的其它调节区域。含有第二种核酸分子的载体例如通过转化、转染或者通过利用细 菌或者病毒进入机制而导入细胞中。本领域已知将核酸导入细胞中的其它方式，例如对于 植物细胞通常使用电穿孔或者粒子轰击方式等。将核酸导入细胞中的方法依赖于细胞类型 等因素。这对于本发明无关紧要。某些载体在其被导入的宿主中能自发复制(例如具有细 菌复制起点的载体可以在细菌中复制)。其它载体基于导入宿主而可以整合进宿主基因组 中，从而随着宿主基因组而复制。发明概述本发明提供了能特异性结合并中和狂犬病病毒的结合分子。此外，本发明涉及至 少编码这些结合分子的结合区域的核酸分子。本发明进一步提供了本发明的结合分子对处 于发生得自狂犬病病毒的疾病危险中的对象进行暴露后预防中的应用。发明详述本发明第一方面包括能特异性结合狂犬病病毒的结合分子。优选地，本发明的结 合分子还具有狂犬病病毒中和活性。优选地，本发明的结合分子是人结合分子。或者，它们 也可以是其它动物的结合分子。狂犬病病毒是狂犬病毒属的一部分。狂犬病毒属共包括11 个基因型狂犬病病毒(基因型1) >Lagos蝙幅病毒(基因型2、,Mokola病毒(基因型3)、 Duvenhage病毒(基因型4)、欧洲蝙幅狂犬病毒1 (基因型5)、欧洲蝙幅狂犬病毒2 (基因型 6)、澳大利亚蝙幅狂犬病毒(基因型7)、Aravan病毒(基因型8)、Khujand病毒(基因型 9)、Irkut病毒(基因型10)和Wfest Caucasian病毒(基因型11)。除了结合狂犬病病毒， 本发明的结合分子还能结合狂犬病毒属的其它基因型。优选地，所述结合分子还能中和狂 犬病毒属的其它基因型。此外，本发明的结合分子甚至能结合和/或中和弹状病毒科除了 狂犬病毒属之外的病毒。这个科包括细胞弹状病毒属(cytorhabdovirus) ^phemerovirus 属、狂犬病毒属、核弹状病毒属(nucleorhabdovirus)、弹状病毒属(rhabdovirus)和 vesiculovirus 属。所述结合分子能特异性结合天然形式或者灭活/减毒形式的狂犬病病毒。狂犬病 病毒的灭活可以通过用如下方式处理而进行β-丙内酯(BPL)处理(White and Chappel,1982)、在56°C加热30分钟以上、γ射线照射、用乙酰乙撑亚胺或者乙撑亚胺处理或者用抗 坏血酸和硫酸铜处理72小时(Madhusudana et al.，2004)。也可以使用本领域已知的普通 病毒灭活方法，例如巴氏消毒法(湿热)、干热处理、蒸汽热处理、低PH处理、有机溶剂/去 污剂处理、纳米过滤；也可以使用UV光照射。优选地，通过用β-丙内酯(BPL)处理进行灭 活。测试狂犬病病毒是否仍具有感染性或者部分或全部灭活的方法为本领域技术人员所熟 知，可见于Laboratory techniques in rabies,Edited by :F. -X Meslin,M. M. Kaplan and H. Koprowski (1996), 4th edition，Chapter 36，WorldHealth Organization，Geneva 所述。所述结合分子也能特异性结合狂犬病病毒的一或多个片段，如衍生自狂犬病病毒 或者用狂犬病病毒蛋白和/或(多)肽转染的细胞的一或多种蛋白质和/或(多)肽制品。 对于治疗和/或预防方法如狂犬病病毒的暴露后预防方法而言，所述结合分子优选能特异 性结合狂犬病病毒的表面易接近的蛋白如M蛋白(见Ameyama et al. 2003)或者G蛋白。 对于诊断目的，人结合分子还能特异性结合不在狂犬病病毒表面上呈递的蛋白质。多种已 知狂犬病病毒株的表面可接近的和内部蛋白质的氨基酸序列可见于EMBL数据库和/或其 它数据库。优选地，所述片段至少包含本发明的人结合分子识别的抗原决定簇。本文所用术 语“抗原决定簇”是能以足够高亲和性结合本发明的人结合分子以形成可检测的抗原结合 分子复合物的一个部分，如狂犬病病毒(多)肽、(糖)蛋白、或其类似物或片段。本发明的结合分子可以是完整的免疫球蛋白分子，如多克隆或单克隆抗体，特别 是人单克隆抗体，或者所述结合分子可以是抗原结合片段，包括但非限于Fab、F(ab')、 F(ab' )2、Fv、dAb、Fd、互补决定区(CDR)片段、单链抗体(scFv)、二价单链抗体、单链噬菌 体抗体、双链抗体、三链抗体、四链抗体及含有至少免疫球蛋白的一个片段的(多)肽，该片 段足以赋予对狂犬病病毒或其片段的特异性抗原结合。本发明的结合分子可以非分离的形 式或者以分离的形式应用。此外，本发明的结合分子可以单独应用或者于包含至少一种人 结合分子(或者其变体或片段)的混合物中应用。换句话说，所述结合分子可以组合应用， 例如作为包含两或多种结合分子、其变体或者片段的药物组合物。例如，具有狂犬病病毒中 和活性的结合分子可以在单一治疗中组合以达到所需的预防、治疗或者诊断作用。RNA病毒如狂犬病病毒在病毒复制期间利用其自身的RNA聚合酶。这些RNA聚合 酶趋于易错。这样在病毒感染期间导致所谓的“准种”形成。每个准种均具有独特地RNA基 因组，可导致病毒蛋白质的氨基酸组成中的差异。如果这种突变发生在病毒结构蛋白中，则 该病毒由于T或B细胞表位中的变化而从宿主免疫系统中逃避。当用两种结合分子如人单 克隆抗体处理个体时发生这种情况的可能性高于用多克隆抗体混合物(HRIG)处理个体的 情况。因此，用两种人单克隆抗体混合物治疗狂犬病的先决条件是这两种抗体识别其靶抗 原即狂犬病病毒糖蛋白上的不重叠、不竞争的表位。从而使狂犬病逃逸病毒发生的机会降 至最低。结果，本发明的结合分子优选能与狂犬病病毒的不同的、不重叠的、不竞争的表位 反应，如狂犬病病毒G蛋白上的表位。结合分子的混合物可进一步包含至少一种其它的治 疗剂，如适于狂犬病暴露后预防的药物。典型地，本发明的结合分子可以结合其结合配偶体，即狂犬病病毒或其片段如狂 犬病病毒蛋白，亲和性常数(Kd值)低于0. 2X 101、1. OX 101、1. OX 10、、1. OX 10- ， 优选低于1.0X101，更优选低于1.0X10_9M，更优选低于Ι.ΟΧΙΟ,Μ，更优选低于^父^^丸特别优选低于^父川—1、。所述亲和性常数可以根据抗体同种型而变化。例 如，对于IgM同种型的亲和性结合是指至少大约1. OX 10_7M的结合亲和性。亲和性常数可 例如使用表面等离子共振方法测定，即通过检测生物传感器基质内蛋白质浓度的变化分析 实时生物特异性相互作用的光学现象，例如使用BIAC0RE系统(PharmaciaBiosensor AB, Uppsala, Sweden)。本发明的结合分子可以结合纯化/分离形式的或者非纯化/非分离形式的狂犬病 病毒。所述结合分子可以结合溶解形式的狂犬病病毒，例如样品中的狂犬病病毒，或者可以 结合与载体或者底物例如微滴定平板、膜和珠等结合或附着于其的狂犬病病毒。载体或者 底物可以由玻璃、塑料(例如聚苯乙烯)、多糖、尼龙、硝化纤维素或者特氟隆等制成。这种 支持物的表面可以是实心的或者有孔的，并且可以是任何方便使用的形状。或者，所述结合 分子还可以结合狂犬病病毒片段，如狂犬病病毒的蛋白质或者(多)肽。在一个实施方案 中，所述结合分子能特异性结合狂犬病病毒G蛋白或其片段。所述狂犬病病毒蛋白或(多) 肽可以是溶解形式或者是与上述载体或底物结合或者附着于其的狂犬病病毒。在另一个实 施方案中，用G蛋白转染的细胞可以用作所述结合分子的结合配偶体。在本发明的一个优选实施方案中，本发明的结合分子中和狂犬病病毒的感染性。 这可以通过阻止狂犬病病毒与其宿主细胞上的受体附着而实现，所述受体如鼠P75神经营 养蛋白受体、神经细胞粘附分子(CD56)和乙酰胆碱受体，或者通过抑制RNA释放进入细胞 质中或者阻止RNA转录或者翻译而实现。在一个特殊实施方案中，与不存在所述结合分子 的条件下狂犬病病毒感染宿主细胞相比，本发明的结合分子阻止狂犬病病毒感染宿主细 胞至少 99%、95%、90%、85%、80%、75%、70%、60%、50%、45%、40%、45%、35%、30%、 25%、20%，或者至少 10%。中和可例如 Laboratory techniques in rabies, Edited by: F. -X Meslin, Μ. M. Kaplan and H. Koprowski(1996),4th edition, Chapters 15-17, World Health Organization, Geneva所述进行测定。此外，本发明的人结合分子可以是能有助 于包膜的狂犬病病毒裂解的补体固定结合分子(complement fixing binding molecule) 0 本发明的人结合分子也可以作为调理素和增大对狂犬病病毒的吞噬作用，通过促进其由Fc 或Ob受体摄取或者通过凝集狂犬病病毒使其更易于被吞噬而实现。在一个优选实施方案中，本发明的结合分子包含至少一个⑶R3区域，其包含选自 如下的氨基酸序列SEQ ID NO :1、SEQ ID NO :2、SEQ ID NO :3、SEQ ID NO :4、SEQ ID NO 5, SEQ ID NO 6, SEQ IDN0:7、SEQ ID N0:8、SEQ ID N0:9、SEQ ID NO :10, SEQ ID NO :11、 SEQ ID NO: 12、SEQ ID NO: 13、SEQ ID NO: 14、SEQ ID NO: 15、SEQ ID NO: 16、SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO :18、SEQ ID NO :19、SEQ ID NO :20、SEQ ID NO :21、SEQ ID NO :22、SEQ ID NO 23和SEQ ID NO :24。在一个实施方案中，所述⑶R3区域是重链⑶R3区域。在另一个实施方案中，本发明的结合分子包含一条可变重链，其基本上包含选自 如下的氨基酸序列:SEQ ID NO :26, SEQ ID NO :27、SEQ ID NO :28、SEQ ID NO :29、SEQ ID NO :30、SEQ ID NO :31、SEQ ID NO :32、SEQ ID NO :33、SEQ ID NO :34、SEQ ID NO :35、SEQ ID NO :36、SEQ ID NO :37、SEQ ID NO :38、SEQ ID NO :39、SEQ ID NO :40、SEQ ID NO :41、 SEQ ID NO42,SEQ ID NO43,SEQ ID NO 44、SEQ ID NO45,SEQ ID NO46,SEQ ID N0: 47,SEQ ID NO :48和SEQ ID NO :49。在一个优选的实施方案中，本发明的结合分子包含一 条可变重链，其基本上包含SEQ ID NO 335的第1-119位氨基酸的氨基酸序列。
在另一个实施方案中，本发明的结合分子包含一条包含SEQ IDNO 26所示氨基酸 序列的可变重链和包含SEQ ID NO :50所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO 27 所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :51所示氨基酸序列的一条可变轻链、包 含SEQ ID NO 所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ IDNO :52所示氨基酸序列的 一条可变轻链、包含SEQ ID NO : 所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO 53 所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :30所示氨基酸序列的一条可变重链及包 含SEQ ID NO力4所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ IDNO :31所示氨基酸序列的一 条可变重链及包含SEQ ID NO :55所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :32所 示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :56所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含 SEQ ID NO :33所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQID NO :57所示氨基酸序列的一 条可变轻链、包含SEQ ID NO 34所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO 58所 示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :35所示氨基酸序列的一条可变重链及包含 SEQ ID NO :59所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :36所示氨基酸序列的一 条可变重链及包含SEQ ID NO :60所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :37所 示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :61所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含 SEQ ID NO :38所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :62所示氨基酸序列的一 条可变轻链、包含SEQ ID NO :39所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :63所 示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :40所示氨基酸序列的一条可变重链及包含 SEQ ID NO 64所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO 41所示氨基酸序列的一 条可变重链及包含SEQ IDNO :65所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :42所 示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :66所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含 SEQ ID NO :43所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :67所示氨基酸序列的一 条可变轻链、包含SEQ IDNO :44所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :68所 示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :45所示氨基酸序列的一条可变重链及包含 SEQ ID NO :69所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :46所示氨基酸序列的一 条可变重链及包含SEQ IDNO :70所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含SEQ ID NO :47所 示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :71所示氨基酸序列的一条可变轻链、包含 SEQ ID NO :48所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :72所示氨基酸序列的一 条可变轻链、包含SEQ IDNO :49所示氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :73所 示氨基酸序列的一条可变轻链。在一个优选的实施方案中，本发明的人结合分子包含包含 SEQ ID NO 335的第1-119位氨基酸的氨基酸序列的一条可变重链及包含SEQ ID NO :337 的第1-107位氨基酸的氨基酸序列的一条可变轻链。在一个优选的实施方案中，本发明的具有狂犬病病毒中和活性的结合分子是以 IgG形式给予的，优选IgGl形式。本发明的另一方面包括所述结合分子的功能变体。如果变体分子能与亲代结合分 子竞争特异性结合狂犬病病毒或其片段，则认为该分子是本发明的结合分子的功能变体。 换句话说，所述功能变体仍能结合狂犬病病毒或其片段。所述功能变体也应仍具有狂犬病 病毒中和活性。功能变体包括但非限于与一级结构序列基本上相似、但含有例如体外或者 体内修饰的衍生物，所述修饰是在亲代结合分子中未发现的化学和/或生物化学修饰。这种修饰包括乙酰化、酰化、ADP-核糖基化、酰胺化、共价附着黄素、共价附着血红素部分、共 价附着核苷酸或者核苷酸衍生物、共价附着脂质或者脂质衍生物、共价附着磷酯酰肌醇、交 联、环化、二硫键形成、去甲基化、共价交联形成、胱氨酸形成、焦谷氨酸形成、甲酰化、Y羧 化、糖基化、GPI-锚形成、羟化、碘化、甲基化、豆蔻酰化、氧化、PEG化、蛋白酶解加工、磷酸 化、异戊二烯化、外消旋、硒酰化(selenoylation)、硫酸化、转移RNA介导的向蛋白质中加 入氨基酸如精氨酰化、遍在蛋白化等。或者，功能变体可以是本发明所述的结合分子，与亲代结合分子的氨基酸序列相 比，其包含含有一或多个氨基酸的取代、插入、缺失或者其组合的氨基酸序列。此外，功能变 体可包含在氨基端或者羧基端或者这两端氨基酸序列截短。本发明的功能变体与亲代结合 分子相比可具有相同或不同的(较高或者较低)结合亲和性，但是仍能结合狂犬病病毒或 其片段并仍能中和狂犬病病毒。例如，本发明的功能变体与亲代结合分子相比可具有增加 或者降低的对狂犬病病毒或其片段的结合亲和性，或者具有较高或者较低的狂犬病病毒中 和活性。优选地，修饰可变区的氨基酸序列，包括但非限于构架区、高变区、特别是⑶R3区。 通常，轻链和重链可变区包含三个高变区，包含三个CDR，及所谓构架区(FR)的更保守的区 域。所述高变区包含CDR的氨基酸残基和高变环的氨基酸残基。在本发明范围内的功能变 体与本文所述亲代结合分子具有至少大约50% _99%、优选至少大约60% _99%、更优选至 少大约70% -99%、更优选至少大约80% -99%、最优选至少大约90% -99%、特别是至少 大约95% -99%、特别是至少大约97% -99%的氨基酸序列同源性。可以使用本领域技术 人员已知的计算机算法如Gap或者Bestfit最佳对比氨基酸序列并确定相似或者相同的氨 基酸残基。在另一个实施方案中，当亲代结合分子在其序列中包含一个糖基化位点导致结合 分子基于在真核细胞中表达而糖基化，并因此可能消除与抗原的结合时，产生功能变体。产 生的功能变体不再含有糖基化位点，但是仍能结合狂犬病病毒并且仍具有中和活性。功能变体可以通过本领域已知的一般分子生物学方法改变亲代结合分子或其部 分而获得，所述方法包括但非限于易错PCR、寡核苷酸指导的诱变和定点诱变。此外，功能变 体可具有互补固定活性，能有助于包膜的狂犬病病毒的裂解和/或作为调理素及增大对狂 犬病病毒的吞噬作用，通过促进Fc或Ob受体对其摄取或者通过凝集狂犬病病毒使其更易 于被吞噬而实现。另一方面，本发明包括免疫缀合物，即包含至少一种本文所述结合分子或其功能 变体并且进一步包含至少一种标记如可检测的部分/制剂的分子。本发明还涵盖了本发明 的免疫缀合物的混合物或者至少一种本发明的免疫缀合物与另一种分子如治疗剂或者另 一种结合分子或免疫缀合物的混合物。在另一个实施方案中，本发明的免疫缀合物可包含 一或多个标记。这些标记可以是彼此相同或者不同，并且可以与所述结合分子非共价地结 合/缀合。所述标记也可以通过共价键与所述结合分子直接结合/缀合，所述共价键包括但 非限于二硫键、氢键、静电键、重组融合和构象键合。或者，所述标记通过一或多种连接化合 物与所述键合分子结合/缀合。将标记与结合分子缀合的技术为本领域技术人员所熟知。本发明的免疫缀合物的标记可以是治疗剂，但优选是可检测的部分/制剂。包含 可检测制剂的免疫缀合物可诊断性用于例如评定对象是否感染了狂犬病病毒，或者用于监 测狂犬病病毒感染的发生或进展作为部分临床测试程序，以例如确定提供的治疗方案的效其它检测和/或分析和/或诊断目的。可检测的部分/制剂包括 但非限于酶、辅基、荧光物质、发光物质、生物发光物质、放射性物质、正电子发射金属及非 放射性顺磁性金属离子。用于标记结合分子以进行检测和/或分析和/或诊断的标记依赖于特异性检测/ 分析/诊断技术和/或使用的方法而定，所述方法如对(组织)样品进行的免疫组织化学 染色、流式细胞计量术检测、扫描激光器细胞计数检测、荧光免疫分析、酶联免疫吸附分析 (ELISA)、放射性免疫分析(RIA)、生物分析(例如中和化分析)、Western印迹等。对于组 织样品的免疫组织化学染色，优选的标记是催化可检测产物产生和局部沉积的酶。与结合 分子典型缀合以使其可以进行免疫组织化学显色的酶为本领域所熟知，包括但非限于乙酰 胆碱酯酶、碱性磷酸酶、β -半乳糖苷酶、葡萄糖氧化酶、辣根过氧化物酶和脲酶。产生和沉 积可目测的产物的典型底物也为本领域所熟知。随后，本发明的免疫缀合物可以使用胶体 金标记，或者它们可以用放射性同位素标记，如33P、32P、35SJH* 1251。本发明的结合分子可 以通过本领域熟知的方法通过螯合剂直接或者间接附着于放射性核素。当本发明的结合分子用于流式细胞计量术检测、扫描激光器细胞计数检测或者荧 光免疫分析时，其可以用荧光团标记。可用于荧光标记本发明的结合分子的众多荧光团为 本领域技术人员所已知。当本发明的结合分子用于使用标记的抗生物素蛋白、链霉亲和素、 captavidin或者neutravidin进行二级检测时，结合分子可以使用生物素标记以形成合适 的辅基复合物。当本发明的免疫缀合物用于体内诊断时，结合分子也可以通过与例如磁共振成像 (MRI)造影剂如二亚乙基三胺五乙酸钆、超声造影剂或者X线造影剂缀合或者通过放射性 同位素标记而可被检测到。此外，本发明的结合分子、其功能变体或者免疫缀合物也可以附着于固体支持物， 以特别用于体外免疫分析或者纯化狂犬病病毒或其片段。这种固体支持物可以是有孔或 者无孔的、平面或者非平面的，包括但非限于玻璃、纤维素、聚丙烯酰胺、尼龙、聚苯乙烯、 聚氯乙烯或者聚丙烯支持物。人结合分子也可例如与过滤介质缀合，如与NHS-活化的 Sepharose或者CNBr-活化的kpharose缀合以进行免疫亲和层析。它们也可以典型地通 过生物素一链霉亲和素相互作用而附着于顺磁性微球。所述微球可用于从含有狂犬病病毒 或其片段的样品中分离狂犬病病毒或其片段。另一个例子，本发明的人结合分子可附着于 用于ELISA的微滴定平板表面。本发明的结合分子或其功能变体可以与标记序列如促进纯化的肽融合。标记序列 的例子包括但不限于六组氨酸标记、血凝素(HA)标记、myc标记或者flag标记。 或者，抗体可以与第二种抗体缀合形成抗体异源缀合物。另一方面，本发明的人结 合分子可以与一或多种抗原缀合/附着。优选地，这些抗原是由给予了结合分子一抗原缀 合物的对象的免疫系统识别的抗原。所述抗原彼此可以相同或不同。将抗原与结合分子附 着的缀合方法为本领域所熟知，包括但非限于使用交联剂。人结合分子结合狂犬病病毒，附 着于人结合分子的抗原将引发对于该缀合物的强力T细胞进攻，最后导致狂犬病病毒的破 坏。 除了直接或者间接通过例如接头通过缀合而化学产生免疫缀合物，免疫缀合物也 可以作为包含本发明的人结合分子和合适标记的融合蛋白而产生。融合蛋白可以通过本领域已知的方法产生，例如通过框内构建包含编码人结合分子的核苷酸序列及编码合适标记 的核苷酸序列的核酸分子、然后表达所述核酸分子而重组产生。本发明的另一方面提供了编码至少一种本发明的结合分子或其功能变体的核酸 分子。这种核酸分子可用作中间物进行克隆，例如在上述亲和性成熟过程中。在一个优选 的实施方案中，所述核酸分子是分离的或者纯化的。技术人员意识到这些核酸分子的功能变体也是本发明的一部分。功能变体是用标 准遗传密码可以直接翻译的核酸序列，以提供与从亲代核酸分子中翻译的序列相同的氨基 酸序列。优选地，所述核酸分子编码包含⑶R3区、优选重链⑶R3区的结合分子，其包含选 自如下的氨基酸序列:SEQ ID N0:1、SEQ ID NO 2, SEQID NO :3、SEQ ID NO :4、SEQ ID NO: 5、SEQ ID NO :6, SEQID N0:7、SEQ ID N0:8、SEQ ID N0:9、SEQ ID NO: 10、SEQ ID NO :11、 SEQID NO :12, SEQ ID NO :13、SEQ ID NO :14、SEQ ID NO :15、SEQ ID NO :16、SEQ ID NO 17、SEQ ID NO :18、SEQ ID NO :19、SEQID NO :20、SEQ ID NO :21、SEQ ID NO :22、SEQ ID NO 23 禾口 SEQ ID NO :24。更优选地，所述核酸分子编码包含可变重链的人结合分子，所述可变重链包含选 自如下的氨基酸序列:SEQ ID NO :26、SEQ ID NO :27、SEQ ID NO :28、SEQ ID NO :29、SEQ ID NO :30、SEQ ID NO :31、SEQ ID NO :32、SEQ ID NO :33、SEQ ID NO :34、SEQ ID NO :35、 SEQ ID NO36,SEQ ID NO37,SEQ ID NO 38,SEQ ID NO39,SEQ ID NO40,SEQ ID N0: 41、SEQ ID NO :42、SEQ ID NO :43、SEQ ID NO :44、SEQ ID NO :45、SEQ ID NO :46、SEQ ID NO 47, SEQ ID NO 48和SEQ ID NO :49。在特别优选的实施方案中，所述核酸分子编码包 含可变重链的结合分子，所述可变重链基本上包含SEQID NO 335的第1_119位氨基酸的氨 基酸序列。在另一个实施方案中，所述核酸分子编码包含包含SEQ ID NO J6所示氨基酸序列 的可变重链及包含SEQ ID NO :50所示氨基酸序列的可变轻链的结合分子，或者编码包含 SEQ ID NO :27所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :51所示氨基酸序列的可变轻 链，或者编码包含SEQ ID NO 所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :52所示氨 基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ IDNO 29所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :53所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :30所示氨基酸序列的可 变重链及包含SEQ ID NO力4所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :31所 示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ IDNO 55所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含 SEQ ID NO :32所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :56所示氨基酸序列的可变轻 链，或者编码包含SEQ ID NO :33所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :57所示氨 基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQID NO 34所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :58所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :35所示氨基酸序列的可 变重链及包含SEQ ID NO :59所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :36所 示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ IDNO 60所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含 SEQ ID NO :37所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :61所示氨基酸序列的可变轻 链，或者编码包含SEQ ID NO :38所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :62所示氨 基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :39所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQID NO :63所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :40所示氨基酸序列的可 变重链及包含SEQ ID NO 64所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO 41所 示氨基酸序列的可变重链及包含SEQID NO 65所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含 SEQ ID NO :42所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :66所示氨基酸序列的可变轻 链，或者编码包含SEQ ID NO :43所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :67所示氨 基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :44所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :68所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :45所示氨基酸序列的可 变重链及包含SEQ ID NO :69所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :46所 示氨基酸序列的可变重链及包含SEQID NO 70所示氨基酸序列的可变轻链，或者编码包含 SEQ ID NO :47所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :71所示氨基酸序列的可变轻 链，或者编码包含SEQ ID NO :48所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :72所示氨 基酸序列的可变轻链，或者编码包含SEQ ID NO :49所示氨基酸序列的可变重链及包含SEQ ID NO :73所示氨基酸序列的可变轻链。在一个优选的实施方案中，所述核酸分子编码包含 可变重链和可变轻链的人结合分子，所述可变重链包含一种氨基酸序列，该氨基酸序列包 含SEQ ID NO :335的第1-119位氨基酸，所述可变轻链包含一种氨基酸序列，该氨基酸序列 包含SEQ IDNO 337的第1-107位氨基酸。在本发明的一个特定实施方案中，编码本发明结合分子可变重链的核酸分子基本 上包含选自如下的核苷酸序列:SEQ ID NO :74、SEQID NO :75、SEQ ID NO :76、SEQ ID NO 77,SEQ ID NO 78,SEQ IDNO 79,SEQ ID NO 80,SEQ ID NO :8USEQ ID NO 82,SEQ IDNO 83、SEQ ID NO :84、SEQ ID NO :85、SEQ ID NO :86、SEQ ID NO :87、SEQ ID NO :88、SEQ ID NO :89、SEQ ID NO :90、SEQ ID NO :91、SEQ ID NO :92、SEQ ID NO :93、SEQ ID NO :94、SEQ ID NO 95, SEQ ID NO 96和SEQ ID NO :97.优选地，编码本发明结合分子的可变重链的核 酸分子基本上包含一种核苷酸序列，该序列包含SEQ IDNO 334的第1-357位核苷酸。在本发明的另一个特定实施方案中，编码本发明结合分子的可变轻链的所述核酸 分子基本上包含选自如下一组的核苷酸序列SEQID NO 98, SEQ ID NO 99、SEQ ID NO: 100,SEQ ID NO 101,SEQID NO :102、SEQ ID NO 103,SEQ ID NO 104、SEQ ID NO :105、SEQ ID NO :106,SEQ ID NO 107,SEQ ID NO 108,SEQ ID NO 109,SEQ ID NO 110,SEQ ID NO: 111、SEQ ID NO :112、SEQ ID NO :113、SEQ ID NO :114、SEQ ID NO :115、SEQ ID NO :116、 SEQ ID NO :117,SEQ ID NO 118、SEQ ID NO 119,SEQ ID NO :120 禾口 SEQ IDNO :121。优选 地，编码本发明人结合分子的可变轻链的核酸分子基本上包含一种核苷酸序列，该核苷酸 序列包含SEQ ID NO 336的第1-321位核苷酸。本发明的另一方面提供了包含本发明的一或多种核酸分子的载体，即核酸构建 体。载体可以衍生自质粒，如F、Rl、RPl、Col、pBR322、T0L, Ti等；粘粒；噬菌体，如λ噬 菌体、λ 类噬菌体、] 13、]\111、？1、？22、00、11-6￥611、11-0(1(1、12、14、17等；植物病毒，如苜蓿 花叶病毒、雀麦花叶病毒、毛状病毒组(capillovirus)、香石竹潜病毒组(carlavirus)、 香石竹斑驳病毒组(carmovirus)、caulivirus、线形病毒组(clostervirus)、豇豆花叶病 毒组(comovirus)、隐病毒(cryptovirus)、南瓜花叶病毒组(cucumovirus)、香石竹环斑 病毒组(dianthovirus)、蚕豆萎蔫病毒组(fabavirus)、斐济病毒组(fi jivirus)、真菌 传棒状病毒组(furovirus)、双粒病毒组(geminivirus)、大麦病毒(hordeivirus)、等轴不稳定环斑病毒组(ilarvirus)、黄矮病毒组(Iuteovirus)、machlovirus、玉米雷亚多非 纳病毒组(marafivirus)、坏死病毒组(necrovirus)、线虫传多面体病毒(η印ovirus)、 phytor印virus、植物弹状病毒、马铃薯X病毒组(potexvirus)、马铃薯Y病毒组 (potyvirus)、南方菜豆花叶病毒组(sobemovirus)、水稻条纹叶枯病毒组(tenuivirus)、 烟草花叶病毒(tobamovirus)、烟草脆裂病毒组(tobravirus)、番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus)、番爺丛矮病毒(tombusvirus)、菜菁黄花叶病毒组(tymovirus) 等；或者动物病毒，如腺病毒、沙粒病毒科、杆状病毒科、双RNA病毒科、布尼安病毒科 (bunyaviridae)、杯状病毒禾斗(calciviridae)、心病毒属(cardioviruses)、冠形病毒禾斗、 被盖病毒科、囊状病毒科、Epstein-Barr病毒、肠道病毒、线状病毒科、黄病毒科、足口病病 毒(Foot-and-Mouthdisease virus)、嗜肝DNA病毒科、肝炎病毒、疱疹病毒科、免疫缺陷 病毒、流感病毒、丝状病毒科、虹彩病毒科、正粘病毒科、乳多空病毒、副粘病毒科、细小病毒 科、小RNA病毒科、脊髓灰质炎病毒、多DNA病毒科、痘病毒科、呼肠孤病毒科、反转录病毒、 弹状病毒科、鼻病毒、Semliki !^rest病毒、四病毒科、披膜病毒科、toroviridae、痘苗病 毒、疱疹性口腔炎病毒等。载体可用于克隆和/或表达本发明的人结合分子，甚至可以用于 基因治疗。与一或多种表达调节核酸分子可操纵地连接的、包含本发明的一或多种核酸分 子的载体也涵盖在本发明范围内。载体的选择依赖于重组方法及使用的宿主。将载体导入 宿主细胞中可以通过磷酸钙转染、病毒感染、DEAE-葡聚糖介导的转染、lipofectamine转 染或者电穿孔进行。载体可自主复制或者可以与其导入的染色体一起复制。优选地，所述 载体含有一或多个选择标记。标记的选择可依赖于选择的宿主细胞，尽管这对于本发明无 关紧要并且为本领域技术人员所熟知。所述标记包括但非限于卡那霉素、新霉素、嘌呤霉 素、潮霉素、zeocin、来自单纯疱疹病毒的胸苷激酶基因(HSV-TK)、小鼠二氢叶酸还原酶基 因(dhfr)。本发明还包括包含编码人结合分子的一或多种核酸分子的载体，其与编码可用 于分离结合分子的蛋白质或肽的一或多个核酸分子可操纵地连接。这些蛋白质或肽包括但 非限于谷胱苷肽-S-转移酶、麦芽糖结合蛋白、金属结合多组氨酸、绿色荧光蛋白、荧光素 酶和β-半乳糖苷酶。 本发明另一方面涉及含有上述载体的一或多个拷贝的宿主。优选地，所述宿主是 宿主细胞。宿主细胞包括但非限于哺乳动物、植物、昆虫、真菌或细菌来源的细胞。细菌细 胞包括但非限于革兰氏阳性细菌，如芽孢杆菌属(Bacillus)、链霉菌属(Sti^ptomyces) 和葡萄球菌属Staphylococcus)的一些菌种，或者革兰氏阴性细菌如埃希氏菌属 (Escherichia)的一些菌种，如大肠杆菌(E. coli)及假单胞菌属(Pseudomonas)。在 真菌细胞中优选使用酵母细胞。在酵母中的表达可以通过使用酵母株如巴斯德毕赤氏 酵母(Pichia pastoris)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和多形汉逊氏酵母 (Hansenulapolymorpha)进行。此外，昆虫细胞如果蝇细胞和Sf9细胞可以用作宿主细胞。 除此之外，宿主细胞可以是植物细胞。通过已知方法产生的转化(转基因)的植物或者植 物细胞，例如农杆菌介导的基因转移、叶盘转化、通过聚乙二醇诱导的DNA转移的原生质体 转化、电穿孔、超声、显微注射或者bolistic基因转移。另外，合适的表达系统可以是杆状 病毒系统。本发明优选使用哺乳动物细胞如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、COS细胞、BHK细 胞或者Bowes黑素瘤细胞的表达系统。哺乳动物细胞提供的表达的蛋白质具有与哺乳动 物天然分子最相似的翻译后修饰。由于本发明涉及给予人体的分子，因此特别优选完全的人表达系统。因此，更优选宿主细胞是人细胞。人细胞的例子是HeLa、911、AT1080、AM9、 293和HEK293T细胞。优选的哺乳动物细胞是人视网膜细胞如911细胞，或者是于1996 年2月29日保藏在欧洲动物细胞保藏中心(ECACC ；CAMR, Salisbury, Wiltshire SP40JG， Great Britain)的细胞系，保藏号为 9602^40，以PER.C6 商标销售(PER. C6 是 Crucell Holland B. V.的注册商标)。在本申请中，“PER. C6”是指以保藏号9602^40保藏的细胞， 或者祖细胞、上游或者下游传代以及来自保藏的细胞祖先的后代，以及前述任何细胞的衍 生物。在优选的实施方案中，人生产细胞包含可表达形式的编码腺病毒El区域的核酸 序列的至少功能部分。在更优选的实施方案中，所述宿主细胞衍生自人视网膜，并且用包含 腺病毒El序列的核酸无限增殖化，如于1996年2月四日以保藏号9602^40保藏在欧洲 动物细胞保藏中心(ECACC;CAMR，Salisbury, Wiltshire SP4 OJG, GreatBritain)的细胞 系，商标为PER.C6 。宿主细胞中重组蛋白质的产生可以根据本领域熟知的方法进行。以 商标PER.C6 销售的细胞作为感兴趣蛋白质的生产平台的应用已经在WO 00/63403中描 述，所述文献在此以其全文并入作参考。产生本发明的结合分子或功能变体的方法是本发明的另一部分。所述方法包括 如下步骤a)在有益于结合分子或其功能变体表达的条件下培养本发明的宿主，及b)任选 地，回收表达的结合分子或其功能变体。表达的结合分子或其功能变体可以从无细胞提取 物中回收，但优选从培养基中回收。从无细胞提取物或者培养基中回收蛋白质如结合分子 的方法为本领域技术人员所熟知。可通过上述方法获得的结合分子或者其功能变体也是本 发明的一部分。或者，在宿主如宿主细胞中表达之后，本发明的结合分子或其功能变体可以通过 常规肽合成仪合成产生，或者使用衍生自本发明的DNA分子的RNA核酸在无细胞翻译系统 中产生。可通过上述合成产生方法或者无细胞翻译系统获得的结合分子或其功能变体也是 本发明的一部分。在另一个实施方案中，本发明的结合分子或其功能变体可以通过转基因非人哺乳 动物产生，例如表达人免疫球蛋白基因的转基因小鼠或者兔。优选地，所述转基因非人哺 乳动物具有一个基因组，该基因组包含编码上述所有或部分人结合分子的人重链转基因和 人轻链转基因。所述转基因非人哺乳动物可以用纯化的或者浓缩的狂犬病病毒或其片段制 品免疫。免疫非人哺乳动物的方案为本领域所熟知。lming Antibodies =A Laboratory Manual, Edited by :E. Harlow, D.Lane (1998), Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York 及 Current Protocols in Immunology, Edited by J. E. Coligan, A. M. Kruisbeek, D. H. Margulies, E. M. Shevach,ff. Strober(2001)，Johnffiley & Sons Inc. , New ^rk所描述，所述文献在此并入作参考。另一方面，本发明提供了一种鉴别能特异性结合狂犬病病毒的结合分子如本发明 人单克隆抗体或其片段或者本发明的核酸分子的方法，所述方法包括如下步骤a)将可复 制的遗传包装表面上的结合分子集合与狂犬病病毒或其片段在有益于结合的条件下接触， b)至少选择一次与狂犬病病毒或其片段结合的可复制遗传包装，及c)分离并回收与狂犬 病病毒或其片段结合的可复制遗传包装。所述选择步骤可以在存在狂犬病病毒的条件下进行。所述狂犬病病毒可以是分离的或者是非分离的，例如存在于感染个体的血清和/或血液中。在另一个实施方案中，所述 狂犬病病毒是灭活的。或者，所述选择步骤可以在存在狂犬病病毒片段如狂犬病病毒胞外 部分、衍生自狂犬病病毒的一或多种(多)肽如G蛋白、包含这些蛋白质或(多)肽的融合 蛋白等的条件下进行。在另一个实施方案中，用狂犬病病毒G蛋白转染的细胞用于选择程序。再一方面，本发明提供了一种获得本发明的结合分子或者核酸分子的方法，其中 所述方法包括如下步骤a)进行上述鉴别结合分子的方法，所述结合分子如本发明的人单 克隆抗体或其片段或者本发明的核酸分子，及b)从回收的可复制遗传包装中分离所述结 合分子和/或编码所述结合分子的核酸。一旦使用上述鉴别结合分子或者编码结合分子的 核酸分子的方法确定或者鉴别了新的单克隆抗体，则编码scFv或Fab的DNA可以从细菌或 者可复制遗传包装中分离，组合标准的分子生物学技术产生编码二价scFv或者具有所需 特异性的全部人免疫球蛋白(例如IgG、IgA或者IgM)的构建体。这些构建体可以转染进 合适的细胞系中，产生完全的人单克隆抗体(见Huls et al. ,1999 ；Boel et al.，2000)。本文所用可复制遗传包装applicable genetic package)可以是原核或者真核 生物，包括细胞、孢子、细菌、病毒、(细菌)噬菌体和多核糖体。优选的可复制遗传包装是 噬菌体。人结合分子如单链Fv' s在可复制的遗传包装上展示，即它们附着于位于可复制 遗传包装外表面的基团或者分子上。可复制遗传包装是一种包含被筛选的人结合分子的可 筛选单位，其与编码结合分子的核酸分子连接。所述核酸分子应该是可在体内(例如载体) 或者体外(例如通过PCR、转录和翻译)复制的。在体内复制可以是自发的(对于细胞)， 在宿主因子的帮助下(对于病毒)或者在宿主和辅助病毒二者的帮助下(对于噬菌粒)复 制。展示人结合分子集合的可复制遗传包装是通过将被展示的编码外源结合分子的核酸分 子导入可复制遗传包装的基因组中，与通常在可复制遗传包装外表面表达的内源蛋白形成 融合蛋白而形成的。融合蛋白的表达、转运至外表面及装配导致外源结合分子在可复制遗 传包装的外表面展示。本发明再一方面涉及能结合狂犬病病毒或其片段并且可通过上述鉴 别方法获得的人结合分子。本发明另一方面涉及一种鉴别潜在具有狂犬病病毒中和活性的结合分子的方法， 所述方法包括如下步骤(a)将可复制遗传包装表面上的结合分子集合与狂犬病病毒在有 益于结合的条件下接触，(b)从未结合的结合分子中分离和回收与狂犬病病毒结合的结合 分子，(C)分离至少一种回收的结合分子，(d)检验分离的结合分子是否具有狂犬病病毒中 和活性，特征在于步骤a中所述狂犬病病毒被灭活。灭活的狂犬病病毒在被灭活之前可以 纯化。可以利用本领域熟知的适于病毒的纯化方法进行纯化，例如通过甘油垫(glycerol cushion)离心。步骤a中灭活的狂犬病病毒在使用之前可以固定在合适的材料上。或者， 步骤a中的狂犬病病毒仍可以是活性的。在另一个实施方案中，在步骤a中使用狂犬病病 毒的片段，如一种狂犬病病毒的多肽如G蛋白。在另一个实施方案中，使用经狂犬病病毒G 蛋白转染的细胞选择潜在具有狂犬病病毒中和活性的结合分子。如本文所示，当表达狂犬 病病毒G蛋白的细胞包括在选择方法中时，选择的中和抗体的数目与其中仅使用纯化的狂 犬病病毒G蛋白和/或灭活的狂犬病病毒的选择方法相比是比较高的。在另一个实施方案中，上述鉴别潜在具有狂犬病病毒中和活性的结合分子的方法 进一步包括分离和回收及任选分离含有可变重链3-30种系基因的人结合分子的步骤。本领域技术人员可以通过本领域已知的方法鉴别特异的种系基因，例如通过核苷酸测序。分 离和回收含有可变重链3-30种系基因的结合分子的步骤可以在步骤c之前或者之后进行。 如下文所示，本发明的大多数中和狂犬病病毒的人单克隆抗体包含这种特异性Vh种系基 因。鉴别和获得(中和)结合分子例如抗体的噬菌体展示方法是本领域技术人员熟 知的方法。例如在美国专利 No. 5，696，108 ;Burton andBarbas, 1994 ；de Kruif et al.， 1995b ；及 Phage Display :A LaboratoryManual. Edited by :CF Barbas, DR Burton, JK Scott and GJ Silverman(2001), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NewYork中描述。这些文献在此均以其全文并入作参考。为了构建噬菌体展示文库，例如以单链Fv (scFv)或者Fab形式将人单克隆抗体重 链和轻链可变区基因集合在噬菌体、优选丝状噬菌体颗粒的表面上表达(见de Kruif et al.，1995b)。表达抗体片段的噬菌体大型文库典型含有1.0X109以上的抗体特异性，并且 可以从在免疫的或未免疫的个体的B淋巴细胞中表达的免疫球蛋白V区中装配。在本发明 的一个特定实施方案中，人结合分子的噬菌体文库、优选scFv噬菌体文库，是从分离自细 胞的RNA中制备的，所述细胞得自已经针对狂犬病进行免疫接种或者暴露于狂犬病病毒的 对象。RNA可以分离自骨髓或者外周血，优选分离自外周血淋巴细胞。所述对象可以是接种 了或者暴露于狂犬病病毒的动物，但优选是已经接种或者已经暴露于狂犬病病毒的人。优 选所述人对象已经进行了免疫接种。本发明的另一方面包括上述可复制遗传包装表面上的 人结合分子集合，如scFv噬菌体文库。或者，噬菌体展示文库可以从免疫球蛋白可变区中构建，其已经在体外部分装配 以在文库(半合成文库)中导入额外的抗体多样性。例如，体外装配的可变区在对于抗体 特异性重要的那些分子区域例如CDR区域中含有合成产生的、随机化的或者部分随机化的 DNA序列。狂犬病病毒特异性噬菌体抗体可以选自文库，通过将靶抗原如来自狂犬病病毒的 抗原固定在固相上，随后将靶抗原暴露于噬菌体文库以使得可以与表达特异于固相上结合 的抗原的抗体片段的噬菌体结合。通过洗涤除去未结合的噬菌体，将结合的噬菌体从固相 洗脱以感染大肠杆菌并随后进行增殖。通常需要多轮选择和增殖以足以富集特异性结合靶 抗原的噬菌体。在将噬菌体文库暴露于靶抗原之前，如果需要，首先可通过将噬菌体文库暴 露于与固相结合的非靶抗原而进行扣除。噬菌体也可以针对与复合抗原的结合而选择，所 述复合抗原如狂犬病病毒蛋白或(多)肽的混合物、表达一或多种狂犬病病毒蛋白或(多) 肽的宿主细胞或者(灭活的)狂犬病病毒自身。抗原特异性噬菌体抗体可以从文库中选择， 通过将其上结合了灭活的狂犬病病毒制品的固相与噬菌体抗体文库保温，以使得例如噬菌 体的scFv或者Fab部分与狂犬病病毒制品的蛋白/多肽结合而进行。在保温及几次洗涤以 除去未结合的和松散附着的噬菌体之后，洗脱已经与该制品的scFv或Fab部分结合的噬菌 体，并用于感染大肠杆菌以扩增新的特异性。通常，需要进行一或多轮选择以从大量未结合 噬菌体中分离感兴趣的噬菌体。或者，可以将已知的狂犬病病毒蛋白或(多)肽在宿主细胞 中表达，这些细胞可用于选择特异于所述蛋白质或(多)肽的噬菌体抗体。使用这些宿主细 胞的噬菌体展示方法可以通过在筛选期间通过加入过量的不包含靶分子或者与靶分子相 似但不相同的非靶分子的宿主细胞扣除不相关的结合物而扩展和改良，从而显著增加发现 相关结合分子的机会(这种方法称作MAbstract 方法，MAbstract 是CrucelIHollandB. V.的注册商标，也见并入本文作参考的美国专利No. 6，265, 150所述)。另一方面，本发明提供了包含本发明的至少一种结合分子、至少一种其功能变体 或片段、至少一种免疫缀合物或者其组合的组合物。所述组合物可进一步包含稳定分子，如 白蛋白或者聚乙二醇，或者盐。优选地，使用的盐是保留人结合分子的所需生物学活性但 无任何非所需的毒性作用的盐。如果需要，本发明的人结合分子可以包被在一种材料中或 用一种材料包被，以保护其免于酸或者可以使结合分子灭活的其它天然或非天然条件的作 用。再一方面，本发明提供了包含本发明至少一种核酸分子的组合物。所述组合物可 包含水溶液如含有盐(例如NaCl或者如上述盐)、去污剂(例如SDS)和/或其它合适成分 的水溶液。此外，本发明涉及药物组合物，其包含本发明的至少一种结合分子、至少一种其功 能变体或片段、至少一种免疫缀合物、至少一种组合物或其组合。本发明的药物组合物进一 步包含至少一种药物可接受的赋形剂。在一个优选的实施方案中，本发明的药物组合物包含至少一种额外的结合分子， 即所述药物组合物可以是结合分子的cocktail/混合物。所述药物组合物可以包含本发明 的至少两种结合分子，或者包含至少一种本发明的结合分子和至少一种另外的抗狂犬病病 毒结合分子。所述另外的结合分子优选包含⑶R3区，该CRD3区包含SEQ ID N0:25所示氨 基酸序列。包含包含SEQ ID NO :25所示氨基酸序列的CDR3区的结合分子可以是一种嵌合 的或者人源化的单克隆抗体或其功能片段，但优选是人单克隆抗体或其功能片段。在一个 实施方案中，所述结合分子包含重链可变区，该重链可变区包含SEQ ID NO :273所示氨基酸 序列。在另一个实施方案中，所述结合分子包含轻链可变区，该轻链可变区包含SEQ ID NO 275所示氨基酸序列。在另一个实施方案中，所述结合分子包含分别包含SEQ ID NO 123 和SEQ IDNO :125所示氨基酸序列的重链和轻链。药物组合物中的结合分子应该能与狂犬 病病毒的不同的、非竞争的表位反应。所述表位可以存在于狂犬病病毒的G蛋白上，可以是 不同的非重叠的表位。所述结合分子应该是高亲和性的，并且应该具有广泛的特异性。优 选地，它们中和尽可能多的狂犬病病毒固定毒株和街毒。更优选地，它们还呈现对狂犬病毒 属其它基因型或者甚至弹状病毒科其它病毒的中和活性，而与其它病毒或者正常的细胞蛋 白无交叉反应性。优选地，所述结合分子能中和混合物中其它结合分子的逃逸变体。本发明的另一方面涉及一种药物组合物，其包含至少两种中和狂犬病病毒的结合 分子，优选本发明的人结合分子，特征在于所述结合分子能与狂犬病病毒的不同的、非竞争 的表位反应。在一个实施方案中，所述药物组合物包含第一种中和狂犬病病毒的结合分子 和第二种中和狂犬病病毒的结合分子，所述第一种结合分子能与位于狂犬病病毒G蛋白的 抗原位点I的表位反应，所述第二种结合分子能与位于狂犬病病毒G蛋白的抗原位点III 的表位反应。狂犬病病毒糖蛋白的抗原结构最初由Lafon et al. (1983)阐述。抗原位点 是使用一组小鼠mAb及其各自的mAb抗性病毒变体鉴别的。此后，抗原位点已经通过鉴别 mAb抗性变体的糖蛋白中氨基酸突变而作图(见^iif et al. ,1985 ；Prehaud et al.，1988 ； 和Benmansour et al.，1991)。大多数狂犬病中和mAb针对抗原位点II (见Benmansour et al.，1991)，其是包含氨基酸34_42和氨基酸198-200的一个不连续的构象表位(见 Prehaud et al.，1988)。抗原位点III是在氨基酸330-338的一个连续构象表位并且具有两个荷电残基K330和R333，影响病毒的致病性(见kif et al. ,1985 ；Coulon et al.， 1998 ；和Dietzschold et al.，1983)。仅有一个mAb，509-6限定了构象抗原位点I，位于第 231 位氨基酸(见 Benmansour et al.，1991 ；和 Lafon et al.，1983)。已知抗原位点 IV 具 有重叠线性表位(见 Tordo，1996 ；Bunschoten et al.，1989 ；Luo et al.，1997 ；和 Ni et al. ,1995) ο Benmansour et al. (1991)还描述了位于第342-343位的一个小位点的存在， 尽管其与抗原位点III紧邻，但与其截然不同。CR-57表位与目前已知的狂犬病病毒糖蛋白 上的线性和构象中和表位的序列对比(图10)表明CR-57表位位于与构象抗原位点I相同 的区域中，由单一的mAb 509-6限定。基于CR04-098的逃逸病毒糖蛋白的核苷酸序列和氨 基酸序列，由这种抗体识别的表位看起来位于与连续构象抗原位点III相同的区域中。在一个优选的实施方案中，所述药物组合物包含第一种中和狂犬病病毒的结合分 子和第二种中和狂犬病病毒的结合分子，所述第一种结合分子包含至少一个CDR3区、优选 重链⑶R3区，其包含SEQ IDNO 25所示氨基酸序列，第二种结合分子包含至少一个⑶R3 区、优选重链CDR3区，其包含选自如下的氨基酸序列SEQ ID NO :4、SEQ ID NO :10、SEQ ID NO :14, SEQ ID NO 15、SEQ ID N0:16 禾口 SEQ ID NO :22。更优选地，第二种中和狂犬病病 毒的结合分子包含至少一个⑶R3区、优选重链⑶R3区，其包含SEQ ID N0:14所示氨基酸 序列。优选地，第一种中和狂犬病病毒的结合分子包含分别包含SEQ ID NO :123和SEQ ID NO :125所示氨基酸序列的重链和轻链，第二种中和狂犬病病毒的结合分子包含分别包含 SEQ ID NO :335和SEQ ID NO :337所示氨基酸序列的重链和轻链。优选地，第一种中和狂 犬病病毒的结合分子的重链和轻链分别由SEQ ID NO :122和SEQID NO :1 编码，第二种中 和狂犬病病毒的结合分子的重链和轻链分别由SEQ ID NO :334和SEQ ID NO :336编码。包含两种结合分子的药物组合物(其中结合分子的Pi不同)当选择使这两种结 合分子均最佳稳定的合适缓冲液时有困难。当调节所述组合物的缓冲液的PH以增加一种 结合分子的稳定性时，这将降低另一种结合分子的稳定性。结合分子的稳定性降低甚至不 稳定可导致其沉淀或者聚集，或者导致其自发降解，引起结合分子的功能性丧失。因此， 本发明的另一方面提供了包含至少两种结合分子、优选人结合分子的药物组合物，特征在 于所述结合分子的等电点(Pl)彼此不同，小于大约1.5、1.4、1.3、1.2、1. 1、1. 0、0. 9、0. 8、 0. 7,0. 6,0. 5,0. 4,0. 3，优选小于(包括)0. 25pl单位。pi可以通过实验测定，例如利用等 电聚焦，或者基于结合分子的氨基酸序列计算。在一个实施方案中，所述结合分子是本发明 的结合分子，所述药物组合物是本发明的药物组合物。优选地，所述结合分子是单克隆抗 体，例如人单克隆抗体如IgGl抗体。优选地，所述结合分子能结合和/或中和一种感染因 子，例如病毒、细菌、酵母、真菌或者寄生虫。在一个实施方案中，所述结合分子能结合和/ 或中和狂犬病毒属病毒，例如狂犬病病毒。在一个特定实施方案中，两种结合分子的计算出 的pi均在8. 0-9. 5、优选8. 1-9. 2、更优选在8. 2-8. 5之间。优选地，所述结合分子分别具 有 SEQ ID NO 14 和 SEQ ID NO 25 所示的重链 CDR3 区。在另一个实施方案中，本发明提供了两或多种人或其它动物结合分子包括但非限 于抗体的混合物，其中至少一种结合分子衍生自抗体噬菌体或者其它可复制包装展示技 术，至少一种结合分子可通过杂交瘤技术获得。当使用不同的技术时，选择具有相容Pl的 结合分子对于获得组合物是非常有益的，其中每种结合分子均是足够稳定的以便于贮存、 处理和随后的应用。
在另一个实施方案中，本发明的药物组合物中存在的结合分子彼此增强了中和活 性，即当将它们组合时协同起作用。换句话说，所述药物组合物可呈现狂犬病病毒及甚至狂 犬病毒属病毒的协同中和活性。如本文所用术语“协同”是指结合分子当组合应用时的组 合作用高于其单独应用时作用的加和。本发明的药物组合物成分的范围和比率应基于其各 自的效力确定，并且在体外中和分析或者动物模型如仓鼠中测试。此外，本发明的药物组合物可包含至少一种其它的治疗、预防和/或诊断剂。所述 另外的治疗和/或预防剂可以是抗病毒制剂如病毒唑或者α-干扰素。本发明的结合分子或药物组合物在用于人体之前可以在合适的动物模型系统中 测试。这种动物模型系统包括但非限于小鼠、大鼠、仓鼠、猴等。典型地，药物组合物必需是无菌的及在生产和贮存条件下是稳定的。本发明的人 结合分子、其变体或片段、免疫缀合物、核酸分子或者组合物可以是粉末形式，在给予之前 或在给予时在合适的药物可接受的赋形剂中重建(reconstitution)。在制备无菌可注射溶 液的无菌粉末情况中，优选的制备方法是真空干燥和冷冻干燥(冻干)，这样产生活性成分 加上来自预先过滤灭菌溶液的任何其它所需成分的粉末。或者，本发明的结合分子、其变体或片段、免疫缀合物、核酸分子或者组合物可以 于溶液中，在给予之前或者给予时可以加入和/或混合合适的药物可接受的赋形剂以提供 单位剂量的可注射形式。优选地，本发明中使用的药物可接受的赋形剂适合高药物浓度，可 以保持适当的流动性，如果需要的话可以延缓吸收。给予所述药物组合物的最佳途径的选择受到许多因素的影响，包括组合物中活性 分子的物理-化学性质、临床状况的紧急程度及活性分子的血浆浓度与所需治疗作用之间 的关系。例如，如果需要，本发明的人结合分子可以与载体一起制备，这样将保护其免于迅 速释放，如控制释放制剂，包括植入体、经皮贴片及微囊化输送系统。可以使用可生物可降 解的、生物相容的聚合物，如乙烯醋酸乙烯酯、聚酐类、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯和聚乳酸。 此外，可以用防止人结合分子灭活的材料或混合物包被人结合分子或者与其共同给予。例 如，人结合分子可以在合适的载体例如脂质体或者稀释剂中给予对象。给予途径通常可分为两种主要方式，口服和胃肠外给予。本发明的人结合分子和 药物组合物的优选给予方式是给予伤口内和周围及臀肌区肌内注射。人结合分子和药物组 合物的配制依赖于给予途径。另一方面，本发明的结合分子、功能变体、免疫缀合物、组合物或者药物组合物可 以用作药物。因此，本发明另一方面提供了一种使用本发明的人结合分子、功能变体、免疫 缀合物、组合物或者药物组合物的治疗和/或预防狂犬病毒属病毒感染的方法。所述狂犬 病毒属病毒可以是任何已知基因型的病毒，但优选是狂犬病病毒。上述分子或组合物可以 用于狂犬病的暴露后预防中。上述分子或组合物可与可用于诊断、预防和/或治疗狂犬病病毒的其它分子联 合应用。它们可以在体外、离体或在体内应用。例如，本发明的人结合分子、功能变体、免 疫缀合物或者药物组合物可以与狂犬病疫苗共同给予。或者，所述疫苗也可以在给予本发 明的分子或组合物之前或者之后给予。给予本发明的分子或组合物及疫苗适于暴露后预 防。狂犬病疫苗包括但非限于纯化的鸡胚细胞(PCEC)疫苗(RabAvert)、人二倍体细胞疫苗 (HDCV ；Imovax vaccine)或者吸附的狂犬病疫苗(RVA)。
本发明的组合物和药物组合物中的分子是以治疗或者诊断有效量典型配制的。 可以调节剂量方案以提供最佳的所需应答(例如治疗应答)。合适的剂量范围可例如是 0. l-100IU/kg 体重，优选 1. 0-50IU/kg 体重，更优选 10-30IU/kg 体重，如 20IU/kg 体重。优选地，给予单一推注(bolus)本发明的结合分子或者药物组合物。本发明的分 子和药物组合物优选是无菌的。本领域熟知使得这些分子和组合物无菌的方法。暴露后预 防的给药方案是在先前未接种狂犬病病毒疫苗的个体在暴露后第0、3、7、14和观天肌内给 予5剂狂犬病疫苗。本发明的人结合分子或者药物组合物应该在第0天给予伤口中和伤口 周围，或者在暴露后尽快给予，在远离接种的部位肌内给予剩余的体积。未接种的个体给予 抗狂犬病病毒人结合分子，但技术人员清楚需要这种治疗的接种个体也可以给予抗狂犬病 病毒人结合分子。另一方面，本发明涉及本发明的结合分子或其功能变体、免疫缀合物、核酸分子、 组合物或者药物组合物在制备诊断、预防、治疗或组合用于得自狂犬病毒属病毒感染的疾 病的药物中的应用。所述狂犬病毒属病毒可以是任何已知基因型的病毒，但优选是狂犬病 病毒。优选上述分子用于制备狂犬病暴露后预防的药物中。本发明还提供了试剂盒，所述试剂盒包含本发明的至少一种结合分子、至少一种 其功能变体、至少一种免疫缀合物、至少一种核酸分子、至少一种组合物、至少一种药物组 合物、至少一种载体、至少一种宿主，或者其组合。任选地，本发明的试剂盒的上述组分包装 在合适的容器中，并标记了诊断、预防和/或治疗的指定疾病。上述组分可以贮存在单位剂 量或者多剂量容器中，例如密封的安瓿、小瓶、瓶子、注射器和试管中，是水相优选无菌溶液 或者是用于重建的冻干的优选无菌的制剂。所述容器可以由多种材料制成，如玻璃或者塑 料，可以具有一个无菌的进入口(例如该容器可以是具有可用皮下注射针刺穿的塞子的静 脉内注射溶液袋或者小瓶)。所述试剂盒另外包含包含药物可接受的缓冲液如磷酸盐缓冲 盐水、Ringer' s溶液和葡萄糖溶液的多个容器。所述试剂盒可进一步包括商业上和使用 者需要的其它材料，包括用于一或多种合适宿主的其它缓冲剂、稀释剂、过滤器、针头、注射 器、培养基。所述试剂盒中通常在治疗、预防或诊断产品的商业包装中附带使用说明书，说 明书中含有关于例如这种治疗、预防或诊断产品的适应症、使用、剂量、生产、给予、禁忌症 和/或使用注意事项的信息。目前，HRIG产品用于狂犬病暴露后预防。1500IU的成人剂量HRIG仅在IOml体积 中提供(75kg个体，20IU/kg)。更浓缩的HRIG产品是不可能的，因为目前可获得的IOml剂 量含有l-1.5g的总IgG。鉴于目前HRIG产品具有两个缺点。首先，其通常在解剖学上不 适合在咬伤伤口中和其周围给予推荐的完全剂量，其次，目前给予的HRIG的体积与明显的 疼痛相关。本发明提供了解决这些缺点的方法，本发明提供了一种药物组合物，其包含大约 2ml或更少体积(如果需要)的全部成人剂量。这种药物组合物可包含例如能中和狂犬病 病毒的两种结合分子，优选CR57和CR04-098。所述药物组合物进一步包含一种药物可接 受的赋形剂，体积为大约ani。可以有更大的体积，但是考虑到与注射更大体积相关的疼痛 因此不希望更大的体积。低于2ml也是可能的。所述药物组合物包含成功进行暴露后预防 需要的全部成人剂量(IU)。在一个实施方案中，所述药物组合物贮存在IOml小瓶中，例如 IOml的具有塞子的ready-to-use小瓶(I型玻璃)中。通过提供IOml小瓶，在个体存在较 大创伤表面积的情况中可以选择将药物组合物稀释为更大体积。本发明还提供了一种试剂盒，其包含至少一个包含药物组合物的容器(例如小瓶)。所述试剂盒可进一步包含具有适 于将药物组合物稀释为更大体积的稀释剂的第二种容器。合适的稀释剂包括但非限于药物 组合物的药物可接受的赋形剂和盐水溶液。此外，所述试剂盒可包含稀释该药物组合物的 说明书和/或给予稀释或未稀释的该药物组合物的说明书。本发明进一步涉及一种检测样品中狂犬病病毒的方法，所述方法包括如下步骤 a)将样品与诊断有效量的本发明的结合分子、功能变体或免疫缀合物接触，及b)确定所述 结合分子、功能变体或者免疫缀合物是否特异性结合样品的分子。所述样品可以是生物学 样品，包括但非限于(潜在)感染对象的血液、血清、组织或者其它生物学材料。所述(潜 在)感染的对象可以是人，但是对怀疑是狂犬病病毒携带者的动物也可以使用本发明的人 结合分子、功能变体或者免疫缀合物测试狂犬病病毒的存在与否。首先对样品进行操纵，使 其更适合检测方法。操纵意味着对怀疑含有和/或含有狂犬病病毒的样品进行处理，由此 狂犬病病毒分解为抗原成分如蛋白质、(多)肽或者其它抗原片段。优选地，将本发明的结 合分子、功能变体或者免疫缀合物与该样品在使得人结合分子与样品中可能存在的狂犬病 病毒或者其抗原成分之间形成免疫复合物的条件下接触。如果免疫复合物形成则表明该样 品中存在狂犬病病毒，然后通过合适方式检测并测定。这种方法包括均质(homogeneous) 和异质(heterogeneous)结合免疫分析，如放射性免疫分析(RIA)、ELISA、免疫荧光、免疫 组织化学、FACS, BIAC0RE和Western印迹分析。此外，本发明的结合分子可用于鉴别狂犬病病毒蛋白如G蛋白的表位。所述表位 可以是线性的，但也可以是结构和/或构象的。在一个实施方案中，本发明的结合分子与狂 犬病病毒蛋白如狂犬病病毒G蛋白的一系列重叠肽如15-mer肽的结合可以利用PEPSCAN 分析(见 WO 84/03564,WO 93/09872,Slootstra et al. 1996)。人结合分子与每种肽的结 合可以在基于PEPSCAN的酶联免疫吸附测定(ELISA)中检测。在另一个实施方案中，可以 对包含狂犬病病毒蛋白的肽的随机肽文库筛选能与本发明的人结合分子结合的肽。在上述 分析中，中和狂犬病病毒的人结合分子的应用可以鉴别一或多个中和表位。发现的肽/表 位可以用作疫苗或者用于狂犬病的诊断。另一方面，本发明提供了一种筛选与本发明的结合分子或功能变体所结合的表位 不同的、优选非重叠的狂犬病病毒表位特异性结合的结合分子或结合分子功能变体的方 法，所述方法包括如下步骤a)将被筛选的结合分子或功能变体、本发明的结合分子或功 能变体与狂犬病病毒或其片段(例如狂犬病病毒G蛋白)接触，b)测定被筛选的结合分 子或功能片段是否能与本发明的结合分子或功能变体竞争特异性结合狂犬病病毒或其片 段。如果未检测到竞争，则被筛选的结合分子或功能变体结合不同的表位。在上述筛选方 法的一个特定实施方案中，可以对人结合分子或其功能变体进行筛选，以鉴别能结合与包 含⑶R3区(该⑶R3区包含SEQ ID NO 25氨基酸序列)的结合分子识别的表位不同的表 位的人结合分子或其功能变体。优选地，所述表位是非重叠或者非竞争性的。技术人员已 知上述筛选方法也可用于鉴别能结合相同表位的结合分子或其功能变体。在进一步的步骤 中，可以确定不能竞争性特异性结合狂犬病病毒或其片段的经筛选的结合分子是否具有中 和活性。也可以确定能竞争性特异性结合狂犬病病毒或其片段的经筛选的结合分子是否具 有中和活性。在筛选方法中发现的中和抗狂犬病病毒的结合分子或其功能变体也是本发明 的另一部分。在筛选方法中，“与相同表位特异性结合”包括特异性结合与本发明的人结合分子结合的表位基本上或者实质上相同的表位。阻断或者与本发明的人结合分子竞争结合 狂犬病病毒的能力典型表明筛选的结合分子与狂犬病病毒上的表位或者结合位点结合，所 述表位或者结合位点与本发明的结合分子免疫特异性识别的狂犬病病毒上的结合位点在 结构上重叠。或者，这可以表明筛选的结合分子与本发明的结合分子免疫特异性识别的结 合位点十分邻近的表位或者结合位点结合，以空间排阻或者抑制本发明的结合分子与狂犬 病病毒或其片段的结合。通常，竞争性抑制是通过一种分析测定的，其中将抗原组合物，即包含狂犬病病毒 或其片段(如G蛋白)的组合物与参考结合分子及筛选的结合分子混合。在一个实施方案 中，所述参考结合分子可以是本发明的人结合分子之一，筛选的结合分子可以是本发明的 另一种人结合分子。在另一个实施方案中，参考结合分子可以是包含CDR3区的结合分子， 该CDR3区包含SEQ ID NO :25的氨基酸序列，筛选的结合分子可以是本发明的人结合分子 之一。在另一个实施方案中，参考结合分子可以是本发明的人结合分子之一，筛选的结合分 子可以是包含⑶R3区的结合分子，该⑶R3区包含SEQ ID NO :25的氨基酸序列。通常，筛 选的结合分子过量存在。基于ELISA的方案适合用于这种简便的竞争性研究中。在某些实 施方案中，可以预先将参考结合分子与不同量的筛选结合分子混合(例如1 10、1 20、 1 30、1 40、1 50、1 60、1 70、1 80、1 90 或者 1 100) —段时间，之后用 于抗原组合物。在其它实施方案中，参考结合分子与不同量的筛选的结合分子可以在暴露 于抗原组合物期间简便地混合。在任何情况中，通过使用物种或者同种型二级抗体，技术人 员均可以仅检测结合的参考结合分子，其结合可以由于识别基本相同的表位的筛选的结合 分子的存在而降低。在进行参考结合分子与任何筛选的结合分子之间的结合分子竞争性 研究中(不论物种或者同种型)，技术人员可首先用可检测的标记对参考结合分子进行标 记，所述标记例如是生物素、酶、放射性标记或者在随后可以鉴别的其它标记。在这些情况 中，将标记的参考结合分子与筛选的结合分子以不同比率预先混合或者保温(例如1 10、 1 20、1 30、1 40、1 50、1 60、1 70、1 80、1 90 或者 1 100)，及(任选 在合适的时间之后)分析标记的参考结合分子的反应性，将其与无潜在竞争性结合分子保 温的情况中获得的对照值进行对比。所述分析再可以是基于抗体杂交的任何免疫学分析， 参考结合分子通过检测其标记而可以被检测，例如在生物素化的参考结合分子的情况中使 用链霉亲和素或者通过使用生色底物连同酶标记(如3，3' 5,5'-四甲基联苯胺(TMB) 底物与过氧化物酶)检测，或者通过简便检测放射性标记检测。结合与参考结合分子相同 的表位的筛选的结合分子能有效地竞争结合，并因此显著降低参考结合分子的结合，通过 结合标记的减少而表明。结合不同的非竞争表位的结合分子示出标记未减少。(标记的) 参考结合分子在不存在与竞争性不相关的结合分子的情况中的反应性是对照高值。对照低 值是通过将标记的参考结合分子与实际上相同类型的未标记的参考结合分子一起保温，当 竞争发生并降低标记的参考结合分子的结合时获得的数值。在测试分析中，在存在筛选的 结合分子的情况中，标记的参考结合分子反应性显著降低表明存在识别相同表位的结合分 子，即与标记的参考结合分子“交叉反应”的结合分子。如果其反应性不降低，则所述结合 分子结合不同的非竞争表位。通过这些竞争分析鉴别的结合分子(竞争性结合分子)包括但非限于与参考结合 分子结合的表位或者结合位点结合的抗体、抗体片段及其它结合剂，以及与参考结合分子结合的表位十分邻近的表位或者结合位点结合的抗体、抗体片段及其它结合剂，以在筛选 的结合分子与参考结合分子之间发生竞争性结合。优选地，本发明的竞争性结合分子当过 量存在时抑制参考结合分子与选择的靶位的特异性结合至少10%，优选至少25%、50%， 最优选至少75 % -90 %或者甚至更高。与本发明的结合分子的大约相同、基本上相同、实质 上相同、或者相同的表位结合的一或多种竞争性结合分子的鉴别是一个简单的技术操作。 因为竞争性结合分子是通过与参考结合分子相对比而鉴别，所以应理解鉴别与参考结合分 子结合相同或者基本上相同表位的竞争性结合分子不是在任何情况下均必须实际确定参 考结合分子和竞争性结合分子所结合的表位。或者，通过这些竞争分析鉴别的结合不同的 非竞争性表位的结合分子包括但非限于抗体、抗体片段及其它结合剂。本发明另一方面提供了鉴别结合分子或者编码这种结合分子的核酸分子的方法， 所述结合分子潜在地具有中和导致活体疾病的感染因子的活性，其中所述方法包括如下步 骤a)将可复制遗传包装表面上的结合分子集合与至少一种在其表面上表达导致活体发 生疾病的感染因子的蛋白质的细胞在有益于结合的条件下相接触，b)从与所述细胞未结合 的结合分子中分离并回收与在其表面上表达导致活体发生疾病的感染因子蛋白质的细胞 结合的结合分子，c)分离至少一种回收的结合分子，d)检验分离的结合分子是否具有中和 导致活体发生疾病的感染因子的活性。在其表面上表达导致活体发生疾病的感染因子的 蛋白质的细胞可以是用所述蛋白质转染的细胞。本领域技术人员已知除了蛋白质之外的感 染因子抗原也可成功用于该方法中。在一个特定实施方案中，所述细胞是PER.C6 细胞。 然而，其它(El-无限增殖化的)细胞系也可以用于表达蛋白质，如BHK、CHO、NS0, HEK293 或者911细胞。在一个实施方案中，所述结合分子是人结合分子。所述感染因子可以是病 毒、细菌、酵母、真菌或者寄生虫。在一个实施方案中，所述蛋白质是在感染因子表面上正常 表达的蛋白质，或者包含可在表面接近的蛋白质的至少一部分。在一个特定实施方案中， 可复制遗传包装表面上的结合分子集合用用于表达感染因子蛋白质的细胞扣除/反选择 (subtracted/counterselected)，即该细胞与步骤a中使用的细胞相同，条件是它们在其 表面上不表达感染因子蛋白质。被扣除/反选择的细胞可以是未转染的细胞。或者，细胞 可以用一种蛋白质或其(胞外)部分转染，所述蛋白质在序列或者结构方面与感染因子的 蛋白质相似和/或高度同源，和/或其衍生自相同科或者甚至相同属的感染因子。本发明另一方面涉及具有狂犬病病毒中和活性的结合分子，特征在于所述人结合 分子包含至少一个重链⑶R3区，该⑶R3区包含SEQ ID NO :25的氨基酸序列，进一步特 征在于所述人结合分子具有至少2500IU/mg蛋白质的狂犬病病毒中和活性。更优选地，所 述人结合分子具有至少^00IU/mg蛋白质、3000IU/mg蛋白质、3200IU/mg蛋白质、3400IU/ mg蛋白质、3600IU/mg蛋白质、3800IU/mg蛋白质、4000IU/mg蛋白质、4200IU/mg蛋白质、 4400IU/mg 蛋白质、4600IU/mg 蛋白质、4800IU/mg 蛋白质、5000IU/mg 蛋白质、5200IU/mg 蛋 白质、5400IU/mg蛋白质的狂犬病病毒中和活性。结合分子的中和活性通过体外中和分析测 定(修改的 RFFIT (快速荧光灶抑制试验，rapid fluorescent focus inhibition test))。 这个分析在实施例章节中详细描述。在一个实施方案中，所述结合分子包含一条可变重链，该可变重链包含SEQ ID NO 273所示氨基酸序列。在另一个实施方案中，所述结合分子包含一条重链，该重链包含 SEQ ID NO :123所示氨基酸序列。所述结合分子的可变轻链可包含SEQ ID NO :275所示的氨基酸序列。所述结合分子的轻链可包含SEQ ID NO :125所示的氨基酸序列。编码上述结合分子的核酸分子也是本发明的一部分。优选地，所述核酸分子包含 SEQ ID NO :122所示核苷酸序列。另外，所述核酸分子还可包含SEQ ID NO :1 所示核苷酸 序列。本发明还提供了包含所述核酸分子的载体及包含这种载体的宿主细胞。优选地，宿 主细胞是哺乳动物细胞如人细胞。适于产生人结合分子的细胞的例子是HeLa、911、AT1080、 A549、293和HEK293T细胞。优选的哺乳动物细胞是人视网膜细胞如911细胞或者于1996 年2月四日保藏在欧洲动物细胞保藏中心(ECACC ;CAMR，Salisbury，Wiltshire SP4 OJG, Great Britain)的保藏号为 96022940 的细胞系，其商标为PER.C6 (PER. C6 是 Crucell Holland B. V.的注册商标)。在本申请中，“PER. C6”是指以保藏号9602^40保藏的细胞 或其祖先、上游或下游传代以及来自保藏细胞的祖先的后代以及任何前述细胞的衍生物。
实施例为了例证本发明，提供了如下实施例。所述实施例非以任何方式限制本发明的范围。实施例1人抗狂犬病病毒抗体CR-57和CR-JB的表位识别为了确定称作CR-57和CR-JB的人单克隆抗体是否识别非重叠的、非竞争的表位， 产生称作CR-57和CR-JB的人单克隆抗体的逃逸病毒。通过将相应抗体基因的可变重链和 轻链编码区导入称作pcDNA3002 (Neo)的人IgGl表达载体中，CR-57和CR-JB基本如(见 Jones et al.，2003)所述产生。所得载体pgS057Cll和pgSOJBCll用于在细胞中瞬时表 达，所述细胞来自于1996年2月四日以保藏号9602^40保藏在欧洲动物细胞保藏中心 (ECACC ；CAMR, Salisbury, Wiltshire SP4 OJG, Great Britain)的商标为PER.C6 的细 胞系。这些抗体的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列分别示于SEQ ID N0:122-U9。将狂 犬病病毒株CVS-Il的系列稀释液(0. 5ml)(稀释范围I(T1-KTs)与恒定量( 4IU/ml)的 抗体CR-57或CR-JB(0. 5ml)在37°C /5% CO2条件下保温1小时，之后加入含有小鼠成神经 细胞瘤细胞(MNA细胞)或者BSR细胞(幼仓鼠肾样细胞系)的孔中。在存在人单克隆抗 体CR-57或CR-JB的条件下选择3天后，收获含有潜在逃逸病毒的培养基(Iml)，在4°C贮 存直至进一步应用。随后，将细胞用丙酮在4°C固定20分钟，在37°C /5% CO2条件下用抗 狂犬病病毒N-FITC抗体缀合物(Centocor)染色过夜。通过免疫荧光记录每个孔中转化灶 (foci)的数目，选择含有1-6个转化灶的孔中的培养基进行病毒扩增。所有的E57逃逸病 毒均从一个转化灶中产生，E57B1除外(3个转化灶)。EJB逃逸病毒分别分离自1个转化 灶(EJB3F)、3个转化灶(EJB2B)、4个转化灶(EJB2C)、5个转化灶(EJB2E、2F)或者6个转 化灶(EJB2D)。每个逃逸病毒均首先在BSR或MNA细胞上根据其生长特性小规模扩增。然 后将这些小批量的病毒用于在MNA或BSR细胞上进一步大规模扩增。然后将扩增的病毒在 MNA细胞上滴定，以确定每个逃逸病毒批次物的效价以及逃逸病毒的最佳稀释度(在M小 时后产生80-100%感染)，以在病毒中和分析中使用。进行修改的RFFIT (快速荧光灶抑制试验)分析，以检测E57 (CR-57的逃逸病毒) 和EJB (CR-JB的逃逸病毒)分别与CR-JB和CR-57的交叉保护作用。因此，从1 5稀释 开始对CR-57或CR-JB进行系列3倍稀释。向每个稀释液中加入一定浓度的狂犬病病毒(CVS-11毒株)，使得产生80-100%感染。将病毒/IgG混合物在37°C /5% CO2条件下保 温1小时，之后加入MNA细胞中。在感染后M小时(在34°C/5% CO2条件下)，将细胞在 4°C用丙酮固定20分钟，用抗狂犬病病毒N-FITC抗体缀合物(Centocor)进行最少3小时 染色。然后在荧光显微镜下分析孔的狂犬病病毒感染情况，以确定50%终点稀释度。这是 在这个分析中病毒感染被阻断50%的稀释度。为了计算效力，在每个修改的RFFIT中均包 括国际标准(Rabies ImmuneGlobulin Lot R3，来自 Standards and Testing DMPQ/CBER/ FDA实验室的参考材料)。这个标准的50%终点稀释度相应于效力为2IU/ml。对单独的人 单克隆抗体CR-57和CR-JB以及这些抗体的组合的中和效力进行测试。EJB病毒不再由CR-JB或者CR-57中和(见表1所示)，提示这两种抗体结合狂犬 病病毒糖蛋白的相似区域并诱导其中氨基酸改变。E57病毒不再由CR-57中和，而6个E57 病毒中有4个病毒仍由CR-JB中和，但效力较低(见表1所示)。抗体CR-57和CR-JB的混 合物(1 lIU/mg比率)提供与单一抗体相似的结果(数据未示出)。为了鉴别狂犬病病毒糖蛋白中可能的突变，确定每个EJB和E57逃逸病毒的糖蛋 白开放读框(ORF)的核苷酸序列。每个逃逸病毒和CVS-Il的病毒RNA均分离自病毒感染 的MNA细胞，通过标准RT-PCR转变为cDNA。随后，使用cDNA对狂犬病病毒糖蛋白ORF进行 核苷酸测序以鉴别突变。E57和EJB逃逸病毒均示出在糖蛋白的相同区域中的突变(分别见图1和2所示； 见图1和2描述的全部序列SEQ ID NO :130-151)。这表明这两种抗体识别重叠表位。由 上文可以推断混合物中CR-57和CR-JB的组合不阻止中和抗性变体的逃逸，并因此不是狂 犬病暴露后预防的理想的免疫球蛋白制品。实施例2用狂犬病接种的供体的外周血淋巴细胞构建scFv噬菌体展示文库在最后一次加强免疫后一周从4个狂犬病接种的人个体的静脉中取50ml血。 用Ficoll细胞密度分级分离从这些血样中分离外周血淋巴细胞(PBL)。血清冷冻保存 在-20°C。在狂犬病病毒糖蛋白转染的细胞上用FACS染色测得血清中抗狂犬病抗体 的存在呈阳性。用有机相分离(TRIZ0L )和随后的乙醇沉淀从PBL中制备总RNA。将获 得的RNA溶解在DEPC处理的超纯水中，通过OD 260nm测量确定浓度。之后，将RNA稀释 至IOOng/ μ 1的浓度。接着，如下将Iyg RNA转化成cDNA 向10 μ 1总RNA中加入13 μ 1 DEPC处理的超纯水和1 μ 1随机六聚体(500ng/ μ 1)，将获得的混合物在65°C加热5分钟并 在湿冰上迅速冷却。然后，向混合物中加入8 μ 1 5X第一链缓冲液、2 μ 1 dNTP (各IOmM)、 2 μ 1 DTT (0. 1Μ)、2μ 1 Rnase 抑制剂 0OU/μ 1)禾口 2 μ 1 Superscription III MMLV 逆转 录酶QOOU/μΙ)，在室温保温5分钟，并在50°C保温1小时。通过热失活终止反应，即将混 合物在75°C保温15分钟。用DEPC处理的超纯水将获得的cDNA产物稀释至终体积为200 μ 1。获得的cDNA 产物的稀释液的50倍稀释溶液(于IOmM Tris缓冲液中)的OD^Onm的值为0. 1。对于每一供体，5-10 μ 1稀释的cDNA产物用作模板，用特异性寡核苷酸引物(见 表2-7)PCR扩增免疫球蛋白γ重链家族和κ或λ轻链序列。在终体积50 μ 1的20mM Tris-HCl(pH 8.4)、50mM KC1、2. 5mMMgCl2、250 μ M dNTP 和 1· 25 单位 Taq 聚合酶中，PCR 反 应混合物除了含有稀释的cDNA产物之外还含有25pmol有义引物和25pmol反义引物。在温度为96°C的加热盖热循环仪中，获得的混合物快速解链2分钟，随后30个循环的96°C 30 秒、60°C 30 秒和 72 0C 60 秒。在第一轮扩增中，17种轻链可变区有义引物(针对λ轻链有11种(见表幻，针对 κ 轻链有 6 种)的每一种与识别 C- κ 的称为 HuCk5' -ACACTCTCCCCTGTTGAAGCTCTT-3 ‘( 见 SEQ ID NO 152)或识别 C- λ 恒定区的称为 HuC λ 25 ‘ -TGAACATTCTGTAGGGGCCACTG-3 ‘( 见 SEQ ID NO 153)和 HuC λ 75 ‘ -AGAGCATTCTGCAGGGGCCACTG-3 ‘(见 SEQ ID NO 154)的 反义引物(HuCX 2和HuCX 7反义引物在使用前等摩尔混和)组合，产生4倍的约600碱基 对的17种产物。这些产物在2%琼脂糖凝胶上纯化并用Qiagen凝胶提取柱从凝胶中分离。 在一使用相同的17种有义引物的如上所述相同的PCR反应中使用1/10每种分离的产物， 其中每种λ轻链有义引物与3种JX-区特异性反义引物的一种组合，每种κ轻链有义引 物与5种Jk -区特异性反义引物的一种组合。用于第二个扩增中的引物用限制位点延伸 (见表4)以使得直接克隆在噬菌体展示载体PDV-C06中(见图3和SEQ ID NO :155)。这 产生4倍约350碱基对的63种产物，这些产物混和(pooled)成总共10个级分。选择这一 数量的级分以保持不同轻链家族在文库内的天然分布而不会过度代表某些家族或某些家 族代表不足。用家族内的等位基因数量确定文库内呈现的百分比(见表幻。在下一步，将 2. 5 μ g混和的级分和100 μ g PDV-C06载体用Mil和NotI消化并从凝胶中纯化。之后， 在 16°C如下连接过夜在含有 50mM Tris-HCl (pH 7. 5) UOmM MgCl2UOmM DTTUmM ATP、 25 μ g/ml BSA和2. 5 μ 1 Τ4 DNA连接酶0OOU/ μ 1)的总体积为50 μ 1的连接混合物中向 500ng PDV-C06载体中加入70ng混和的级分。每种混和的级分均进行这一程序。用本领域 技术人员熟知的方法经苯酚/氯仿、氯仿提取和乙醇沉淀而纯化连接混合物。将获得的DNA 溶解在50 μ 1超纯水中，根据厂商方案(Stratagene)每种连接混合物2倍2. 5 μ 1等份被 电穿孔进40 μ 1 TGl感受态大肠杆菌细菌中。转化子在含有补加50 μ g/ml氨苄青霉素和 4. 5%葡萄糖的2TY琼脂的30个培养皿上于37°C过夜生长(每种混和的级分3个培养皿， 培养皿尺寸MOmmXMOmm)。通过从琼脂平板上刮下转化子获得轻链可变区的(亚)文库。 这一(亚)文库被直接用于用Qiagen QIAFilterMAXI pr印试剂盒进行质粒DNA制备。对于每种供体，以如上针对轻链区所述的类似的两轮PCR程序和相同反应参数从 相同cDNA制备物中扩增重链免疫球蛋白序列，条件是使用表6和表7的引物。用一组9 个有义方向引物(见表6;覆盖全部重链可变区家族)进行第一次扩增，每种引物与称为 HuCIgG5' -GTC CAC CTT GGT GTT GCT GGG CTT-3 ‘ (SEQ ID NO :156)的 IgG 特异性恒定 区反义引物组合，产生4倍约650碱基对的9种产物。这些产物在2%琼脂糖凝胶上纯化并 用Qiagen凝胶提取柱从凝胶中分离。在如上所述的使用相同9种有义引物的相同PCR反 应中使用1/10每种分离的产物，其中每种重链有义引物与4种JH区特异性反义引物中的 一种组合。第二轮中使用的引物用限制位点延伸(见表7)以使得在轻链(亚)文库载体中 定向克隆。这导致每个供体产生为约350碱基对的36种产物。这些产物根据每种使用的 (VH)有义引物每种供体混和成9种级分。获得的产物用Qiagen PCR纯化柱纯化。接着，将 级分用SfiI和B10I消化并使用上述针对轻链(亚)文库所述的相同连接程序和体积连接 进轻链(亚)文库载体中，该轻链(亚)文库载体已用相同限制酶切割。或者，所述级分用 NcoI和B10I消化并使用上述针对轻链(亚)文库所述的相同连接程序和体积连接进轻链 载体中，该轻链载体已用相同限制酶切割。还根据以上针对轻链(亚)文库所述那样进行CN 102139106 A
说明书
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连接纯化和所得确定文库的后续转化，在此时根据每VH库组合每个供体的连接混合物。转 化子在含有补加了 50 μ g/ml氨苄青霉素和4. 5%葡萄糖的2TY琼脂的27个培养皿中生长 (每个混和的级分3个培养皿；培养皿尺寸240mmXM0mm)。所有细菌收集在含有50 μ g/ ml氨苄青霉素和4. 5%葡萄糖的2TY培养基中，与甘油混和至15% (ν/ν)并以1. 5ml等份 冷冻在-80°C。每一文库的拯救和选择如下所述进行。实施例3携带特异性识别狂犬病病毒糖蛋白的单链Fv片段的噬菌体的选择基本上如美国专利6，265，150和WO 98/15833 (两者均引入本文作参考)所述， 用抗体噬菌体展示文库、通用噬菌体展示技术和Mabstract 技术选择抗体片段。所用抗 体噬菌体文库是两种不同的半合成ScFv噬菌体文库(JK1994和WT2000)以及实施例2中 制备的免疫scFv噬菌体文库(RAB-03-G01和RAB-04-G01)。第1种半合成scFv噬菌体文 库(JK1994)在 de Kruif et al. (1995b)中描述，第 2 种(WT2000)基本上如 de Kruif et al. (1995b)所述构建。简单地说，文库具有半合成形式，其中用将变异掺入CDR区域内的简 并寡核苷酸将变异掺入重链和轻链V基因中。仅仅VH3重链基因被使用，其与κ和λ轻 链基因组合。重链的CDRl和CDR3以及轻链的CDR3在与deKruif et al. (1995b)所述类 似的基于PCR的途径中合成构建。由此构建的V区基因以scFv形式依次克隆在噬菌粒载 体中并被扩增以产生如前所述的噬菌体文库。另外WO 02/103012(引入本文作参考)所述 的方法和辅助噬菌体用于本发明中。为了鉴别识别狂犬病病毒糖蛋白的噬菌体抗体，用通 过β-丙内酯处理而灭活的完全狂犬病病毒(狂犬病病毒Pitman-Moore毒株)、纯化的狂 犬病病毒糖蛋白(狂犬病病毒ERA毒株)和/或表达狂犬病病毒G蛋白(狂犬病病毒ERA 毒株)的转染细胞进行噬菌体选择实验。如下从狂犬病病毒ERA毒株纯化G蛋白。向病毒溶液中加入1/10体积的10% 辛基- β -吡喃葡糖苷并温和混合。在4°C保温30分钟，在SW51转子中离心病毒样品 (36000rpm，4°C )。收集上清并在4°C对0. IM Tris/EDTA透析过夜。随后，从透析腔收集糖 蛋白，等分并储存于-80°C直至进一步使用。在0D280测蛋白质浓度，由SDS-PAGE分析G蛋 白完整性。完整的灭活狂犬病病毒或狂犬病病毒G蛋白在磷酸盐缓冲盐水(PBQ中稀释，将 2_3ml加至MaxiSorp Nunc-Immuno Tubes (Nunc)并在旋转轮上于4°C保温过夜。一等份噬 菌体文库(500μ1，约IO13Cfu，用CT辅助噬菌体扩增(见WO 02/103012))在封闭缓冲液
补体素(ftx)tifar)于PBS中)中于室温封闭1-2小时。将封闭的噬菌体文库加到免 疫管中(与或未与CR-57scFV预保温以封闭由CR-57识别的表位)，在室温保温2小时，并 用洗涤缓冲液(0. l%Tween-20 (Serva)于PBS中)洗涤以除去未结合的噬菌体。结合的噬 菌体然后通过在室温与Iml的50mM甘氨酸-HCl pH 2. 2保温10分钟而从抗原中洗脱。随 后，洗脱的噬菌体与0. 5ml的IM Tris-HCl pH7. 5混和以中和pH。用混合物感染已在37°C 生长至0D600nm约0. 3的5mlXLl_Blue大肠杆菌培养物。噬菌体在37°C感染XLl-Blue细菌 30分钟。然后，混合物在3200 Xg于室温离心10分钟，细菌沉淀重悬于0. 5ml的2-trypton 酵母提取物(2TY)培养基中。获得的细菌悬浮液分在补加了四环素、氨苄青霉素和葡萄糖 的两个2TY琼脂平板上。平板在37°C过夜保温后，从平板刮下菌落并用于制备富集的噬菌 体文库，基本上如De Kruif et al. (1995a)和WO 02/103012所述。简单地，用刮下的细菌接种含有氨苄青霉素、四环素和葡萄糖的2TY培养基，在37°C生长至0D600nm为约0. 3。加 入CT辅助噬菌体并感染细菌，之后培养基变为含有氨苄青霉素、四环素和卡那霉素的2TY。 继续在30°C保温过夜。第2天，细菌通过离心从2TY培养基中除去，之后培养基中的噬菌 体用聚乙二醇(PEG)6000/NaCl沉淀。最后，将噬菌体溶于含有牛血清白蛋白(BSA)的 2ml PBS中，过滤灭菌并用于下一轮选择。还用狂犬病病毒糖蛋白转染的细胞进行了噬菌体选择。所用细胞是来自在1996 年2月29日保藏在欧洲动物细胞保藏中心(ECACC)，CAMR，Salisbury, Wiltshire SP4 OJG, Great Britain的保藏号为9602^40的细胞系的细胞，该细胞系以PER.C6 的商标 在市场上销售。它们以下被称为PER.C6 细胞。此处，封闭的噬菌体文库Oml)首先被 加到IX IO7SUbtractor细胞中(在DMEM/10 % FBS中)并在一旋转轮上于4°C保温1小 时。Subtractor细胞是在其表面表达与狂犬病病毒跨膜和胞质结构域融合的疱疹性口腔 炎病毒(VSV)糖蛋白胞外域(ectodomain)的PER.C6 细胞。随着这一扣除步骤，识别 VSV糖蛋白或特异于PER.C6 细胞的抗原的噬菌体被从噬菌体文库中除去。离心噬菌体 /细胞混合物(500Xg 5分钟，4°C)以除去细胞结合的噬菌体，将上清加入到含有3ml的 IX Io7Subtractor细胞的新试管中。这一扣除步骤用各个上清重复2次。随后，在一旋转 轮上将扣除的噬菌体与表达狂犬病病毒糖蛋白的转染细胞(PER.C6 细胞(3X IO6细胞) 在4°C保温1. 5小时。之前，转染细胞与或未与CR-57scFV预保温以封闭由CR-57识别的表 位。保温后，细胞用Iml的DMEM/10% FBS洗5次(每次洗涤细胞均重悬并移至新试管)， 如上所述洗脱并加工噬菌体。典型地，在分离各个噬菌体抗体之前进行两轮选择。在第2轮选择后，用各个大 肠杆菌菌落制备单克隆噬菌体抗体。基本上，在96孔板中将各个菌落生长至对数期并用 VCSM13辅助噬菌体感染，之后使噬菌体抗体产生进行过夜。产生的噬菌体抗体用PEG/NaCl 沉淀、过滤灭菌并在ELISA中测试与完整灭活的狂犬病病毒和纯化的狂犬病病毒G蛋白的 结合。从选择中获得一大组噬菌体抗体，证实与完整灭活的狂犬病病毒和狂犬病病毒G蛋 白均结合(见下述实施例)。用上述免疫文库进行两种选择策略。在第一种策略中，在第一 轮和第二轮选择中用灭活病毒或纯化的G蛋白的两轮选择后选择了 736种噬菌体抗体。在 第二种选择策略中，在第一轮选择用细胞表面表达的重组G蛋白和在第二轮选择中用灭活 病毒或纯化的G蛋白的两轮选择后选择了 736种噬菌体抗体。用第一种策略获得的独特噬 菌体抗体数量是97，而第二种策略产生70种独特噬菌体抗体。第一种策略发现的97种独 特噬菌体抗体产生18种中和抗体，第二种策略鉴别的70种独特克隆产生33种中和抗体。 这清楚表明包括狂犬病病毒糖蛋白转染的细胞，即细胞表面表达的重组G蛋白作为抗原的 选择与仅使用纯化的G蛋白和/或灭活病毒的选择相比似乎产生更多的中和抗体。实施例4狂犬病病毒糖蛋白特异性单链噬菌体抗体的确认在上述筛选中获得的选择的单链噬菌体抗体在ELISA中确认特异性，即与如上所 述纯化的狂犬病病毒G蛋白的结合。另外，还测试了单链噬菌体抗体与5% FBS的结合。 为此，用狂犬病病毒G蛋白或5% FBS包被Maxisorp ELISA平板。包被后，在室温将板在 PBS/1%补体素中封闭1小时。选择的单链噬菌体抗体在等体积的PBS/1%补体素中保温15 分钟以获得封闭的噬菌体抗体。倒空平板，向孔中加入被封闭的噬菌体抗体。保温1小时，将平板在含有0. 1% Tween-20的PBS中洗涤，用与过氧化物酶缀合的抗M13抗体检测结合 的噬菌体抗体(用0D492nm测量)。作为对照，不使用单链噬菌体抗体、使用针对CD8的阴 性对照单链噬菌体抗体(SC02-007)或使用针对狂犬病病毒糖蛋白的阳性对照单链噬菌体 抗体(scFv S057)同时进行所述程序。如表8所示，称为SC04-001、SC04-004、SC04-008、 SC04-010、SC04-018、SC04-021、SC04-026、SC04-03U SC04-038、SC04-040、SC04-060、 SC04-073、SC04-097、SC04—098、SC04—103、SC04—104、SC04—108、SC04—120、SC04—125、 SC04-126、SC04-140、SC04-144、SC04-146和SC04-164的选择的噬菌体抗体展示与固定化 的纯化的狂犬病病毒G蛋白的显著结合，但未观察到与FBS的结合。在使用如上所述制备 的完整灭活的狂犬病病毒的ELISA中获得相同结果(数据未示出)。实施例5狂犬病病毒特异性sFv的鉴定从选择的特异性单链噬菌体抗体(scFv)克隆获得质粒DNA并根据标准技术确 定核苷酸序列。称为 SC04-001、SC04-004、SC04-008、SC04-010、SC04-018、SC04-021、 SC04-026、SC04-031、SC04-038、SC04-040、SC04-060、SC04-073、SC04-097、SC04-098、 SC04-103、SC04-104、SC04-108、SC04-120、SC04-125、SC04-126、SC04-140、SC04-144、 SC04-146和SC04-164的scFv的核苷酸序列(包括用于克隆的限制位点)分别示于SEQ ID NO: 157、SEQ ID NO: 159、SEQID NO: 161、SEQ ID NO: 163、SEQ ID NO: 165、SEQ ID NO: 167、SEQ ID NO :169, SEQ ID NO :171, SEQ ID NO :173, SEQ ID NO :175, SEQ ID NO :177, SEQ ID NO :179,SEQ ID NO :18USEQ ID NO :183,SEQ ID NO :185,SEQ ID NO :187,SEQ ID NO :189, SEQ ID NO :191, SEQ ID NO :193, SEQ ID NO :195, SEQ ID NO :197, SEQ ID NO 199、SEQ ID NO :201 和 SEQ ID NO :203。称为 SC04-001、SC04-004、SC04-008、SC04-010、 SC04-018、SC04-021、SC04-026, SC04-031、SC04-038、SC04-040、SC04-060、SC04-073、 SC04-097、SC04-098、SC04-103、SC04-104、SC04-108、SC04-120、SC04-125、SC04-126、 SC04-140、SC04-144、SC04-146 和 SC04-164 的 scFv 的氨基酸序列分别示于 SEQ ID NO 158,SEQ ID NO 160,SEQ ID NO 162、SEQID NO 164,SEQ ID NO :166、SEQ ID NO :168、SEQ ID NO :170,SEQ ID NO 172,SEQ ID NO 174、SEQ ID NO 176,SEQ ID NO 178、SEQ ID N0: 180、SEQ ID NO :182、SEQ ID NO :184、SEQ ID NO :186、SEQ ID NO :188、SEQ ID NO :190、 SEQ ID NO :192,SEQ ID NO 194、SEQ ID NO 196,SEQ ID NO :198、SEQ ID NO :200、SEQ ID NO 202 和 SEQ ID NO :204。特异性结合狂犬病病毒G蛋白的scFv的VH和VL基因相同性(参见1Toml inson IM, Williams SC, Ignatovitch 0, Corbett SJ, Winter G. V-BASE Sequence Directory. Cambridge United Kingdom :MRC Centrefor Protein Engineering (1997))禾口重链CDR3 组 成见表9所示。实施例6狂犬病病毒特异性scFv对狂犬病病毒的体外中和(修改的RFFIT)为了确定选择的scFv是否能阻断狂犬病病毒感染，进行了体外中和分析(修改的 RFFIT)。通过用1 5稀释度开始的系列3倍稀释而稀释scFv制备物。狂犬病病毒(毒 株CVS-11)以产生80-100%感染的浓度加入到每一稀释液中。病毒/scFv混合物在加入 到MNA细胞上之前在37°C /5% CO2下保温1小时。感染后M小时(在34°C /5% CO2)，在4°C用丙酮固定细胞20分钟，用抗狂犬病N-FITC抗体缀合物(Centocor)染色最少3小时。 然后在荧光显微镜下分析细胞的狂犬病病毒感染以确定50%终点稀释度。这是在这一分析 中病毒感染被阻断50%的稀释度(见实施例1)。鉴别了几种scFv，它们显示出对狂犬病病 毒的中和活性(见表10)。另外，通过如上所述的体外中和分析(修改的RFFIT)研究了是否选择的scFv能 中和实施例1制备的E57逃逸病毒(E57A2、E57A3、E57B1、E57B2、E57B3和E57C3)。鉴别了 几种scFv，它们显示出对E57逃逸病毒的中和活性(见表IlA和11B)。实施例7使用scFv的狂犬病病毒G蛋白竞争ELISA为鉴别与非重叠的非竞争的表位结合的抗体，进行了狂犬病糖蛋白竞争ELISA。 用在PBS(50y 1)中的1 1000稀释的纯化狂犬病病毒糖蛋白(lmg/ml ；狂犬病病毒ERA 毒株)在4°C包被Nunc-ImmunoTMMaxisorp F96板(Nunc)过夜。洗掉未包被的蛋白质，之 后孔用100 μ 1的PBS/1%补体素在室温封闭1小时。随后弃掉封闭溶液并加入50μ 1于 PBS/1%补体素中的未纯化的抗狂犬病病毒scFv Qx稀释的)。孔用100 μ 1的PBS/0. 05% Tween-20洗5次。然后，向每孔加入50 μ 1生物素化抗狂犬病病毒竞争物IgG，CR-57bio, 在室温保温5分钟，孔用100 μ 1的PBS/0. 05% Tween-20洗5次。为检测CR-57bio的结 合，将50 μ 1的1 2000稀释的链霉亲和素-HRP抗体(Becton Dickinson)加入到孔中并 在室温保温1小时。如上所述再次洗孔，通过加入100 μ IOPD试剂(Sigma)而进一步显色 ELISA0通过加入50 μ 1的IM H2SO4终止反应，在492nm测量OD0当与scFv S057,即CR-57的scFv形式(S057的核苷酸和氨基酸序列分别见SEQ ID NO 205和206)或scFv SOJB,即CR-JB的scFv形式(S0JB的核苷酸和氨基酸序列分别见 SEQ ID NO :312和31 共保温时，用CR_57bio单独获得的信号可被降低至背景水平。这表 明scFv S057和SOJB通过与CR-57bio结合相同表位或重叠表位而竞争分别竞争CR-57bio 与狂犬病病毒糖蛋白的相互作用。相反，称为SC02-007的无关scFv，即与⑶8结合的 scFv 不竞争结合。称为 SC04-004、SC04-010、SC04-024、SC04-060、SC04-073、SC04-097、 SC04-098、SC04-103、SC04-104、SC04-120、SC04-125、SC04-127、SC04-140、SC04-144 和 SC04-146的抗狂犬病病毒scFv不与CR_57bio竞争，提示这些scFv结合与CR-57识别的表 位不同的表位(见图4)。用下述实验获得类似的结果。首先，向用狂犬病病毒G蛋白包被的孔中加入狂犬 病病毒抗体CR-57。接着，加入竞争scFv。在这一设置中，抗狂犬病病毒scFv用抗VSV-HRP 根据scFv氨基酸序列中VSV-tag的存在而检测(见图5)。实施例8从选择的抗狂犬病病毒单链Fv’ s构建完全人免疫球蛋白分子(人单克隆抗狂犬 病病毒抗体)称为SC04-001、SC04-008、SC04-018、SC04-040 和 SC04-126 的 scFv 的重链和 轻链可变区用寡核苷酸进行PCR扩增以附加限制位点和/或序列以分别在IgG表达载体 pSyn-C03-HC γ 1 (见 SEQ ID No :277)和 pSyn-C04_C λ (见 SEQ ID No :278)中表达。分别 用表12和13所示寡核苷酸扩增Vh和\基因，将PCR产物分别克隆进载体pSyn-C03-HC y 1 和 p^n-C04-C λ。
称为SC04-004、SC04-010、SC04-021、SC04-026、SC04-031、SC04-038、SC04-060、 SC04-073、SC04-097、SC04—098、SC04—103、SC04—104、SC04—108、SC04—120、SC04—125、 SC04-140、SC04-144、SC04-146和SC04-164的scFv的重链和轻链可变区也用寡核苷酸 进行PCR扩增以附加限制位点和/或序列以分别在IgG表达载体pSyn-C03-HC γ 1和 pSyn-C05-C κ (见SEQ ID No :279)中表达。分别用表12和13所示寡核苷酸扩增Vh和\ 基因，将PCR产物分别克隆进载体pSyn-C03-HC γ 1和pSyn-C05-C κ中。寡核苷酸的设计 是使得它们改正来自种系序列的任何偏差，这些偏差是在文库构建过程中由于用来扩增庞 大数量的抗体基因的寡核苷酸组数量有限而导入的。根据本领域技术人员已知的标准技术 验证了所有构建体的核苷酸序列。所得到的编码抗狂犬病病毒人IgGl重链的表达构建体pgG104_001C03、 pgG104-008C03、pgG104_018C03、pgG104-040C03 和 pgG104_U6C03 与编码相应轻链的相 关pSyn-C04-VX构建体组合在细胞中瞬时表达，并获得含有IgGl抗体的上清。编码 抗狂犬病病毒人 IgGl 重链的表达载体 pgG104-004C03、pgG104_010C03、pgG104_021C03、 pgG104-026C03、pgG104_031C03、pgG104_038C03、pgG104_060C03、pgG104_073C03、 pgG104-097C03、pgG104_098C03、pgG104_103C03、pgG104_104C03、pgG104_108C03、 pgG104-120C03、pgG104_125C03、pgG104_140C03、pgG104_144C03、pgG104_146C03 禾P pgG104-164C03与编码相应轻链的相关pSyn-C05-VK构建体组合在细胞中瞬时表达， 并获得含有IgGl抗体的上清。根据标准技术确定了称为CR04-001、CR04-004、CR04-008、CR04-010、CR04-018、 CR04-02U CR04-026, CR04-03U CR04-038、CR04-040, CR04-060, CR04-073, CR04-097, CR04-098、CR04-103、CR04-104、CR04-108、CR04-120、CR04-125、CR04-126、CR04-140、 CR04-144、CR04-146和CR04-164的抗体的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。随后，用通 常用于免疫球蛋白的标准纯化方法(参见例如W000/63403，引入本文作参考)在蛋白质-A 柱上、随后在脱盐柱上缓冲液交换而纯化所述重组人单克隆抗体。另外，对于CR04-098，根据针对分别编码CR-57和CR-JB的载体pgS057Cll和 PgSOJBCll所述(见实施例1)产生称为pgG104-098C10的单人IgGl表达载体。由载体 pgG104-098C10编码的抗体CR04-098的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列分别示于SEQID NO :334-337。载体pgS057Cll(见实施例1)和pgG104_098C10分别用于在细胞中稳定表 达CR-57和CR04-098，所述细胞来自在1996年2月四日保藏在欧洲动物细胞保藏中心 (ECACC)，CAMR，Salisbury，Wiltshire SP4 0JG, Great Britain 的保藏号为 9602^40 的细 胞系，该细胞系以PER.C6 的商标在市场上销售。稳定产生的CR-57和CR04-098的计算 等电点分别为8. 22和8. 46。实验观察到的CR-57的等电点在8. 1-8. 3之间，CR04-098的在 9. 0-9. 2之间。重组人单克隆抗体如上所述纯化。除非另外描述，对于CR04-001、CR04-004、 CR04-008、CR04-010, CR04-018, CR04-02U CR04-026、CR04-03U CR04-038, CR04-040、 CR04-060、CR04-073、CR04-097、CR04-098、CR04-103、CR04-104、CR04-108、CR04-120、 CR04-125、CR04-126、CR04-140、CR04-144、CR04-146 和 CR04-164，使用由上述两个载体系 统瞬时表达的重组人单克隆抗体，对于CR57，使用由实施例1所述的一个载体系统瞬时表 达的重组人单克隆抗体。实施例9
使用IgG的狂犬病病毒G蛋白竞争ELISA为确定所述人单克隆抗狂犬病病毒G蛋白IgG是否结合非重叠的非竞争性表位， 进行竞争实验。具有包被的狂犬病病毒G蛋白的孔用增加浓度(0-50yg/ml)的未标记的抗 狂犬病病毒G蛋白IgG在室温保温1小时。然后，向每孔中加入50 μ 1不同的生物素化的抗 狂犬病病毒IgG(l μ g/ml)，在室温保温5分钟，立即用100 μ 1的PBS/0. 05% Tween-20洗 5次。随后在室温将孔与50μ 1的1 2000稀释的链霉亲和素-HRP(Becton Dickinson) 保温1小时，洗涤并如上所述显色。随着未标记IgG浓度增加信号降低，表明这两种抗体互 相竞争并识别相同表位或重叠表位。或者，将用狂犬病病毒G蛋白(ERA毒株)包被的孔与50 μ g/ml未标记的抗狂犬病 病毒G蛋白IgG在室温保温1小时。然后向每孔加入50 μ 1生物素化CR57 (0. 5-5 μ g/ml ； 不完全饱和水平)。如上所述进行进一步的步骤。将获得的信号与仅用生物素化CR57获得 的信号进行比较(见图6 ；无竞争剂)。从图6可以推出使用作为阴性对照的称为CR02-428 的抗体的信号不降低。相反，用未标记的CR57(阳性对照)或CR-JB的竞争降低信号至背 景水平。从图6可进一步推出抗狂犬病病毒G蛋白IgG无一与CR-57显著竞争，这与实施 例 描述的scFv竞争数据一致。另外，通过流式细胞术在狂犬病病毒G蛋白(ERA毒株)转染的PER. C6细胞上进行 竞争实验。转染的细胞与20 μ 1未标记的抗狂犬病病毒G蛋白IgG (50 μ g/ml)在4°C保温20 分钟。在用含1 % BSA的PBS洗涤细胞后，向每孔中加入20 μ 1生物素化的CR57 (0. 5-5 μ g/ ml ；在不完全饱和水平)，在4°C保温5分钟，立即用100 μ 1含1 % BSA的PBS洗2次。随 后，将孔与20 μ 1的1 200稀释的链霉亲和素-PE (Caltag)在4°C保温15分钟，洗涤并如 上所述显色。用生物素化CR57获得的信号不能用阴性对照抗体CR02-^8显著降低(见图 7)。相反，用未标记的CR57(阳性对照)或CR-JB的竞争降低信号至背景水平。抗狂犬病 病毒G蛋白IgG无一与CR-57显著竞争，例外是CR04-126，其降低信号至大约30% (见图 7)。后者在ELISA中不竞争(见图6)。这可能是由于在FACS实验中糖蛋白被呈递给抗体 的方式与ELISA实验不同而导致的。CR04-126的结合可能更依赖于糖蛋白的构象，导致在 基于FACS的竞争分析中用CR04-U6观察到竞争性作用，而在基于ELISA的分析中未观察 到。另外，CR04-008和CR04-010在基于FACS的竞争分析中降低信号至约50% (见图7)， 说明它们可能与CR57竞争。对于CR04-010，这却没有被scFv竞争数据或基于ELISA的竞 争分析证实。对于其它的IgG，FACS数据与各自的scFv和IgG的ELISA数据一致。实施例10抗狂犬病IgG在狂犬病病毒的体外中和作用中的加性/协同效应GfSmRFFIT)为了确定抗狂犬病病毒G蛋白IgG在狂犬病病毒中和作用中是否具有加性或协同 效应，测试不同组合的IgG。首先，每种抗体的效力(以IU/mg表示)在一修改的RFFIT中 确定(见实施例1)。然后，基于等量的IU/mg制备抗体组合并在修改的RFFIT中测试。可 确定每种抗体组合的效力并与预期效力进行比较。如果抗体组合的效力等于组合中存在的 每种抗体的效力之和，则这些抗体具有加性效应。如果抗体组合的效力更高，则这些抗体在 狂犬病病毒中和中具有协同效应。或者，可通过下述实验确定加性或协同效应。首先，在一标准RFFIT(参 见 Laboratory techniques in rabies, Edited by :F.-X Meslin, Μ. M. Kaplan andH. Koprowski(1996),4th edition, Chapter 15, WorldHealth Organization, Geneva)中 确定待测抗体例如CR-57和CR04-098的效力。然后，将这些抗体以基于IU/ml为1 1的 比例混合。这一抗体混合物与相同浓度的各个抗体一起在六个独立的RFFIT实验中被测 试以确定50%中和终点。随后用由Chou et al. (1984)描述的公式CI = (Cl/Cxl) + (C2/ Cx2) + (ClC2/CxlCx2)确定抗体混合物的组合指数(Cl)。Cl和C2是当组合应用时导致50% 中和的单克隆抗体1和单克隆抗体2的量(以μ g表示)，Cxl和Cx2是当单独应用时导致 50%中和的单克隆抗体1和单克隆抗体2的量(以yg表示)。CI = 1表示单克隆抗体的 加性效应，CI < 1表示单克隆抗体的协同效应，CI >表示单克隆抗体的拮抗效应。
实施例11 通过PEPSCAN-ELISA鉴别由重组人抗狂犬病病毒抗体识别的表位从狂犬病病毒毒株ERA的G蛋白的胞外结构域(狂犬病病毒毒株ERA的糖蛋 白G的完整氨基酸序列见SEQ ID NO :207，胞外结构域由氨基酸20-458组成；在EMBL 数据库中狂犬病病毒毒株ERA的糖蛋白的蛋白质id为合成15-mer线性和环 (looped)/环状(cyclic)肽，并如前所述(Slootstra et al. , 1996 ；WO 93/09872)用 信用卡(credit-card)形式的mini-PEPSCAN卡055个肽形式/卡)进行筛选。所有 的肽均在氨基末端进行乙酰化。在所有环肽中，第2位和第14位用半胱氨酸置换(乙 酰-XCXXXXXXXXXXXCX-minicard)。如果在制备的肽中除了第2位和第4位的半胱氨酸之 外还存在其它半胱氨酸，则用丙氨酸置换所述其它半胱氨酸。用标准Fmoc化学合成环肽 并用三氟酸和清除剂去保护。随后，去保护的肽在卡上与在碳酸氢铵OOmM，pH 7.9/乙腈 (1 l(v/v))中的0.5mM 1，3-双(溴甲基)苯溶液反应。将卡完全浸在溶液中，同时在该溶 液中轻轻摇动卡30-60分钟。最后，用过量的H2O彻底洗卡并在含l%SDS/0. 1% β-巯基乙 醇的PBS (pH 7. 2)的破坏缓冲液中于70°C超声30分钟，随后在H2O中再超声45分钟。人单 克隆抗体如上所述制备。在基于PEPSCAN的酶联免疫测定(ELISA)中测试这些抗体与每一 线性和环肽的结合。将含有共价连接的肽的455孔信用卡形式的聚丙烯卡与抗体(10 μ g/ ml ；在封闭溶液中稀释，该封闭溶液含有5%马血清(ν/ν)和5%卵清蛋白(w/v))保温 G°C，过夜)。洗涤后，将肽与抗人抗体过氧化物酶(稀释度1/1000)保温(1小时，25°C)， 随后，在洗涤后加入过氧化物酶底物2，2'-连氮-二-3-乙基苯并噻唑磺酸(2，2’-azino -di-3-ethylbenzthiazoline sulfonate,ABTS)和 2μ 1/ml 3% H2O20 对照(针对线性和环 肽)仅与抗人抗体过氧化物酶保温。1小时后，测量颜色生成。用C⑶相机和图像处理系统 量化ELISA的颜色生成。设备包括CCD相机和55mm镜头(Sony CCD Video CameraXC-77RR, Nikon micro-nikkor 55匪 f/2. 8 镜头)、相机适配器(SonyCamera adaptor DC-77RI )和图 像处理软件包 Optimas，版本6. 5(Media Cybernetics, Silver Spring,MD 20910, U. S. A.) Optimas在奔腾II计算机系统上运行。测试了人抗狂犬病病毒G蛋白单克隆抗体与如上所述合成的15-mer线性和环/ 环状肽的结合。当OD值等于或高于所有肽的平均OD值(每抗体)的两倍时，该肽被认为 是相关地结合一抗体。表14列出了称为CR57、CRJB和CR04-010的人单克隆抗体与狂犬病 病毒毒株ERA的糖蛋白G的胞外结构域的线性肽的结合结果。显示与各个抗体显著结合的 区域用灰色高亮显示(见表14)。抗体CR57与具有选自如下一组的氨基酸序列的线性肽结合SLKGACKLKLCGVLG(SEQ ID NO 3 14)、LKGACKLKLCGVLGL(SEQ ID NO :315)、 KGACKLKLCGVLGLR(SEQ ID NO 3 16)、GACKLKLCGVLGLRL(SEQ ID NO :317)、 ACKLKLCGVLGLRLM(SEQ ID NO 318)、CKLKLCGVLGLRLMD (SEQ ID NO :319)、 KLKLCGVLGLRLMDG(SEQ ID NO :320)、LKLCGVLGLRLMDGT(SEQ ID NO :321)禾口 KLCGVLGLRLMDGTff (SEQ ID NO :322)(见表 14)。具有氨基酸序列 GACKLKLCGVLGLRL (SEQ ID NO :317)、ACKLKLCGVLGLRLM (SEQ ID NO :318)的肽的OD值比平均值的两倍低。但是仍 请求保护这些肽，因为它们在由抗体CR57识别的抗原肽区域的邻近。与具有氨基酸序列 KLCGVLGLRLMDGTff (SEQID NO :322)的肽的结合是最显著的。抗体CR04-010与具有选自如下一组的氨基酸序列的线性肽结合 GFGKAYTIFNKTLME(SEQ ID NO 323)、FGKAYTIFNKTLMEA(SEQ ID NO :324)、 GKAYTIFNKTLMEAD (SEQ ID NO 325)、KAYTIFNKTLMEADA (SEQ ID NO :326)、 AYTIFNKTLMEADAH(SEQ ID NO 327)、YTIFNKTLMEADAHY(SEQ ID NO :328)、 TIFNKTLMEADAHYK (SEQ ID NO 329)、IFNKTLMEADAHYKS (SEQ ID NO :330)禾口 FNKTLMEADAHYKSV (SEQ ID NO :331)。具有氨基酸序列 AYTIFNKTLMEADAH(SEQ ID NO: 327)、YTIFNKTLMEADAHY (SEQ ID NO 328)的肽的OD值比平均值的两倍低。但是仍 请求保护这些肽，因为它们在由抗体CR04-010识别的抗原肽区域的邻近。与具有氨 基酸序列 TIFNKTLMEADAHYK(SEQID NO :329)、IFNKTLMEADAHYKS(SEQ ID NO 330)和 FNKTLMEADAHYKSV (SEQ ID NO 331)的肽的结合是最显著的。CRJB和称为CR04-040、CR04-098和CR04-103的抗体(数据未示出)不识别线性
抗原肽的区域。任何上述肽或其部分均代表狂犬病病毒中和表位的良好候选者，并且可以形成疫 苗的基础或者形成产生中和抗体以治疗和/或预防狂犬病病毒感染的基础。基于它们在PEPSCAN 中的高反应性，SLKGACKLKLCGVLGLRLMDGTff (SEQ ID NO :332) 和GFGKAYTIFNKTLMEADAHYKSV(SEQ ID NO :333)是特别感兴趣的糖蛋白区域。从上述PEPSCAN数据可进一步推出称为CR57和CR04-010的人单克隆抗体与狂犬 病病毒G蛋白的不同区域结合，表明它们识别非竞争性表位。实施例12用体外中和分析(修改的RFFIT)确定抗狂犬病G蛋白IgG的中和效力在如实施例1所述的修改的RFFIT中确定每种所产生的人单克隆抗体的中和效 力。16种IgG中和狂犬病毒株CVS-Il的效力高于1000IU/mg，而仅有两种IgG的效力低于 2IU/mg (见表15)。16种抗体中有8种比瞬时产生的CR-57的效力强，提示在狂犬病病毒 的暴露后预防中比CR-57有更高的效率。瞬时产生的CR-57的效力约为3800IU/mg蛋白质 (见表1和表1 ，而稳定产生的CR-57展示出效力为M00IU/mg蛋白质(数据未示出)。 令人感兴趣地，所鉴别的大多数中和人单克隆抗体含有可变重链3-30种系基因(见表9)。基于抗体对狂犬病病毒的亲和性(数据未示出)和在修改的RFFIT分析中的抗 体的100%终点稀释度(数据未示出)，选择一组6个独特的IgG，即CR04-010、CR04-040、 CR04-098、CR04-103、CR04-104 和 CR04-144 进行进一步开发。在这一组中，抗体 CR04-098 是特别令人感兴趣的，因为其显示出最高的效力，即约7300IU/mg蛋白质(见表15)。对于 稳定产生的CR04-098也发现类似的效力(数据未示出)。
实施例13用抗狂犬病病毒IgG体外中和E57逃逸病毒为进一步鉴定新的人单克隆抗狂犬病抗体，在如上所述的修改的RFFIT中测试这 些IgG对E57逃逸病毒的中和活性。大多数抗狂犬病病毒IgG有对全部6种E57逃逸病毒 的良好中和活性(见表16)。相反，CR04-008、CR04-018和CR04-126分别不中和6/6,2/6 和3/6E57逃逸病毒。不中和意味着在1 100抗体稀释度未达到50%终点(endpoint)。 CR04-021、CR04-108、CR04-120、CR04-125和CR04-164显示出对一些逃逸病毒的中和活性 显著下降。这提示这些抗体的表位在E57逃逸病毒糖蛋白中已受到直接或间接影响。基 于以上，一些抗狂犬病病毒IgG可能与用于暴露后预防治疗的抗狂犬病混合物中的CR-57 相容。特别地，如上鉴别的一组6个独特的IgG,即抗体CR04-010、CR04-040、CR04-098、 CR04-103、CR04-104和CR04-144，展示了针对E57逃逸病毒的良好中和效力，提示这些抗体 识别的表位未被CR-57诱导的氨基酸突变影响。抗体CR04-098似乎是最有前途的，因为它 对每种逃逸病毒均具有高于3000IU/mg的效力。实施例14抗狂犬病抗体CR-57和CR04-098的表位识别为了证实称为CR-57和CR04-098的人单克隆抗体识别非重叠的非竞争表位，基本 上根据针对CR57的逃逸病毒所描述的那样(见实施例1)产生称为CR04-098的人单克隆 抗体的逃逸病毒。简单地说，通过免疫荧光记录每孔转化灶数，选择优选地含有1个转化灶 的孔的培养基进行病毒扩增。从1个单转化灶产生除E98-2Q个转化灶)和E98-M4个转 化灶)之外的所有的E98逃逸病毒。如果中和指数<2. 51og，则病毒被限定为逃逸变体。 中和指数如下确定从用病毒单独感染的BSR或MNA细胞培养物中产生的感染性病毒颗粒 数/ml中减去用病毒加上单克隆抗体(约4IU/ml)感染的BSR细胞培养物中产生的感染性 颗粒数/ml([(log在单克隆抗体不存在时的转化灶形成单位/ml病毒)减去(log在单克 隆抗体存在时的ffu/ml病毒)])。指数低于2. 51og被认为是逃逸的证据。为进一步研究与CR-57相比，CR04-098与不同的非重叠非竞争性表位结合，在如 上所述的修改的RFFIT分析中针对E98逃逸病毒测试CR-57。如表17所示，CR-57针对全部 5种E98逃逸病毒均具有良好的中和活性。另外，测试了抗体CR04-010和CR04-144对E98 逃逸病毒的中和活性。两种抗体均不中和E98逃逸病毒(数据未示出)，提示由两种抗体识 别的表位受抗体CR04-098所诱导的氨基酸突变的直接或间接影响。测试了抗体CR04-018 和CR04-U6对E98逃逸病毒中的一种即E98-4的中和活性。CR04-018能够中和该逃逸病 毒，而CR04-U6对该逃逸病毒仅有弱的中和效力。这提示由CR04-018识别的表位不受抗 体 CR04-098 所诱导的突变的影响。另外，抗体 CR04-010、CR04-038、CR04-040、CR04-073、 CR04-103、CR04-104、CR04-108、CR04-120、CR04-125、CR04-164 不中和 E98-4，提示它们与 CR04-098识别相同的表位(数据未示出)。为了鉴别每种E98逃逸病毒的狂犬病糖蛋白中可能的突变，根据以前针对E57和 EJB逃逸病毒所述的那样确定该糖蛋白开放读框(ORF)的核苷酸序列。所有的E98逃逸病 毒均显示在狂犬病糖蛋白的第336位氨基酸有N变为D的突变(见图8)。这一糖蛋白区域 已被定义为抗原位点III，其包含第330-338位氨基酸(不计信号肽的编号)。相反，CR-57 识别位于第2沈-231位氨基酸(不计信号肽的编号)的表位，其与抗原位点I重叠。除了N336D突变外，称为E98-5的E98逃逸病毒显示在狂犬病糖蛋白第3M位氨基酸的H变为Q 的突变(CAT变为CAG的密码子改变)(数据未示出)。另外，对CR57与携带突变的CR57表位的肽结合(如在E57逃逸病毒中观察到的) 的pepscan分析确实示出CR57的相互作用被破坏(数据未示出)。令人注目的是，流式细 胞术测得CR04-098仍能够与PER.C6 细胞上表达的突变糖蛋白(包含N336D突变)结合 (数据未示出)，尽管含有这一突变的病毒不再被中和。另外，用BIAcOre3000TM分析系统经表面等离子共振分析进行了表位作图研究和 亲和性排序研究。用胺偶联技术将纯化的狂犬病糖蛋白(ERA毒株)作为配体固定化在研究 级 CM5 4 流路(flow channel, Fe)传感器芯片(Biacore AB, Sweden)上。排序是在 25°C 用HBS-EP (Biacore AB, Sweden)作为流动缓冲液而进行。将50 μ 1每种抗体以20 μ 1/min 的恒定流速注入。然后，加入流动缓冲液750秒，随后用5 μ 12Μ NaOH,5 μ 1 45mM HCl和 5μ1 2mM NaOH再生CM5芯片。将以共振单位(RU)表示的共振信号作为时间的函数作图， 确定分别作为缔合和解离测量标准的RU的增加和减少，并用作抗体的排序。通过表面等离 子共振测得的CR57和CR04-098的实际KD值分别是2. 4nM和4. 5nM。表位作图研究进一 步证实CR57和CR04-098与狂犬病糖蛋白上的不同表位结合。注入CR57产生了 58RU的 应答(数据未示出)。在注入CR04-098后，获得了应答水平的额外增加(MRU)，提示针对 CR04-098的结合位点未被占据(数据未示出)。当采用相反顺序时，观察到类似结果，表 明无论注入顺序如何，每一抗体均达到类似RU水平(数据未示出)。这些结果进一步证实 CR57和CR04-098可同时结合和识别狂犬病病毒糖蛋白上的不同表位。总之，上述数据进一步证实抗体CR-57和CR04-098识别不同的非重叠表位，即分 别为抗原位点I和III中的表位。这些数据与ELISA/FACS竞争数据非常符合，该竞争数据 表明CR-57和CR04-098不竞争结合ERA G以及抗体CR04-098对所有E57逃逸病毒的良好 中和活性。基于这些结果以及将狂犬病病毒体外暴露于CR57和CR04-098的组合(在4IU/ ml每种抗体存在下的选择)不产生逃逸病毒(数据未示出)这一事实，得出如下结论抗 体CR-57和CR04-098识别非重叠的非竞争性表位，并且可以被有利地用于抗狂犬病病毒抗 体混合物中以进行暴露后预防治疗。实施例15评估由CR57和CR04-098识别的表位的保守性将CR-57的最小结合区(SEQ ID NO :332内的氨基酸KLCGVL,由PEPSCAN和丙氨 酸扫描技术确定的由CR57识别的狂犬病病毒糖蛋白区域)与2 个基因型1狂犬病病毒 分离株的核苷酸序列进行序列比对以评估该表位的保守性(见表18)。样品组含有人分离 株、蝙蝠分离株和来自犬类的或来自最易受患有狂犬病的犬类攻击的家畜的分离株。在该 最小结合区内每一位置的氨基酸的频率分析揭示了组成该表位的关键残基是高度保守的。 在第1位的赖氨酸在99. 6%的分离株中是保守的，而仅在1/2 分离株中观察到保守的K >R突变。第2位和第3位(L和C)是完全保守的。据信中心的半胱氨酸残基在结构上参 与糖蛋白折叠并且在所有狂犬病属病毒中是保守的(参见Badrane and TordO，2001)。第 4位的甘氨酸在98. 7%的分离株中是保守的，而在3/2 分离株中观察到朝向带电荷氨基 酸的突变(在1/229中有G > R ；在2/229中有G > E)。第5位也是保守的，只在一个分离 株中有例外，在该分离株中观察到保守的V> I突变。在由丙氨酸置换扫描确定为非关键残基的第6位，在街毒分离株中观察到显著的异质性在70. 7%毒株中为。在沈.7%毒株 中为P，在2. 6%毒株中为S。加在一起，预计约99%的可以遇到的狂犬病病毒被CR-57抗 体识别。对这2 个病毒分离株中的123个分析了 CR-57和CR04-098表位中突变的存在。 这123个街毒分离株中无一在两个表位中含有突变。在E98逃逸病毒中观察到的N > D突变 仅在5个病毒分离株中存在。这些病毒地域上是独立的并分离自非洲的动物(参见图9的 系统发生树；这 5 个病毒分离株即 AF325483、AF325482、AF325481、AF325480 和 AF325485， 以粗体示出)。糖蛋白序列的系统发生分析揭示具有突变的CR57表位的狂犬病病毒仅与携 带突变的CR04-098表位的狂犬病病毒远缘相关。因此，遇到对CR-57和CR04-098的混合 物所致的中和作用有抗性的狂犬病病毒的可能性基本上是不存在的。表1 :CR_57和CR-JB对野生型和逃逸病毒的中和效力
病毒效力 CR-57 (IU/mg)效力 CR-JB (IU/mg)病毐效力 CR-57 (IU/mg)效力 CR-JB (IU/mg)CVS-Il3797605CVS-Il3797605Ε57Α20<0.2EJB2B0.0040.6Ε57Α30419EJB2C<0.0042Ε57Β1093EJB2D<0.0043Ε57Β20<0.3EJB2E<0.2<0.3Ε57Β30419EJB2F<0.063E57C3031EJB3F<0.040.06表2 人λ链可变区引物(有义)
权利要求
1.一种包含至少两种中和狂犬病病毒的结合分子的药物组合物，所述结合分子能与狂 犬病病毒的不同的非竞争表位反应，其中第一种中和狂犬病病毒的结合分子能与位于狂犬 病病毒G蛋白的抗原位点I中的表位反应，第二种中和狂犬病病毒的结合分子能与位于狂 犬病病毒G蛋白的抗原位点III中的表位反应。
2.一种包含两种中和狂犬病病毒的结合分子的药物组合物，所述结合分子能结合狂犬 病病毒的不同的非竞争表位，所述组合物包含第一种中和狂犬病病毒的结合分子，其能结合位于狂犬病病毒G蛋白的抗原位点I中 的表位，所述第一种狂犬病病毒中和抗体包含重链可变区，其包含SEQ ID NO :273的氨基酸序列或者与其具有至少80%同源性的序 列，和轻链可变区，其包含SEQ ID NO :275的氨基酸序列或者与其具有至少80%同源性的序 列，和第二种中和狂犬病病毒的结合分子，其能结合位于狂犬病病毒G蛋白的抗原位点III 中的表位。
3.权利要求2的药物组合物，其中第二种中和狂犬病病毒的结合分子包含CDR3区域， 该区域包含选自 SEQ ID NO 4, SEQ ID NO: 10、SEQ ID NO: 14、SEQ ID NO: 15、SEQ ID NO: 16和SEQ ID NO :22的氨基酸序列。
4.权利要求2的药物组合物，其中第二种中和狂犬病病毒的结合分子包含 包含SEQ ID NO 29的重链可变区和包含SEQ ID NO 53的轻链可变区，或者 包含SEQ ID NO 35的重链可变区和包含SEQ ID NO 59的轻链可变区，或者 包含SEQ ID NO 39的重链可变区和包含SEQ ID NO 63的轻链可变区，或者 包含SEQ ID NO 40的重链可变区和包含SEQ ID NO 64的轻链可变区，或者 包含SEQ ID NO 41的重链可变区和包含SEQ ID NO 65的轻链可变区，或者 包含SEQ ID NO 47的重链可变区和包含SEQ ID NO 71的轻链可变区。
5.权利要求1-4任一项的药物组合物，其中第一种狂犬病病毒结合分子是IgG以及第 二种狂犬病病毒结合分子是IgG。
6.一种药物组合物，其包含两种重组人单克隆抗体，其中通过等电聚焦测量，所述重组 人单克隆抗体具有差异小于1. 5pl单位的等电点。
7.权利要求6的药物组合物，其中所述等电点的差异小于1.2pl单位。
8.权利要求6的药物组合物，其中两种重组人单克隆抗体均能中和感染因子。
9.权利要求8的药物组合物，其中两种重组人单克隆抗体均能中和狂犬病病毒。
全文摘要
本发明提供了特异性结合狂犬病病毒并且能中和该病毒的结合分子。本发明进一步提供了编码该结合分子的核酸分子、包含该结合分子的组合物及鉴别或者产生该结合分子的方法。所述结合分子可用于得自狂犬病病毒的疾病的诊断、预防和/或治疗。优选地，其可用于狂犬病的暴露后预防。
文档编号G01N33/569GK102139106SQ20111007140
公开日2011年8月3日 申请日期2005年5月26日 优先权日2004年5月27日
发明者亚历山大·贝特霍尔德·亨德里克·巴克, 威廉·埃格伯特·马里森, 科内利斯·阿德里安·德克吕夫, 罗伯特·阿耶恩·克拉默 申请人:克鲁塞尔荷兰公司